Classificazione-virus, Slide di Microbiologia

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Classificazione dei virus

Criteri di classificazione

• Natura dell’acido nucleico nel virione : RNA o DNA •

Simmetria del capside: icosaedrico, elicoidale o complesso

Presenza o assenza di un involucro

Architettura del genoma: ds, ss, frammentato, dimensione

• Ospiti: animali, piante, batteri. • Omologia di sequenza • Strategie di replicazione

International Committee onTaxonomy of Viruses

componenti virali:

Proteine virali:

Sono di tipo: a. strutturale

, costituenti del capside, o

dell’envelope (emoagglutinine, neuroaminidasi, ecc); b. funzionali

, di tipo

enzimatico, che catalizzano le funzioni enzimatiche indispensabili proprie delvirus (polimerasi, proteasi, ecc); c. in grado di alterare la funzionalita’

della

cellula ospite, bloccandone le funzioni e permettendo lo “shift” ribosomialedalla sintesi di proteine cellulari a quella di proteine virali. Lipidi:

Sono tutti di derivazione cellulare, situati nell’envelope, e

rappresentano, in alcuni casi (togavirus, orthomyxovirus) il 20-40% del pesototale del virus. Altre sostanze:

Rame, FAD e biotina possono essere presenti nei poxvirus

(virus complessi).

Genoma

• Tutti i virus contengono

un solo tipo

di acido nucleico.

• Quelli a RNA, in particolare, rappresentano un’eccezione in natura, inquanto la loro informazione genetica non e’ contenuta nel DNA.- A seconda del tipo virale, il genoma codifica per un numero diverso diproteine, da un minimo di 3 a un massimo di alcune centinaia.- A seconda dei vari tipi di virus, il genoma (DNA o RNA) puo’ essere asingolo o doppio filamento, lineare o segmentato in varie porzioni (es.virus influenzale) ognuna codificante per una proteina.- La grandezza del genoma dà la misura della complessità del virus edella sua replicazione (più evidente nei virus a DNA rispetto ai virus aRNA).

Virus a DNA: Deossiribovirus Normalmente hanno un DNA a doppia elica confilamento unico e lineare. Alcuni

virus

Papovavirus

ed

Hepadnavirus

contengono DNA circolare e altri (

Parvovirus

) hanno

un DNA monocatenario.

Nomenclatura: alcune regole basilari

Ordine

( -

virales

)

Famiglia

( -

viridae

)

Sottofamiglia

( -

virinae

)

Genere

( -

virus

)

Specie

(

common names

)

Schemi di classificazione per virus animali

Classificazione basata sulla sequenza

Basata sulla % di identità delle sequenzegenomiche

Consente la costruzione di un albero filogenetico

Consente una comprensione migliore dellarelazione filogenetica tra gli ordini inferiori

Albero filogenetico contenente le sequenze di 118 tipi di papillomavirus

Il sistema di classificazione Baltimore

Basato sulla natura e polarità dei genomi virali

Descrive le relazioni obbligatorie tra il genoma

virale e il suo mRNA

Il sistema di classificazione Baltimore

Class I ds DNA

Class II ss DNA

Class III

ds RNA (+/-)

Class IV

ss RNA (+)

Class V

ss RNA (-)

Class VI

ss RNA (+)

Parvovirus

(B19)

Adenovirus

Herpesvirus Papovavirus

Poxvirus

Reovirus

Picornavirus

Flavivirus Togavirus

Retrovirus

Orthomyxovirus

Paramyxovirus

Rhabdovirus