Proteine
Funzioni
Dominio
porzione di proteina a cui è associata una
funzione
- funzioni strutturali
- attività catalizzatrice
- trasporto
- difesa immunitaria
- proteine ormonali
dipende dalla struttura
Struttura
dipende dalla sequenza amminoacidica
primaria
sequenza degli amminoacidi legati tra loro
attraverso il legame peptidico
secondaria
dipende dalle caratteristiche chimico-fisiche
del legame peptidico
alfa-elica
- destrorsa o sinistrorsa
- formata da L-amminoacidi
- passo= 0,54 nm
- O carbonilico è unito mediante legame
idrogeno con un H ammidico che si trova a 3
amminoacidi di distanza
beta-foglietto
- catene quasi distese
- struttura pieghettata a causa degli angoli di
legame
- L'O carbonilico e l'H ammidico sporgono
rispetto all'asse longitudinale
- Tra O carbonilico e H ammidico di due o più
catene adiacenti si instaurano legami
idrogeno
- Le catene laterali dei residui sporgono al di
sopra e al di sotto del piano del foglietto
terziaria
origina dal ripiegamento nello spazio della
catena polipeptidica assumendo una
struttura tridimensionale dopo la struttura primaria e secondaria
appare come un groviglio
predeterminata e dipende dalla struttura
primaria
Stabilizzata da legami tra catene laterali di
residui ammidici vicini
quaternaria
formata da subunità
NO legami covalenti
SI legami tiolici, idrogeno, ionici e interazioni
idrofobiche
regolazione allosterica
una subunità può regolare l'azione delle altre
subunità modificandone la struttura
Ripiegatura -folding-
processo non casuale ma grazie a delle
forzature dall'esterno
paradosso di Levinthal
- 1 fase: in piccole zone si assume una
struttura secondaria
- 2 fase: si ha un crollo della struttura (
collasso idrofobico)
- 3 fase: gli ammminoacidi idrofobici tendono
a portarsi all'interno
- 4 fase: si forma il globulo fuso, cioè una
proteina ma più rilassata
- 5 fase: viene espulsa l'alcqua
- 6 fase: si forma la proteina
la proteina viene portata verso uno stato in
cui si ha la minore energia libera
Proteine strutturate
funzione enzimatica
Proteine destrutturate
funzione regolatrice
Tipo di struttura che fa variare anche la
funzione
Dipendono una dall'altra
