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Técnicas de Análisis Bioquímico I: Detección y Cantificación - Absorción UV-Visible - Prof, Apuntes de Bioquímica

Documento que presenta diferentes ecuaciones y cálculos relacionados con la absorción uv-visible en el contexto de técnicas de análisis bioquímico. Contiene información sobre la determinación de concentraciones de diferentes moléculas y la relación entre absorbancia y ph.

Tipo: Apuntes

2012/2013

Subido el 09/12/2013

miguel-angel-s-10
miguel-angel-s-10 🇪🇸

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bg1
TÉCNICAS DE ANÁLISIS BIOQUÍMICO I CURSO 2011-12
DETECCIÓN Y CUANTIFICACIÓN
Absorción UV-Visible
1.- A280 = 0.13 = E 0.1%, 280, 1 cm x C (mg/mL) x l (cm)
E 0.1%, 280, 1 cm = 0.75 C = 0.173 mg/mL
M = 60000 Da C = 2.89 x 10-6 M = 2.89 M
2.- 280 = 25000 M-1cm-1 M = 23000
E 0.1%, 280, 1 cm = 1.087
3.- C = 1.8 nmol Lys/50 L = 36 nmol Lys/mL = 36/15 nmol proteína/mL = 2.4 x 10-6 M
A280 = 0.344 = 280 x C (M) x l (cm) = 280 x 2.4 x 10-6 x 1 280 = 0.143 x 106 M-1cm-1
4.- C = 2.940/20 mg/mL = 0.147 mg/mL = 0.147/48000 M = 3.0625 x 10-6 M
A280 = 0.437 = 280 x C x l = 280 x 3.0625 x 10-6 M x 1 280 = 0.143 x 106 M-1cm-1
A280 = 0.437 = E(0.1%, 280 nm, 1 cm) x C x l = E(0.1%, 280 nm, 1 cm) x 0.147 mg/mL x 1
E(0.1%, 280 nm, 1 cm) = 2.973
A280 = 0.233 = E(0.1%, 280 nm, 1 cm) x C x l = 2.973 x C x 1 C = 0.78 mg/mL
5.- Al representar los valores de absorbancia a 295
nm vs. pH se obtiene la gráfica adjunta. En ella
parece apreciarse que hay dos poblaciones de Tyr.
La primera tendría un pK de alrededor de 10, y
representaría cerca del 60% de las Tyr tituladas,
mientras que la segunda lo tendría alrededor de 11.5.
El valor final de A295 es 0.345, y se puede utilizar
para calcular el número total de Tyr tituladas:
A295 = 295 x C x l = 0.345 = 1500 (M-1cm-1)x C x 1
C = 2.3 x 10-4 M (Tyr tituladas)
Cproteína = 5 x 3.0625 x 10-6 M = 0.153125 x 10-4 M
nº Tyr = 2.3 x 10-4/0.153125 x 10-4 = 15
nº Total de Tyr tituladas = 15
6.- CTrp = (A288/3103)-(A280/10318) = 0.288/3103 – 0.894/10318 = 9.28 x 10-5 -8.66 x 10-5 M
CTrp = 0.62 x 10-5 M Cproteína = 0.3/48000 = 6.25 x 10-6 M nº Trp = 1
CTyr/CTrp = (0.592 A294.4 - 0.263 A280.0)/ (0.263 A280.0 - 0.170 A294.4) = (0.592 x 0.313 - 0.263 x 0.234)/
(0.263 x 0.234 – 0.170 x 0.313) = (0.1853 – 0.0615)/(0.0615 – 0.0532) = 0.1238/0.0083 = 14.9
valor que era el esperado, pues la proteína tendría un total de 15 Tyr
7.- En la gráfica se aprecia el momento en el que se
añade la disolución de enzima y se agita la mezcla.
El valor inicial de A340 es 0.440.
A340 = 0.440 = 340 x C x l = 6200 x C x 1
C= 7.097 x 10-5 M
A340/min = 0.192 (en tramo lineal)
A340/min = 0.192 = 340 x C/min x l
C/min = 0.192/6200 = 3.097 x 10-5 M/min
Vensayo = 2.001 mL
6.197 x 10-2 mol/min transformados
6.197 x 10-2 UI/1 L ~ 61.97 UI/mL
C = 0.01 mg/mL
Actividad específica = 61.97/0.01 = 6197 UI/mg
pH
8 9 10 11 12 13
A295
0,0
0,1
0,2
0,3
t (segundo)
0 20 40 60 80 100 120 140 160
A
340
0,0
0,1
0,2
0,3
0,4
pf2

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¡Descarga Técnicas de Análisis Bioquímico I: Detección y Cantificación - Absorción UV-Visible - Prof y más Apuntes en PDF de Bioquímica solo en Docsity!

TÉCNICAS DE ANÁLISIS BIOQUÍMICO I CURSO 2011-

DETECCIÓN Y CUANTIFICACIÓN Absorción UV-Visible

1.- A 280 = 0.13 = E (^) 0.1%, 280, 1 cm x C (mg/mL) x l (cm) E (^) 0.1%, 280, 1 cm = 0.75 C = 0.173 mg/mL M = 60000 Da C = 2.89 x 10 -6^ M = 2.89M

2.-  280 = 25000 M-1^ cm -1^ M = 23000

E (^) 0.1%, 280, 1 cm = 1.

3.- C = 1.8 nmol Lys/50 L = 36 nmol Lys/mL = 36/15 nmol proteína/mL = 2.4 x 10-6^ M

A 280 = 0.344 =  280 x C (M) x l (cm) =  280 x 2.4 x 10 -6^ x 1  280 = 0.143 x 10^6 M -1^ cm -

4.- C = 2.940/20 mg/mL = 0.147 mg/mL = 0.147/48000 M = 3.0625 x 10 -6^ M

A 280 = 0.437 =  280 x C x l =  280 x 3.0625 x 10 -6^ M x 1  280 = 0.143 x 10 6 M -1^ cm -

A 280 = 0.437 = E(0.1%, 280 nm, 1 cm) x C x l = E(0.1%, 280 nm, 1 cm) x 0.147 mg/mL x 1 E(0.1%, 280 nm, 1 cm) = 2. A 280 = 0.233 = E(0.1%, 280 nm, 1 cm) x C x l = 2.973 x C x 1 C = 0.78 mg/mL

5.- Al representar los valores de absorbancia a 295 nm vs. pH se obtiene la gráfica adjunta. En ella parece apreciarse que hay dos poblaciones de Tyr. La primera tendría un pK de alrededor de 10, y representaría cerca del 60% de las Tyr tituladas, mientras que la segunda lo tendría alrededor de 11.5. El valor final de A 295 es 0.345, y se puede utilizar para calcular el número total de Tyr tituladas:

A 295 =  295 x C x l = 0.345 = 1500 (M -1^ cm -1^ )x C x 1

C = 2.3 x 10 -4^ M (Tyr tituladas) Cproteína = 5 x 3.0625 x 10-6^ M = 0.153125 x 10-4^ M nº Tyr = 2.3 x 10-4^ /0.153125 x 10 -4^ = 15 nº Total de Tyr tituladas = 15

6.- CTrp = (A 288 /3103)-(A 280 /10318) = 0.288/3103 – 0.894/10318 = 9.28 x 10 -5^ -8.66 x 10 -5^ M CTrp = 0.62 x 10-5 M^ Cproteína = 0.3/48000 = 6.25 x 10 -6^ M nº Trp = 1 CTyr/CTrp = (0.592 A294.4 - 0.263 A280.0 )/ (0.263 A280.0 - 0.170 A294.4 ) = (0.592 x 0.313 - 0.263 x 0.234)/ (0.263 x 0.234 – 0.170 x 0.313) = (0.1853 – 0.0615)/(0.0615 – 0.0532) = 0.1238/0.0083 = 14. valor que era el esperado, pues la proteína tendría un total de 15 Tyr

7.- En la gráfica se aprecia el momento en el que se añade la disolución de enzima y se agita la mezcla. El valor inicial de A 340 es 0.440. A 340 = 0.440 =  340 x C x l = 6200 x C x 1 C= 7.097 x 10-5^ M A 340 /min = 0.192 (en tramo lineal) A 340 /min = 0.192 =  340 x C/min x l C/min = 0.192/6200 = 3.097 x 10 -5^ M/min Vensayo = 2.001 mL 6.197 x 10 -2^ mol/min transformados 6.197 x 10 -2^ UI/1 L ~ 61.97 UI/mL C = 0.01 mg/mL Actividad específica = 61.97/0.01 = 6197 UI/mg

pH

8 9 10 11 12 13

A

295

0,

0,

0,

0,

t (segundo)

0 20 40 60 80 100 120 140 160

A^340

0,

0,

0,

0,

0,

8.- Si se representan los valores de %H vs. ng/mL se obtiene esta gráfica. De ella se puede deducir que el 50% de hemolisis se obtiene para una concentración de 30 ng/mL. Por tanto, HC 50 = 30 ng/mL

9.- Representando los valores de A vs. mg/mL de BSA se obtiene la recta patrón de esta colorimetría. El valor de 0.645, correspondiente a la absorbancia de la muestra problema en las condiciones estándar, proporciona una concentración equivalente de BSA de 0.75 mg/mL

10.-  415 = 15000 M -1^ cm - Vreacción = 1 (enzima) + 0.8 (tampón) + 0.2 (reactivo) = 2 mL Cinicial enzima = 10 μM Cenzima reacción = 5 μM A 415 =  415 x Cenzima reacción x l = 15000 x 5 x 10 -6^ x 1 A 415 = 0.

11.- Representando los valores de concentración vs. A (^450) se obtiene la gráfica patrón del ELISA. La muestra problema tendría, por tanto, una concentración de 1 ng/mL.

12.- El ligando aumenta la temperatura de fusión del DNA (DNA libre, curva izqda), luego se comporta como estabilizante. A saturación (curva dcha), llega a afectar a todas las bases, luego no requiere una secuencia específica para unirse. La constante de asociación debe ser elevada pues se observa una curva bifásica (curva intermedia), que revela la presencia de bases libres.

mg/mL

0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0 1,

Absorbancia

0,

0,

0,

0,

0,

ng/mL

0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200

% H

0

20

40

60

80

100

ng/mL

0,0 0,5 1,0 1,5 2,

A^450

0,

0,

0,

0,

0,

1,