Docsity
Docsity

Prepara tus exámenes
Prepara tus exámenes

Prepara tus exámenes y mejora tus resultados gracias a la gran cantidad de recursos disponibles en Docsity


Consigue puntos base para descargar
Consigue puntos base para descargar

Gana puntos ayudando a otros estudiantes o consíguelos activando un Plan Premium


Orientación Universidad
Orientación Universidad


Bioquímica, Biomol, Apuntes de Bioquímica

Contiene los temas desde síntesis y degradación de purinas y pirimidinas y una parte de estructura, replicación y reparación del ADN

Tipo: Apuntes

2015/2016

Subido el 04/07/2016

ari_iturbe
ari_iturbe 🇲🇽

2.5

(2)

1 documento

1 / 5

Toggle sidebar

Esta página no es visible en la vista previa

¡No te pierdas las partes importantes!

bg1
BIOQUÍMICA: 4TO PARCIAL
I. METABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS
Nucleótidos – producen ADN y ARN, para la síntesis de proteínas. También son
portadores de productos intermedios dentro de la síntesis de CH, lípidos, etc. Son
componentes estructurales de diversas coenzimas esenciales. Compuestos reguladores
importantes para muchas vías, al inhibir o activar enzimas clave.
- Composición: Base nitrogenada, Monosacárido pentosa, Grupo fosfato (÷ 1 y 3)
Bases nitrogenadas: se dividen en dos grupos, púricas y pirimídicas.
- Púricas: Adenina (A) y Guanina (G), son las mismas en el ADN y en el ARN
- Pirimídicas: Citosina (C) en ambos, pero en el ADN está la Timina (T) y en el
ARN el Uracilo (U) [Dieren en el grupo metilo que tiene la timina.]
Las bases pueden padecer diversas modicaciones, ÷ las cuales destacan
metilación, glucosilación, acetilación y reducción
- Nucleóisdos: [Base Nitrogenada + Monosacárido pentosa] Esto ocurre por medio
de un enlace glucosídico. El nucleósido puede ser ribonucleósido o 2-
desoxirribonucleósido, dependiendo del azúcar que se le haya agregado (ribosa o
2-desoxirribosa). Los ribonucleósidos de las bases A, G, C y U se denominan
adenosina, guanosina, citidina y uradina. A los desoxirribonucleósidos se les
agrega el prejo “desoxi” (desoxiadenosina, etc.)
- Nucleótidos: [Grupo fosfato + Nucleósido] Se pueden añadir de 1 a 3, el primero
se añade por un enlace éster al carbono 5’ del monosacárido pentosa, formando
un 5’ nucleótido. El segundo y tercer fosfato están conectados al nucleótido por un
enlace de alta energía,(enlace fosfodiéster) y son los responsables de las cargas
negativas asociadas a los nucleótidos.
Síntesis de AMP Y GMP - Es a partir de IMP, producto de la síntesis de los nucleótidos
de purina. Utiliza dos etapas que consumen energía. Se inhiben por el producto nal de
la misma, esto es para desviar el IMP a la síntesis de purinas presentes en menores
cantidades.
+ aspartato y GMP
IMP *adenilsuccinato
sintetasa*> ADENILSUCCINATO *adenilsuccinasa*>
[FUMARATO & AMP]
+ H2O y NAD++ glutamina y ATP
IMP * IMP deshidrogenasa*> MONOFOSFATO DE XANTOSINA *GMP
sintasa*> [GMP]
Monofosfatos y trifosfatos de nucleósidos - Se sintetizan por las nucleósido
monofosfato cinasas , especícas para cada base. El ATP es la fuente del fosfato. La
adenilato cinasa, es particularmente actica en el hígado & músculo, y mantiene el
equilibrio entre el AMP, ADP y ATP. Los difosfatos y trifosfatos se interconvierten
(nucleósido difosfato cinasa)
Vía de rescate de las purinas - Las purinas no degradadas pueden convertirse en
trifosfatos de nucleósido y ser utilizadas. Esto se conoce como vía de rescate, la cual es
importante para el cerebro.
pf3
pf4
pf5

Vista previa parcial del texto

¡Descarga Bioquímica, Biomol y más Apuntes en PDF de Bioquímica solo en Docsity!

BIOQUÍMICA: 4TO PARCIAL

I. METABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS

Nucleótidos – producen ADN y ARN, para la síntesis de proteínas. También son portadores de productos intermedios dentro de la síntesis de CH, lípidos, etc. Son componentes estructurales de diversas coenzimas esenciales. Compuestos reguladores importantes para muchas vías, al inhibir o activar enzimas clave.

