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electroforesis, Apuntes de Bioquímica

Asignatura: Bioquímica, Profesor: Mercedes Oñáderra, Carrera: Biología, Universidad: UCM

Tipo: Apuntes

2013/2014

Subido el 01/02/2014

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ELECTROFORESIS:
La mayoría de las biomoléculas poseen una carga eléctrica, cuya magnitud depende del pH del
medio en el que se encuentran. Como consecuencia, se desplazan cuando se ven sometidas a un
campo eléctrico.
Se denomina electroforesis a la técnica por la cual se separan biomoléculas en disolución al ser
sometidas a un campo eléctrico.
Es un tratamiento teórico similar al de la centrifugación, con la diferencia de que solo se
desplazarán por la acción del campo las moléculas con carga eléctrica, mientras que en la
centrifugación todas las moléculas tienen masa y responden a un campo centrífugo.
No es posible hacer un tratamiento teórico exacto del transporte en campos eléctricos porque la
atmosfera iónica introduce complicaciones sin solución matemática.
Las biomoléculas tienen en su gran mayoría una carga eléctrica. En presencia de un campo eléctrico
se desplazarán, con mayor o menor velocidad y por tanto con mayor o menor actividad
electroforética (velocidad por unidad de campo), en función de su carga neta, su tamaño y su forma,
lo que permitirá separarlas unas de otras.
La separación se realiza en modalidad zonal : la muestra se aplica como una mancha o banda y sus
componentes migran a través de un disolvente, utilizando además un medio soporte de éste. El
único objetivo es separar los componentes de la muestra.
No se suele llevar a cabo en medios fluídos, sino en medios semisólidos, llamados GELES, los
cuales actúan como estabilizadores de las zonas o bandas. El factor forma y tamaño adquiere una
alta relevancia en la separación.
Geles de electroforesis: estado semisólido en el que la fase dispersante está formada por polímeros
fibrilares (acrilamida y agarosa), entre cuyas fibras entrelazadas queda retenida, por capilaridad e
hidratación, la fase dispersa de naturaleza acuosa.
Se usan principalmente dos:
- Poliacrilamida: Su porosidad es menor que la de la agarosa. Se utiliza para la electroforesis de
proteínas. La gelificación se consigue mediante una reacción de polimerización.
- Agarosa: Polisacárido, producto purificado de algas (composición similar al agar-agar). Se
disuelve en caliente (50-60ºC) (sol) y al enfriar solidifica un gel de alta porosidad.
Porosidad del gel: cuanto mayor sea la concentración de fibras y su grado de entrecruzamiento,
menor será la porosidad (mayor el reticulado) del gel.
El porcentaje de acrilamida determina el reticulado del gel resultante. El agente de
entrecruzamiento, bis-acrilamida, se emplea en pequeñas proporciones, para asegurar la dureza y
consistencia del gel final. Terminada la polimerización se puede desmoldar.
La agarosa se disuelve en caliente en disolventes acuosos, alcanzando un estadocoloidal de sol. Al
enfriarse pasa al estado de gel. Encontces se puede desmoldar. La concentración de agarosa en la
disolución inicial determina el reticulado final del gel.
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ELECTROFORESIS:

La mayoría de las biomoléculas poseen una carga eléctrica, cuya magnitud depende del pH del medio en el que se encuentran. Como consecuencia, se desplazan cuando se ven sometidas a un campo eléctrico.

Se denomina electroforesis a la técnica por la cual se separan biomoléculas en disolución al ser sometidas a un campo eléctrico.

Es un tratamiento teórico similar al de la centrifugación, con la diferencia de que solo se desplazarán por la acción del campo las moléculas con carga eléctrica, mientras que en la centrifugación todas las moléculas tienen masa y responden a un campo centrífugo.

No es posible hacer un tratamiento teórico exacto del transporte en campos eléctricos porque la atmosfera iónica introduce complicaciones sin solución matemática.

Las biomoléculas tienen en su gran mayoría una carga eléctrica. En presencia de un campo eléctrico se desplazarán, con mayor o menor velocidad y por tanto con mayor o menor actividad electroforética (velocidad por unidad de campo), en función de su carga neta, su tamaño y su forma, lo que permitirá separarlas unas de otras.

La separación se realiza en modalidad zonal : la muestra se aplica como una mancha o banda y sus componentes migran a través de un disolvente, utilizando además un medio soporte de éste. El único objetivo es separar los componentes de la muestra.

No se suele llevar a cabo en medios fluídos, sino en medios semisólidos, llamados GELES, los cuales actúan como estabilizadores de las zonas o bandas. El factor forma y tamaño adquiere una alta relevancia en la separación.

Geles de electroforesis: estado semisólido en el que la fase dispersante está formada por polímeros fibrilares (acrilamida y agarosa), entre cuyas fibras entrelazadas queda retenida, por capilaridad e hidratación, la fase dispersa de naturaleza acuosa.

Se usan principalmente dos:

  • Poliacrilamida: Su porosidad es menor que la de la agarosa. Se utiliza para la electroforesis de proteínas. La gelificación se consigue mediante una reacción de polimerización.
  • Agarosa: Polisacárido, producto purificado de algas (composición similar al agar-agar). Se disuelve en caliente (50-60ºC) (sol) y al enfriar solidifica un gel de alta porosidad.

Porosidad del gel: cuanto mayor sea la concentración de fibras y su grado de entrecruzamiento, menor será la porosidad (mayor el reticulado) del gel.

El porcentaje de acrilamida determina el reticulado del gel resultante. El agente de entrecruzamiento, bis-acrilamida, se emplea en pequeñas proporciones, para asegurar la dureza y consistencia del gel final. Terminada la polimerización se puede desmoldar.

La agarosa se disuelve en caliente en disolventes acuosos, alcanzando un estadocoloidal de sol. Al enfriarse pasa al estado de gel. Encontces se puede desmoldar. La concentración de agarosa en la disolución inicial determina el reticulado final del gel.

ELECTROFORESIS DE ÁCIDOS NUCLEICOS:

Se suele realizar en geles de Agarosa. Lo primero que se hace es preparar el gel (mezclas agarosa con amirtiguador, lo tapas, lo calientas en el microondas, lo echas en el molde, colocas el peine para hacer los agujeritos, lo sacas)

Instalamos el equipo gel donde haremos la electroforesis : (echamos el amortiguador en el recipiente de la electroforesis, introducimos el gel con su molde)

Preparar la disolución de ADN: (cogemos con la micropipeta disolución amortiguadora, y la mezclamos con un tipo de ADN, lo echamos en un hueco del gel, echamos el otro tipo de ADN en otro hueco)

Llevamos a cabo la electroforesis: conectamos el recipiente a la fuente de energía, el ADN en disolución comenzará a desplazarse según su tamaño (Cuanto más pequeño más rapido avanzará y llegará más lejos).

Quitamos el molde del gel y tintamos el ADN, lo ponemos en luz ultravioleta y observamos.

Las moléculas de ADN encuentran mucha viscosidad en su avance a través de la agarosa. El reticulado del gel actúa como un verdadero tamiz molecular, restringiendo el avance de las moléculas. El gel de agarosa es un soporte restrictivo para estos ADNs. Con geles de muy baja concentración de agarosa no se da este efecto de tamizado molecular por lo que es un soporte no restrictivo.

Un tamiz molecular es un material que contiene poros pequeños de un tamaño preciso y uniforme que se usa como agente adsorbente para gases y líquidos. Todas las moléculas de DNA tienen la misma relación carga/tamaño y si hablamos de DNA de doble hélice, todos tienen la misma forma. Las diferentes especies de DNA se comportan como isómeros de forma y relación carga/tamaño. Sólo su diferente tamaño dará cuenta de su diferente movilidad.. La relación entre la movilidad electroforética y el tamaño es inversa y semilogarítmica. La movilidad electroforética no se puede medir en los valores absolutos, pero sí en valores relativos.

La movilidad electroforética de los ácidos nucleicos depende sólo del tamaño, siempre que se pueda asegurar que todas las especies tienen la misma forma, bien entendido que todas tienen la misma relación carga/tamaño. Las bandas de interés se pueden recortar con una cuchilla para proceder a la extracción correspondiente de ácido nucleico.