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Appunti su PCR ed Elettroforesi
Tipologia: Appunti
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-Elettroforesi -PCR (reazione polimeratica a catena) Elettroforesi: sul gel si formano delle tacche/bande (hanno la forma del pozzetto), la corrente trascina con se i campioni di DNA, le cariche sono in grado di muoversi in quanto campo elettrico. Il DNA per ogni nucleotide ha una carica negativa. Queste cariche negative si muovano verso il polo opposto, questo deve essere messo lontano dai pozzetti altrimenti i campioni escono dalla parte sbagliata. Per creare il campo elettrico il gel posso farlo con l’acqua ma non posso metterlo a bagno nell’acqua, devo metterlo in una soluzione tampone (PH stabile). Serve che la soluzione contenga degli elettroliti (molecole che si dividono facilmente in parti). Elettroforesi: -Si basa sul fatto che il DNA che è carico negativamente, messo all’interno di un campo elettrico, migra verso il polo positivo (elettrodo positivo). Il DNA viene inserito all’interno di un gel di solito fatto con agarosio (non è l’unico tipo di Gel), l’agarosio è un polisaccaride. I frammenti di DNA più grandi restano più intralciati dalle maglie del gel e restano più vicini ai pozzetti durante la corsa. I frammenti più piccoli rimangono meno intralciati dalle meno del gel e quindi si allontano di più dai pozzetti. Alla fine i frammenti rimangono ordinati sul gel in base al loro peso molecolare. I gel più utilizzati per lo studio del DNA, hanno una quantità di agarosio che varia dallo 0,8% al 2%. PCR: tecnica che viene utilizzata per amplificare il DNA (crearne tante copie tutte uguali), non richiede l’uso di microrganismi, ha portato il premio NOBEL. Creare tante copie per poterlo studiare meglio o anche per poterlo vedere ad occhio nudo. La PCR è una duplicazione fatta in laboratorio all’interno di una provetta, il principio è quello della duplicazione del DNA. Servono diversi enzimi, uno in particolare è quello che crea il filamento nuovo, DNA polimerasi. In questo caso svolgere il dna e sperare le catene sono funzioni che vengono svolte non da enzimi ma da cambi di temperatura. Ad ogni ciclo il numero di molecole di DNA raddoppia. DNA polimerasi ha bisogno del primer (doppio filamento). Nella PCR vengono utilizzati da primer di DNA, La DNA polimerasi continua ad attaccarsi al primer di DNA. Differenza: solo un enzima (DNA polimerasi, i primer sono piccoli frammenti di DNA).
-Vengono sperate le due catene di partenza con il calore -Si legano ai primer -Si estende la catena a partire dal primer -Parte il ciclo, al secondo giro raddoppia ecc ecc Di solito una PCR dura 20/30 cicli. Ad un certo punto non serve andare più avanti perché la DNA polimerasi si rovina. I nucleotidi ed i primer finiscono. OGNI CICLO ha tre passaggi di temperatura: