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Biología Celular Aplicada tema 3, Apuntes de Biología Celular

Asignatura: Biologia Celular Aplicada, Profesor: Pepa Hazen, Carrera: Biología, Universidad: UAM

Tipo: Apuntes

2014/2015

Subido el 16/10/2015

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BIOLOGÍA CELULAR
Tema 3.
Mecanismos de regulación y coordinación del tráfico vesicular
Regulación y coordinación del tráfico vesicular
Las GTPasas monoméricas tiene un papel muy importante de las distintas etapas del tráfico intracelular, lo
regulan y lo coordinan. No solo se encargan del ensamblaje de las cubiertas sino también de su movimiento, de
su fusión con los compartimentos aceptores etc. En mamíferos hay diferentes tipos de GTPasas que funcionan
en dos estadios distintos de configuración unidad a GDP (inactivas) unidas a GTP (activas).
Dentro de las GTPasas hay diferentes familias. El tráfico intracelular está controlado por Rho, Rab y Sar1/Arf.
1. Rho. Esta asociadas también a los cambios en el citoesqueleto de actina. Hay distintos tipos de endocitosis
que necesitan de la intervención de este citoesqueleto y de la reestructuración del mismo para producir los
efectos adecuados.
En el caso del tráfico intracelular actúan. Rho A, Rac 1 y Cdc42
2. Rab. También son fundamentales en los procesos de tráfico intracelular. Controlan todas las etapas del
tráfico vesicular. Participan en el brote de las vesículas, en la pérdida de su revestimiento, en su movimiento
a través del citoplasma y el los procesos de fusión de las vesículas con sus compartimentos
correspondientes. En cada uno de los compartimentos y en cada una de las vesículas o carriers encontramos
distintos tipos de proteínas Rab. La inhibición de estas proteínas tiene efectos muy drásticos en las células.
3. Sar1/Arf. Sar1 es al que se encarga de reclutar el revestimiento de las vesículas COP II y así un montón más
que están en apuntes anteriores claramente detalladas.
Cosas que no se saben
Cuantos tipos de COP II salen del RER ni si éstas están especializadas en la carga que transportan.
Cuántos tipos de COP I se generan en el Golgi y en el ERGIC y como llegan estas vesículas a su
compartimento de destino.
Cuánto tarda el desensamblaje de los revestimiento de las vesículas y cual es la orden in vivo para que esto
se produzca.
Alteraciones relevantes para la salud humana
La maquinaria completa necesaria para que se produzca un tráfico de membranas en una célula es
aproximadamente de 2000 proteínas. Cualquiera de estas 2000 proteínas puede ser una diana de marcaje o
terapéutica.
Hay múltiples situaciones en las que un mal funcionamiento puede tener consecuencias graves para la célula.
1. Salida del RER hasta el ERGIC.
2. Desde el ERGIC al retículo
3. Modificaciones del complejo de Golgi. Tanto en su funcionamiento como en las proteínas.
4. Salida desde la red trans-Golgi hacia los diferentes destinos.
5. Procesos de endocitosis.
Esto quiere decir que hay múltiples puntos en los que la célula tiene que tener un control muy exhaustivo para
que no haya un problema patológico
Salida del RER hasta el ERGIC
Problemas que puede haber por esta circunstancia.
1. Retención de la carga. La carga es retenida en el RE y degradada por el proteasoma por que las proteínas
no están bien sintetizadas. Esto depende del ERAD y suele ocurrir cuando las proteínas no consiguen
plegarse después de varios ciclos.
En la actualidad hay 67 enfermedades humanas que se asocian con la vía ERAD. Es decir que hay
determinadas proteínas que se degradan por esta vía y que no alcanzan su destino correcto.
La que está mejor estudiada es la fibrosis quística.
Existe un canal transmembrana que se llama CFTR que es un transportador ABC. Lo que hace este
transportador, en condiciones normales, es liberar Cl al exterior, en contra de gradiente. Estos iones de Cl
son fundamentales para la hidratación en determinados tipos de epitelios. Cuando este canal no funciona de
manera correcta, la ausencia de Cl en la superficie hace que se produzca un mucus de mucha densidad.
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BIOLOGÍA CELULAR

Tema 3.

