Il linguaggio
nucleotidico
Dobbiamo effettuare un passaggio da un
codice a 4 lettere (nucleotidi) ad un codice
a 20 lettere (amminoacidi)
20 lettereARNDC etcProteine
4 lettereCAGURNA
4 lettereCAGTDNA
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Il codice genetico: da nucleotidi a amminoacidi - Prof. Potenza, Dispense di Biologia Animale
Come il codice genetico passa da un linguaggio a quattro lettere (nucleotidi) a un linguaggio a venticinque lettere (amminoacidi). Viene discusso il processo di traduzione e la degenerazione del codice genetico.
Tipologia: Dispense
2018/2019
1 / 12
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Scarica Il codice genetico: da nucleotidi a amminoacidi - Prof. Potenza e più Dispense in PDF di Biologia Animale solo su Docsity!
Il linguaggio
nucleotidico
Dobbiamo effettuare un passaggio da un
codice a 4 lettere (nucleotidi) ad un codice
a 20 lettere (amminoacidi)
Proteine ARNDC etc 20 lettere
RNA CAGU 4 lettere
DNA CAGT 4 lettere
Ma come si fa a passare dal
“linguaggio” degli acidi nucleici (che
utilizza 4 “lettere”)…
… al “linguaggio” delle proteine (che
utilizza 20 “lettere”)?
Come si passa dai nucleotidi agli amminoacidi?
3
2
1
N Possibilità
o
. nucleotidi/a.a.
Minimo
codice
proponibile
SUGAR-PHOSPHATE BACKBONE
B A S E S
H P O O HO O O CH 2 N^ NH^2 NH N N OH H P O O HO O O CH 2 NH 2 N N N N H P O OH HO O O CH 2 NH 2 N N N N O
Codoni
Guanina Guanina
Adenina Adenina
Adenina Adenina
Arginina
Per le sue caratteristiche il codice genetico si definisce:
- (^) UNIVERSALE: è lo stesso in tutti gli organismi (si deve essere stabilito in uno stadio molto precoce dell’evoluzione. Si sono verificati cambiamenti nel codice nel corso dell'evoluzione dei mitocondri. Tali cambiamenti sono rari nei genomi nucleari. Eccezioni DNA mitocondriale, protozoi ciliati e alcune alghe unicellulari)
- (^) DEGENERATO: 1 aa più codoni
S E C O N D B A S E
A
GGU GGC GGA GGG _Gly_* AGU AGC AGA AGG Arg
G
CGU CGC CGA CGG Arg
G
UGU UGC UGA UGG
C
GAU GAC GAA GAG AAU AAC AAA AAG Glu CAU CAC CAA CAG
A
UAU UAC UAA UAG Stop Tyr GUU GUC GUA GUG Val AUU AUC AUA AUG start Ile CUU CUC CUA CUG Leu
U
UUU UUC UUA UUG Leu Phe Met/ GCU GCC GCA GCG Ala ACU ACC ACA ACG Thr CCU CCC CCA CCG Pro
C
UCU UCC UCA UCG Ser U C A G
U
U C A G U C A G U C A G Gln † His Trp
Cys T
H I R D B A S E
F I R S T B A S E
Il Codice Genetico Asp Lys Asn † Stop Ser Neutral Non-polar Polar Basic Acidic †Have amine groups *Listed as non-polar by some texts
Ogni sequenza si presta ad essere tradotta in tre
griglie di lettura differenti, a seconda del punto in cui
inizia il processo di decodificazione sulla molecola.
In tutti i casi sarà soltanto una delle 3 griglie a dar
vita ad una proteina funzionale.
odoni dell’mRNA non riconoscono direttamente gli amminoacidi,
istono delle molecole adattatrici.
FENOMENO DELL’OSCILLAZIONE DELLA TERZA BASEFENOMENO DELL’OSCILLAZIONE DELLA TERZA BASE
- (^) La terza base nel riconoscimento codone-anticodone è meno influente nello specificare l’aa.
- (^) Le regole che governano il riconoscimento codone-anticodone sono riassunte nella teoria dell’oscilllazione della terza base, secondo la quale l’appaiamento seguendo le regole usuali è rispettato per le prime due posizioni del codone (G-C e A-U), ma non per la terza posizione. I riquadri contengono gruppi di codoni con uguale significato, per via della degenerazione del codice in terza base.