TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI
Vi sono delle differenze con la trascrizione nei procarioti:
• Vi sono più polimerasi, mentre i batteri ne hanno una sola;
• Sono necessari più fattori d’inizio, che vengono detti
fattori generali di trascrizione GTF.
Si definisce core del promotore il gruppo minimo di sequenze
necessarie per un inizio di trascrizione da parte della pol II; in
genere il core del promotore è lungo circa 40-60 nucleotidi. Il
promotore possiede alcuni elementi, che sono:
• BRE, che viene riconosciuto da TFIIB;
• L’elemento TATA, la TATA-BOX;
• L’iniziatore (Inr);
• Elementi a valle del promotore (DPE, DCE e MTE).
Ci sono anche altri elementi, che costituiscono le sequenze
regolatrici; queste sequenze includono: elementi del core del
promotore, sequenze attivatrici a monte, enhancer e silencers.
Tutte queste sequenze di DNA legano le proteine regolatrici,
attivatori o repressori che aiutano o inibiscono la trascrizione.
I fattori di trascrizione aiutano la polimerasi a legarsi al
promotore e a separare il DNA: il gruppo completo dei fattori
generali di trascrizione e della polimerasi, legati insieme al
promotore viene detto complesso di pre-inizio. Il complesso di
pre-inizio comincia a formarsi a livello della TATA-box, in quanto
questa sequenza è l’elemento riconosciuto dal fattore generale
della trascrizione detto TFIID. TFIID è un complesso costituito da
molte subunità: il componente di TFIID che lega la TATA-box è
chiamato TBP. TBF, una volta legata al DNA, fa allargare il solco
minore della TATA-box fino ad assumere una conformazione quasi
piatta e inoltre piega il DNA di circa 80°.
Le altre subunità del complesso sono dette TAF, e si legano agli
elementi del promotore, l’iniziatore (Inr) e l’elemento a valle
del promotore (DPE).
In seguito al legame con il DNA, il complesso TBP-DNA risultante
fornisce una piattaforma per il reclutamento di altri fattori
generali della trascrizione e della polimerasi. Questi altri
fattori si associano nel seguente ordine al promotore:
1. TFIIA;
2. TFIIB, entra nel complesso di pre-inizio dopo TBP e sembra
far da ponte tra TBP legata alla tata-box e la polimerasi;
3. TFIIF assieme alla polimerasi;
4. TFIIE;
5. TFIIH.
La formazione del complesso di pre-inizio è seguita dalla
dissociazione dei due filamenti del promotore, che richiede
l’idrolisi dell’ATP ed è mediata da TFIIH, in quanto questo
fattore d’inizio ha due subunità, una ATPasica ed una chinasica:
quindi, fosforila la coda dell’RNApolII permettendo il distacco
del promotore.