  • Composición: Base nitrogenada, Monosacárido pentosa, Grupo fosfato (÷ 1 y 3) Bases nitrogenadas: se dividen en dos grupos, púricas y pirimídicas.
    • Púricas: Adenina (A) y Guanina (G), son las mismas en el ADN y en el ARN
  • Pirimídicas: Citosina (C) en ambos, pero en el ADN está la Timina (T) y en el ARN el Uracilo (U) [Difieren en el grupo metilo que tiene la timina.] Las bases pueden padecer diversas modificaciones, ÷ las cuales destacan metilación, glucosilación, acetilación y reducción
  • Nucleóisdos: [Base Nitrogenada + Monosacárido pentosa] Esto ocurre por medio de un enlace glucosídico. El nucleósido puede ser ribonucleósido o 2- desoxirribonucleósido, dependiendo del azúcar que se le haya agregado (ribosa o 2-desoxirribosa). Los ribonucleósidos de las bases A, G, C y U se denominan adenosina, guanosina, citidina y uradina. A los desoxirribonucleósidos se les agrega el prefijo “desoxi” (desoxiadenosina, etc.)
  • Nucleótidos: [Grupo fosfato + Nucleósido] Se pueden añadir de 1 a 3, el primero se añade por un enlace éster al carbono 5’ del monosacárido pentosa, formando un 5’ nucleótido. El segundo y tercer fosfato están conectados al nucleótido por un enlace de alta energía,(enlace fosfodiéster) y son los responsables de las cargas negativas asociadas a los nucleótidos.

Síntesis de AMP Y GMP - Es a partir de IMP, producto de la síntesis de los nucleótidos de purina. Utiliza dos etapas que consumen energía. Se inhiben por el producto^ final de la misma, esto es para desviar el IMP a la síntesis de purinas presentes en menores cantidades.

  • aspartato y GMP ▲ IMP adenilsuccinato sintetasa> ADENILSUCCINATO adenilsuccinasa> [FUMARATO & AMP]

  • H 2 O y NAD+^ + glutamina y ATP ▲ IMP * IMP deshidrogenasa*> MONOFOSFATO DE XANTOSINA GMP sintasa> [GMP]

Monofosfatos y trifosfatos de nucleósidos - Se sintetizan por las^ nucleósido monofosfato cinasas , específicas para cada base. El ATP es la fuente del fosfato. La adenilato cinasa, es particularmente actica en el hígado & músculo, y mantiene el equilibrio entre el AMP, ADP y ATP. Los difosfatos y trifosfatos se interconvierten ( nucleósido difosfato cinasa )

Vía de rescate de las purinas - Las purinas no degradadas pueden convertirse en trifosfatos de nucleósido y ser utilizadas. Esto se conoce como vía de rescate, la cual es importante para el cerebro.

  • Intervienen la ADENOSINA FOSFORRIBOSILTRANSFERASA (APRT) y la HIPOXANTINA- GUANINA FOSFORRIBOSILTRASNFERASA (HGPRT)
  • Utilizan el PRPP como fuente de la R5P
  • Se libera pirofosfato, y se hidroliza ( pirofosfatasa; es irreversible)

Síndrome de Lesh-Nyhan: Ligado al cr X. Carencia de la HGPRT (incapacidad para rescatar hipoxantina y guanina, se acumulan – ácido úrico)

  • Aumentan los niveles de PRPP y disminuyen los de IMP y GMP, por lo que la glutamina fosforribosilpirofosfato amidotransferasa tiene mas sustrato y aumenta la síntesis de purinas, por lo que aumenta la degradación (exceso de ácido úrico; hiperuricemia) -Cálclos de ácido úrico en el riñon (urolitiasis) y artritis gotosa. Hay disfunción motriz, déficit cognitivo, trastornos de comportamiento, automutilación. Síntesis de desoxirribonucleótidos – Son los necesarios para la síntesis de ADN. Se producen de los ribonucleósidos difosfato, por la ribonucleótido reductasa.
  • La ribonucleótido reductasa tiene dos subunidades (R1 y R2) y es específica para transformar a ADP, GDP, CDP y UDP a dADP, dGDP, dCDP y dUDP, por medio de los grupos sulfhidrilo (que forman enlaces disulfuro) de la misma enzima, que dona los hidrógenos para reducirlos.
  • Esta enzima es responsable del equilibrio de los desoxirribonucleótidos para producir ADN. Esto es gracias a los sitios alostéricos que regulan su actividad, además de los sitios catalíticos.
  • Se une el dATP a los sitios alostéricos para inhibir la actividad catalítica, en cambio el ATP la activa.
  • La conversión específica de los ribonucleótidos es mantenida por la unión de los trifosfatos de nucleósido a los sitios alostéricos adicionales (de especificidad del sustrato)
  • Se debe reducir a la enzima, tiene que reducirse el enlace disulfuro (produce 2’- desoxicarbono). La tiorredoxina es la coenzima de la ribonucleótido reductasa. Los dos grupos sulfhidrilo de la tiorredoxina le donan los hidrógenos a la nucleótido reductasa, para reducirla.
  • La tiorredoxina también debe reducirse, y los equivalentes reductores necesarios provienen del NADPH + H+^ , y esto ocurre gracias a la tiorredoxina reductasa.