Mecanismos de regulación y coordinación del tráfico vesicular

Regulación y coordinación del tráfico vesicular Las GTPasas monoméricas tiene un papel muy importante de las distintas etapas del tráfico intracelular, lo regulan y lo coordinan. No solo se encargan del ensamblaje de las cubiertas sino también de su movimiento, de su fusión con los compartimentos aceptores etc. En mamíferos hay diferentes tipos de GTPasas que funcionan en dos estadios distintos de configuración unidad a GDP (inactivas) unidas a GTP (activas).

Dentro de las GTPasas hay diferentes familias. El tráfico intracelular está controlado por Rho, Rab y Sar1/Arf.

  1. Rho. Esta asociadas también a los cambios en el citoesqueleto de actina. Hay distintos tipos de endocitosis que necesitan de la intervención de este citoesqueleto y de la reestructuración del mismo para producir los efectos adecuados. En el caso del tráfico intracelular actúan. Rho A, Rac 1 y Cdc
  2. Rab. También son fundamentales en los procesos de tráfico intracelular. Controlan todas las etapas del tráfico vesicular. Participan en el brote de las vesículas, en la pérdida de su revestimiento, en su movimiento a través del citoplasma y el los procesos de fusión de las vesículas con sus compartimentos correspondientes. En cada uno de los compartimentos y en cada una de las vesículas o carriers encontramos distintos tipos de proteínas Rab. La inhibición de estas proteínas tiene efectos muy drásticos en las células.
  3. Sar1/Arf. Sar1 es al que se encarga de reclutar el revestimiento de las vesículas COP II y así un montón más que están en apuntes anteriores claramente detalladas.

Cosas que no se saben

  • Cuantos tipos de COP II salen del RER ni si éstas están especializadas en la carga que transportan.
  • Cuántos tipos de COP I se generan en el Golgi y en el ERGIC y como llegan estas vesículas a su compartimento de destino.
  • Cuánto tarda el desensamblaje de los revestimiento de las vesículas y cual es la orden in vivo para que esto se produzca.

Alteraciones relevantes para la salud humana

La maquinaria completa necesaria para que se produzca un tráfico de membranas en una célula es aproximadamente de 2000 proteínas. Cualquiera de estas 2000 proteínas puede ser una diana de marcaje o terapéutica. Hay múltiples situaciones en las que un mal funcionamiento puede tener consecuencias graves para la célula.

  1. Salida del RER hasta el ERGIC.
  2. Desde el ERGIC al retículo
  3. Modificaciones del complejo de Golgi. Tanto en su funcionamiento como en las proteínas.
  4. Salida desde la red trans-Golgi hacia los diferentes destinos.
  5. Procesos de endocitosis. Esto quiere decir que hay múltiples puntos en los que la célula tiene que tener un control muy exhaustivo para que no haya un problema patológico

Salida del RER hasta el ERGIC Problemas que puede haber por esta circunstancia.

  1. Retención de la carga. La carga es retenida en el RE y degradada por el proteasoma por que las proteínas no están bien sintetizadas. Esto depende del ERAD y suele ocurrir cuando las proteínas no consiguen plegarse después de varios ciclos. En la actualidad hay 67 enfermedades humanas que se asocian con la vía ERAD. Es decir que hay determinadas proteínas que se degradan por esta vía y que no alcanzan su destino correcto. La que está mejor estudiada es la fibrosis quística. Existe un canal transmembrana que se llama CFTR que es un transportador ABC. Lo que hace este transportador, en condiciones normales, es liberar Cl al exterior, en contra de gradiente. Estos iones de Cl son fundamentales para la hidratación en determinados tipos de epitelios. Cuando este canal no funciona de manera correcta, la ausencia de Cl en la superficie hace que se produzca un mucus de mucha densidad.

