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Apuntes de Biotecnología Genómica: Unidad de Aprendizaje Bioinformática y Programación, Apuntes de Bioinformática

Universidad Autónoma de Nuevo León (UANL)Bioinformática

Documento que contiene ejercicios y soluciones relacionados con la unidad de aprendizaje de biotecnología genómica, específicamente la parte de bioinformática y programación. Contiene ejercicios de genbank y uniprot, además de programas de perl para manipular secuencias de adn y proteínas.

Tipo: Apuntes

2019/2020

Subido el 02/09/2021

valeria-fonseca-17
valeria-fonseca-17 🇲🇽

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bg1
UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE NUEVO LEÓN
FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
LICENCIADO EN BIOTECNOLOGÍA GENÓMICA
Producto Integrador de Aprendizaje de segundo parcial de la unidad de aprendizaje
de BIOINFORMÁTICA Y PROGRAMACIÓN
Nombre del estudiante: Valeria Janeth Fonseca Manzano Matrícula: 1973148
Gpo: 425
1. Utilice los siguientes accesion number D12591 y U49742. Conteste lo que se le pide tanto
para GenBank como Uniprot.
a. GenBank
i. La longitud en pares de bases del gen.
ii. El organismo del cual se obtuvo el gen.
iii. Indique si es DNA genómico o extra genómico.
iv. ¿Cuál de ellos contiene exones y cuantos exones?
B. Uniprot v. Identificar en que parte de la célula se encuentra la proteína.
vi. En el apartado de Pathol/Biotech; indicar si está relacionada a una
enfermedad.
GenBank
Datos/programa
D12591
U49742
La longitud en pares de
bases del gen.
1364 bp
6953 bp
El organismo del cual se
obtuvo el gen.
Lactobacillus casei
Homo sapiens
DNA genómico o extra
genómico.
ADN Genómico
Adn Genómico
¿Cuál de ellos contiene
exones y cuantos exones?
No contiene exones
Contiene 5 exones
pf3

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¡Descarga Apuntes de Biotecnología Genómica: Unidad de Aprendizaje Bioinformática y Programación y más Apuntes en PDF de Bioinformática solo en Docsity!

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE NUEVO LEÓN

FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS

LICENCIADO EN BIOTECNOLOGÍA GENÓMICA

Producto Integrador de Aprendizaje de segundo parcial de la unidad de aprendizaje de BIOINFORMÁTICA Y PROGRAMACIÓN

Nombre del estudiante: Valeria Janeth Fonseca Manzano Matrícula: 1973148

Gpo: 425

  1. Utilice los siguientes accesion number D12591 y U49742. Conteste lo que se le pide tanto para GenBank como Uniprot. a. GenBank i. La longitud en pares de bases del gen. ii. El organismo del cual se obtuvo el gen. iii. Indique si es DNA genómico o extra genómico. iv. ¿Cuál de ellos contiene exones y cuantos exones? B. Uniprot v. Identificar en que parte de la célula se encuentra la proteína. vi. En el apartado de Pathol/Biotech; indicar si está relacionada a una enfermedad.

GenBank

Datos/programa D12591 U

La longitud en pares de bases del gen. 1364 bp 6953 bp El organismo del cual se obtuvo el gen. Lactobacillus casei Homo sapiens DNA genómico o extra genómico. ADN Genómico Adn Genómico ¿Cuál de ellos contiene exones y cuantos exones? No contiene exones Contiene 5 exones

vii. La longitud de la proteína. viii. La masa molecular de la proteína.

  1. Escriba un programa de perl que le permita abrir el archivo iupac.txt, en esta secuencia están presentes los nucleótidos del DNA (A, T, G, C) junto con las letras que se muestran en la columna de la izquierda. Mediante Perl realice el cambio de las letras que están presentes en la columna de la izquierda por cualquiera de los nucleótidos que corresponden.

IUPAC nucleotide code Base

R A or G

Y C or T

S G or C

W A or T

K G or T

M A or C

B C or G or T

D A or G or T

H A or C or T

V A or C or G

N any base

  1. Escriba un programa de perl que le permita hacer la cuenta de cada uno de los aminoácidos presentes en el archivo amino.txt

Uniprot

Datos/programa D12591 U

Identificar en que parte de la célula se encuentra la proteína. Citoplasma Membrana celular indicar si está relacionada a una enfermedad. No lo está No lo está La longitud de la proteína. Longitud de 326 Longitud de 348 masa molecular de la proteína.