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Asignatura: Microbiología, Profesor: , Carrera: Biología, Universidad: UPV-EHU
Tipo: Apuntes
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Microorganismo, son micro: microscópicos, invisibles al ojo humano, son organismos: son seres vivos, poseen estructura celular, macromoléculas fundamentales como DNA (almacén información), RNA y proteínas (expresión información), poseen procesos de obtención de energía (ATP) y síntesis de macromoléculas comunes a todos los seres vivos. Principios de unidad estructural y bioquímica. Los virus: formados por proteínas y ácido nucleico, no tienen estructura celular, todos necesitan de otra célula (eucariota o procariota) para reproducirse: son parásitos obligados, dentro del huesped pierden su integridad y se reconstruyen muchas copias gracias a los materiales del huésped y en el medio son inertes y no pueden reproducirse. Los microorganismos son muy antiguos: La vida empezó con los microorganismos, unicos habitantes el 80% del tiempo de vida de la Tierra (3.200 ma). Los procariotas han estado solos 2.000 millones de años. Han tenido muchísimo tiempo para evolucionar: Adquirir capacidades, inventar mecanismos, desarrollar estructuras. Colonizar y adaptarse a nichos y situaciones: Viven a menos de 0ºC, viven a mas de 100ºC , soportan el peso de 11Km de agua, viven en ácidos a pH 1, etc. Son los antecesores del resto de formas de vida, todos han surgido de sus progenitores, los procariotas: dos grupos evolutivos distintos(microbios y macrobios), las arqueas más próximas a eucariotas que a bacterias, el término procariota no tiene significado filogenético, las bacterias y arqueas muchísimo más diversas filogenéticamente que todos los eucariotas juntos. Las consecuencias de su pequeño tamaño son de enorme importancia:
1. Relación s/v : Un organismos unicelular, cuanto más pequeño es, mayor es su relación s/v. Un procariota tiene una s/v 1.000 veces mayor que una célula animal. 2. Están mejor preparados para competir por recursos. 3. Pueden alcanzar velocidades de crecimiento impensables para “seres superiores” como el humano. 4. Regulan mejor los procesos. No compartimentan. Uso más eficaz del espacio y de la energía. Éxito. Versátiles metabólicamente. Diversos fisiológicamente: A nivel individual son muy versátiles: cambian con facilidad su metabolismo respondiendo a cambios en el medio ambiente. Los cambios son rápidos. Ej. anaerobios facultativos Como conjunto, son diversos fisiológicamente. Encontramos todo tipo de formas de vida. Unos viven como hongos, otros viven como plantas, otros viven como animales. o Obtención de energía o forma de vida exclusiva: Fotosíntesis anoxigénica utilizando H2 , H2S,… Quimiolitotrofia: “los comedores de piedras”: NH4+, NO2 - , H2S, Fe+2 , arqueas : consumen H2 y generan CH4, bacterias: consumen CH4 respirándolo con O2; Microorganismos fermentadores Han tenido miles de millones de años a su disposición Resumen: los procariotas son pequeños, relación s/v muy grande, velocidad metabolismo elevada, velocidad potencial de crecimiento muy elevada, procesado de nutrientes muy rápido. N = 2^g (N = número de procariotas g = número de generaciones o de duplicaciones). o Muchas bacterias pueden duplicarse en 20 min. Dos estrategias en relación con el crecimiento:
Los procariotas no necesitan crecer muy rápido para triunfar necesitan buenos mecanismos de adaptación necesitan cambiar rápido cuando el medio cambia, los han conseguido a lo largo de la evolución. Es casi más importante sobrevivir en carestía que crecer en bonanza. Cambio adaptación: cambio en el medio: estrés medioambiental, respuesta del procariota adaptación ejemplos: mecanismos sensores a nivel molecular o una respuesta de adaptación a nivel de expresión genética, fenotipo. Las procariotas, suponen una enorme cantidad de seres vivos, suponen del 60-100% del carbono estimado para las plantas, casi duplican la cantidad de C en forma de seres vivos, contiene unas 10 veces más N y P que los vegetales. Almacén de N y P. Abundan sobre todo en hábitats acuaticos, (océano abierto), y en los subsuelos. Son diversos y ubicuos: o En animales y otros seres vivos el criterio de especie es reproducción sexual con progenie fértil o En procariotas, con reproducción asexual, el criterio para pertenecer a una misma especie es compartir un nivel (elevado) de semejanza en el ácido nucleico. o El criterio de los procariotas es menos exigente. Aplicado a animales, orangutanes, gibones y humanos seríamos la misma especie. Concepto de especie: o Especie es una categoría que utilizamos para circunscribir patrones de recurrencia en la naturaleza (Hey, 2001). Es artificial.
1. Concepto fenético de especie (neutro) (Hull, 1997): similitud interna: multiples caracteres, Igualmente valorados 2. Concepto evolutivo de especie (mayor carga teórica) (Mayden, 1997), mantienen identidad en tiempo y espaci, trayectoria evolutiva, tendencia histórica. 3. Procariotas: concepto filo-fenético (Rosselló-Mora y Amann, 2001), no podemos hablar de evolución, el concepto tiene una base fenética clara. o Especie procariota : categoría que circunscribe a un grupo de cepas de origen monofilético y que se muestran coherentes tanto desde el punto de vista genómico como fenotípico, y que por ello se pueden distinguir de otros grupos semejantes. Monofilético: de filogenia basada en secuencia RNA ribosómico 16S Coherencia genómica: hibridación DNA-DNA y similitud (>70%) Coherencia fenotípica: multiples caracteres estructurales y metabólicos cuantificados fenéticamente.
Problema: Hay que cultivar, trabajar con un cultivo puro, no sabemos cultivar más del 99% de las bacterias ambientales. Simplificamos: utilizamos la secuencia de RNA ribosómico 16S. o Tasa de mutación baja. o Escaso poder de resolución para discriminar o Sirve para género pero se utiliza para estimas de especie (>97%)