Se ha visto que las mutaciones de este canal CFTR producen su retención y degradación en el RER. En esta situación el mucus de los epitelios es muy viscoso y esto favorece las infecciones. Los transportadores son importante en el pulmón, en la piel, en el hígado en el tracto reproductor… Estudiando al enfermedad se observa que hay mutaciones distintas en función de qué es lo que ocurre con ese transportador.

  • Clase1. No se produce ningún transcrito para la síntesis del canal. No se forman los transportadores CFTR
  • (^) Calse 2. Se produce el canal pero no sigue el procesamiento correcto en dirección al Golgi. Directamente se degrada en el proteasoma. Si el ERAD es muy efectivo puede que no haya ningún canal de este tipo en la membrana. Constituye el 88.5% de los casos de la enfermedad. Aparece un gen defectuoso que da lugar a una proteína defectuosa que no realiza bien su función. Estos problemas son los defectos básicos de la enfermedad que se empiezan a corregir. Las aproximaciones terapéuticas que están más en boga son las de intentar corregir la proteína defectuosa. Se emplean algunas moléculas que pretenden facilitar el plegamiento de la proteína (la proteína sigue mal sintetizada pero el fármaco hace que se pliegue bien) o modular el control de calidad en el RER con el fin de que no reconociera la proteína defectuosa. En el segundo caso se intenta que el ERAD no reconozca la proteína llegando el transportador mal plegado a la membrana e intentando que funcione correctamente mediante tratamientos posteriores. Los mecanismos que se usan para curar la enfermedad son en su mayoría correctores. Se aplican a la proteína mal plegada para que se pliegue bien. Cuando llegan a la membrana plasmática son capaces de liberar iones Cl aunque no en la misma proporción que uno normal. El plegamiento de ésta proteína corregida es inestable. Al ser inestable el plegamiento hay unas chaperonas (HsC) de la membrana plasmática que lo detectan y hacen que se degrade. Para evitar este efecto se usa un potenciador que permita que el transportador funcione normalmente. Si el funcionamiento es normal, gracias al potenciador, el reciclaje en la membrana es menor. El tratamiento de la enfermedad es continuo y crónico. Con él se intenta corregir las proteínas, mejorar su tráfico a través de la célula, e inhibir las proteínas que se encargan del reciclaje en la membrana plasmática.
  • (^) Clase 3. Tiene que ver con problemas en la regulación del canal
  • Clase 4. Conductancia del canal
  • Clase 5. Se produce transcritos pero muy pocos
  • Clase 6. Continuamente el canal es retirado de la membrana. Tiene un reciclaje acelerado.
  1. Acumulación de proteínas en el RE que da lugar a un estrés. Las proteínas no están bien glicosiladas y el RE se estresa. El ERAD se satura y cada vez hay más proteínas más plegadas y no da tiempo a procesarlas. Esto da lugar aun respuesta a proteínas mal plegada que pretende conseguir que la célula vuelva a actuar en condiciones normales mediante una parada en la traducción. Esta parada va acompañada de una serie de órdenes que incrementan la producción de chaperonas implicadas en el plegamiento en el RER. Esta respuesta es adaptativa pero cuando el estrés es muy prolongado o muy severo esta respuesta da orden de muerte por apoptosis. Las situaciones que pueden lleva a un estrés en el RE son:
  • Disminución de los niveles de Ca en el RE. El Ca es un segundo mensajero que necesita estar acumulado en el RE y salir cuando se lo ordene.
  • Presencia de proteínas mal plegadas.
  • Estrés reductivo. En el control de calidad se forman puentes disulfuro, si esto no se produce da lugar a estrés.
  • Drogas alteradoras de la conducta como el alcohol.
  • Antagonistas de la glicosilación. La glicosilación es un paso imprescindible para el plegamiento.
  • Microambiente de tumores sólidos por que falta glucosa, oxígeno y el pH bajo.
  • (^) Estados patológicos como oncoivirus, inmunidad citotóxica, determinados tumores etc. Para que el retículo se de cuenta de la situación son necesarios tres sensores:
  • IRE1. En un a situación de estrés autodimeriza y se fosforila. Actúa por splicing (retira un intrón) sobre un RNA mensajero que codifica para una proteína XBP1. XBP1 actúa sobre ciertos puntos del genoma que mitigan el estrés para la supervivencia o lo activan todavía mas para dar una orden de apoptosis.
  • ATF6. Cuando se activa se traslada al Golgi sonde actúa en dos proteasas SP1 y 2. Estas proteasas cortan ATF6 y dan lugar a ATF6f que actúa sobre el ADN y se expresan moléculas implicadas en el proceso adaptativo de la célula.
  • PERK. Cuando se activa se autofosforila (actúa como un dímero) y va a actuar sobre el factor iniciador de la trascripción (eIF2) , al fosfolirarlo se va a bloquear la traducción y además va a dar lugar a que se origine un factor de trascripción ATF4 que por un lado actúa sobre determinados genes diana para inducir una respuesta de adaptación en la célula (produce la síntesis de chaperonas, foldasas y de activar el ERAD) y por otro lado puede generar el factor de trascripción CHOP que es el que va a dar señal de muerte

Si se induce una respuesta de estrés todavía más fuerte que puede dar lugar a que éstas células sí que den orden de muerte.

Hay numerosos puntos de intervención sobre es estrés del retículo para modificar la respuesta.

  • Se pueden usar inhibidores y activadores sobre los sensores de estrés.
  • Intervenir en el control de calidad del RER.
  • (^) Se puede incrementar la actuación de determinados procesos que sean capaces de retirar las proteínas mal plegadas. Esto se hace provocando situaciones de autofagia o incrementando la actividad del ERAD.
  • Se usan antioxidantes para que las proteínas mejoren su plegamiento
  • Reguladores del flujo de Ca.
  • Regulación de los mecanismos de exportación. Que esta sea más rápida para que le proceso no se pare
  • Incrementar o inhibir la presencia de moléculas implicadas en el plegamiento como las chaperonas.

Existen ciertos compuestos que favorecen la supervivencia de las células impidiendo que mueran por la UPR:

  • Chaperonas químicas. Incrementan el ERAD e inhiben las señales de muerte
  • Benzodiacepinas. Actúan sobre el mecanismo de señalización de IRE1. Bloquean la vía apoptótica del UPR
  • (^) Antioxidantes. Secuestran radicales libres. Se reduce es estrés oxidativo
  • Inhibidores de algunas quinasas.

Hay estrategias terapéuticas para intensificar la situación de estrés.

  • Inhibición de las bobas de Ca
  • Tunicamicina. Inhibe la glicosilación de las proteínas para que no se puedan plegar.
  • Berefeldina. Impide el trafico de proteínas.
  • Inhibidores del porteasoma.

Preacondicionamiento por inductores del estrés del RE Se ha visto que cuando nosotros provocamos una situación de estrés suave las células cuando a continuación se les produce un daño mayor tienen más capacidad de respuesta que una célula normal. Esta situación de estrés suave puede provocar que aumente las respuestas adaptativas a ciertos compuestos. Este estado de preacondicionamiento in vitro puede durar hasta 48 horas. In Vivo la persona tendría que tomar un fármaco a diario de por vida. Estos tratamientos crónicos pueden provocar al quimiosensibilidad o la quimiorresistencia. Si precondicionamos células con tunicamicina in vitro y a continuación utilizamos agentes quimioterapéuticos que dañan el ADN lo que se produce es un apoptosis. En esta misma situación se añaden drogas que interfieren con los microtúbulos y en este caso la tunicamicina protege a las células de la apoptosis.