Degradación de nucleótidos de purina - @ Intestino delgado, los ácidos nucléicos (dieta) se degradan a nucleótidos. El producto final es el ácido úrico. Los nucleótidos de purina de novo se degradan en el hígado, y las bases se rescatan en los tejidos periféricos.

  • Las ribonucleasas y desoxirribonucleasas pancreáticas hidrolizan al ARN y al ADN a oligonucleótidos, que después se hidrolizan a mononucleótidos, por las fosfodiesterasas.
  • Las nucleotidasas le reitran los grupos fosfato (x hidrólisis) y las nucleosidasas se fosforilan a bases libres y (desoxi) ribosa 1-fosfato
  • Las purinas de la dieta se degradan a ácido úrico, en los enterocitos. Pasos de la degradación:
  1. Se elimina el grupo amino del AMP, produce IMP (AMP desaminasa) || Eliminación del grupo amino de la adenosina, produce inosina (adenosina desaminasa)
  2. El IMP y el GMP se convierten en inosina y ganosina (5’-nucleotidasa)
  3. Inosina y guanosina => hipoxantina y guanina (purina nucleósido fosforilasa)
  • UTP (CTP sintetasa; aminación) CTP (glutamina – nitrógeno) [Parte del CTP se desfosforila (CDP) y la ribonucleotido reductasa lo hace dCDP, que se fosforila a dCTP (ADN) o se desfosforila a dCMP (produce dUMP por desaminación) Síntesis de dTMP:
  • dUMP => dTMP (timidilato sintasa) Degradación & vías de rescate de las pirimidinas:
  • El anillo de pirimidina se abre y se degrada a productos solubles. beta-alanina, beta-aminoisobutirato, y se produce NH3 y CO2.
  • Las bases pirimidicas se pueden rescatar para los nucleósidos (fosforilados a nucleótidos).

II. ESTRUCTURA, REPLICACIÓN Y REPARACIÓN DEL ADN

ADN – depóstio de inf. genética (@cromosomas, mitocondrias y cloroplastos, o en plásmidos – procariotas)

  • Se copia y se transmite x ½ de la replicación.
  • Se transcribe (síntesis de ARN) para expresarse selectivamente DOGMA CENTRAL
  • Se traduce (síntesis de proteínas) el código de nucleótidos para la expresión del gen. (info from ADN to ARN)
  • Estructura
    • Es un conjunto de monofosfato de desoxirribonucleósidos unidos [estruc. primaria] por un enlace fosfodiéster del carbono 3’ al 5’
    • Las bases se escriben desde el ext 5’ hacia el 3’
    • Es una molécula de doble hebra (puede presentarse en hebra simple en algunos virus) y éstas forman una doble hélice [estruc. secundaria]
    • Eucariotas: @ núcleo || Procariotas: @ nucleoide
      • ENLACES FOSFODIESTER:
        • Grupo hidroxilo (3’) de uns desoxipentosa + Grupo hidroxilo (5’) de otra desoxipentosa [por medio de un grupo fosforilo]
        • De estas uniones de nucleótidos resulta una cadena larga, cargada negativamente, que tiene un extremo con un fosfato libre (5’) y otro con un hidroxilo libre (3’)
        • Los enlaces pueden hidrolizarse por las nucleasas (ribonucleasas o desoxirribonucleasas)
  • DOBLE HÉLICE:
  • Las cadenas se desenrrollan alrededor del eje que tienen en común (eje helicoidal)
  • Se aparean de forma antiparalela
  • Se crea un surco ancho (mayor) y uno más estrecho (menor), que hacen posible la unión de las prot. reguladoras
  • La Adenina (A) se aparea con una Timina (T) y la Guanina (G) con la Citosina (C) , y se aparean perpendicular al eje h.
  • Regla de Chargaff: la cantidad de A en una muestra de ADN nicaternario es igual a la cantidad de T y la cant. de G es = a la de C, y que la cantidad de purinas es = a la de pirimidinas.
  • Las bases se unen x enlaces de hidrógeno (A&T= 2 | G&C = 3)
  • Se separan las hebras cuando se rompen los enlaces de hidrógeno que unen a las bases de una cadena con la otra
  • La pérdida del estructura helicoidal: desnaturalización | Se vuelve a formar la hélice? Renaturalización
  • Formas B, A y Z
  • Forma B: hélice dextrógira, 10 pdb por vuelta de 360° bases perpendiculares al eje. Watson y Crick
  • Forma A: forma deshidratada del ADN-B. Hélice dextrógira. 11 pdb por vuelta. Inclinados 20° con respecto al eje.
  • Forma Z: hélice levógira. 12 pdb por vuelta. Zigzaguea. @ Regiones que alternan secuencias púricas y pirimídicas.
  • ADN LINEAL Y CIRCULAR: