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Tipo: Ejercicios
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Clasificación: OBLIGATORIA Modalidad: MIXTA Ubicación: TERCER SEMESTRE Profesor: Dr. José Alberto Ramos Zapata OCTUBRE 2021 Km. 15.5 carretera Mérida – Xmatkuil, Apdo. Postal 4-116 Itzimná, Mérida, Yucatán, México. Tel. (999) 942- 32 - 00 Fax. (999) 942- 32 - 05
COMPETENCIA DE LA UNIDAD Describe las características de la molécula de ADN explicando porque es una molécula informativa, la forma en la que se organiza y conserva, de forma clara, ordenada y crítica. 1 .1. Completa la imagen colocando el nombre de las etapas (seis) que componen la fase M y describe las características principales de las fases G1, S y G 2 e indica el nombre con el que se conoce a estas tres fases en conjunto. 1.2. De acuerdo con la composición de bases que determinó Chargaff, ¿Cuál de las siguientes caracterizaría a cualquier muestra de ADN?: a) [A]+[T]= [G]+[C] b) [A]/[T]= 1 c) [G]=[C] d) [A]+[G]= [T]+[C]
1.3. Si el contenido de C de una preparación de ADN de doble cadena es 15%, ¿cuál sería el contenido de A? 1.4. De las siguientes cadenas de nucleótidos: a) obtén sus complementarias, b) indica cual es la que requiere más temperatura para desnaturalizarse, menciona porque, c) obtén la lista de aminoácidos a la que da lugar cada cadena. 1 5’ ATAGTAGCTGACGTAGCCTT 3’ 2 5’ TTAGTACACGTATTAATGCT 3’ 3 5’ CAGACCTGATCGATCGATCG 3’ 1.5. Observa la siguiente cadena sencilla de ADN: 5’-ATGCCCCACGCTACGAAAATGTCATGA-3’ a) Escribe la secuencia de la hebra complementaria b) Escribe la secuencia de ribonucleotidos a la que da lugar c) Escribe la secuencia de aminoácidos a la que da lugar al trascribirse la cadena anterior d) Indica cuantos puentes de hidrógeno posee la cadena de ADN que origina esta proteína. 1.6. Si un gen viral mide 900 pares de bases y posee 400 pares de G-C, responde lo siguiente a) ¿Cuantos intrones posee? b) ¿Cuántos puentes de hidrogeno posee esta secuencia? c) ¿Cuántos aminoácidos mide la proteína? d) Si adopta la estructura B del ADN, ¿cuantas vueltas tendrá? e) ¿Cuántos ribonucleótidos tendrá la cadena de ARN que se forme después de la transcripción? 1.7. Con la siguiente secuencia de ADN, responde las preguntas: 5´ GCCAAGCAACTCATTCAAGGT 3´ 1 2 3 a) Escribe la secuencia de aminoácidos suponiendo que la traducción comienza desde la base marcada con 1, luego con 2 y después con 3. b) Si una base extra (G) se inserta entre las bases C y T en las posiciones 10 y 11, iniciando la traducción en la base 1, ¿cuál sería la nueva secuencia de aminoácidos? Escríbela. c) Si en lugar de una inserción ocurre la delección de la base en la posición 10 (C), ¿Cuál sería la nueva secuencia de aminoácidos, iniciando la lectura en la base 1?
Integra la forma de perpetuación y transmisión de información la molécula de DNA en los organismos para la resolución de problemas teóricos de forma coherente Explora los procesos celulares que permiten la integración de las fases del ciclo celular con los procesos de duplicación de la información genética en estudios de casos con argumentos congruentes y lógicos
2. 1. En el siguiente dibujo se muestra un esquema de la síntesis de ADN en una horquilla de duplicación del cromosoma de E. coli****. Complete las oraciones que se encuentran más adelante de acuerdo con lo que observa en el esquema y lo que sabe del proceso. a. La _____________ es necesaria para que las hebras molde puedan exponer sus bases, ya que rompe los puentes de hidrógeno que une dichas hebras. b. La ADN polimerasa ____ es la enzima que se encarga de la síntesis de la mayor parte del ADN duplicado. c. La síntesis de ADN, a pesar de no ser reparativa, no puede proseguir sin las actividades "correctivas" de la enzima ADN _________________, que permite la eliminación de iniciadores y el rellenado de los huecos. d. La hebra retrasada se genera debido a que la dirección de las dos hebras molde es ______paralela y en virtud de que las enzimas que
sintestizan ácidos nucléicos sólo pueden seguir la dirección __'-
___'. e. La acción de la helicasa es complementada por dos proteínas, por un lado la _______________ permite resolver los nudos que se forman en el ADN superenrrollado al fundirse la doble hélice y por otro lado las _______________ permiten que los segmentos fundidos no se cierren antes de tiempo. f. La actividad reparativa que se requiere durante la síntesis del ADN permite la formación de muchos cortes en los enlaces fosfodienter que no pueden ser eliminados por las polimerasas, estos son reparados por la acción de la ADN _______________. 2.2. Si una bacteria posee un genoma lineal de 240 kb y su replicación es unidireccional (20 puntos): a) ¿Cuántos minutos tarda en replicar todo su genoma? b) ¿Aproximadamente cuantos fragmentos de Okazaki formará en la cadena cautiva y cuantos en la habrá nueva? c) ¿Cuantos primers (cebadores) se sintetizarían en cada cadena? 2.3. En el siguiente cuadro se muestran las ADN polimerasa que presentan los eucariotas, complementa el cuadro con la información faltante: (I) (II) (III) Localización Función
2. 4. Cuando en un organismo hipotético cuyo complemento cromosómico es 12XX, se lleva a cabo la replicación, contesta lo siguiente: a) ¿Cuantos cromosomas tiene en G1? b) ¿Cuantos cromosomas tiene en G2? c) ¿Cuantas cromátides tiene en G2? d) ¿Cuantos cromosomas sexuales tiene en G2? e) ¿Cuantas cromátides tiene en la profase de la mitosis? 2. 5. Una célula epitelial de un mamífero comienza su replicación, el gen Mam mide 2.6 Kb y se replica de manera unidireccional, contesta: a) ¿Cuántos segundos tardará en replicarse completamente? b) ¿En qué parte del ciclo celular se lleva a cabo la síntesis de su ADN? c) ¿En cuántos nucleosomas se encuentran enrollados esta longitud de ADN?
Corte de bases ADN glicosilasas, AP endonucleasas, ADN ligasa y ADN polimerasa I ABC exinuclesa, ADN ligasa y ADN polimerasa I Lesiones que provocan cambios estructurales Reparación directa 6 - metilguanina, dímeros de pirimidina
Explica el proceso de regulación de la expresión genética (transcripción y traducción) en los seres vivos en estudios de casos con argumentos congruentes y lógicos
3. 1. En un cuadro compara todos los factores que intervienen en la traducción del ARNm en eucariotas y en procariotas. Elementos Eucariotas Procariotas Comparación Factores de Iniciación Factores de Elongación Factores de Liberación Factor de Reciclamiento de los Ribosomas 3.2. Describe los diferentes tipos de ARN que existen en los eucariotas, su función y las enzimas que los sintetizan. 3.3. Describe las modificaciones post-transcripcionales que suceden en los transcriptos primarios de ARNm, ARNr y ARNt. 3 .4. Construye un cuadro comparando los componentes de los ribosomas en eucariotas y en procariotas (número de proteínas, cadenas de ARN, etc.). Organismo Procariotas (70S) Eucariotas (80S) Subunidades RNA ribosomal Proteínas
3.9. Una cadena de ADN con una longitud de 300 pares de bases (pb) al transcribirse da lugar a una cadena de _______________________ con una longitud de 300 pb, sin embargo, al salir del núcleo la cadena mide únicamente 210 pb ya que se removieron las secuencias llamadas _____________ durante el proceso ________________. ¿Cuánto medirá la cadena de aminoácidos a la que da lugar? a) 60 aminoácidos b) 210 aminoácidos c) 70 aminoácidos d) 21 aminoácidos ¿Cuál será la combinación de ribonucleótidos con el que se inicie la síntesis de proteínas? a) AGG b) AGU c) UGA d) AUG ¿Con que combinación terminará? a) UAG b) UAC c) UAU d) UGG 3.10. En el siguiente esquema se muestra una etapa del proceso de traducción en ______________________, que se llama ______________________. Completa el esquema agregando los nombres en las líneas.
Fundamenta el uso de las herramientas moleculares para la resolución de problemas teóricos y prácticos con seres vivos de manera creativa 4.1. La siguiente figura representa un gel de secuencia de ADN de un fragmento de 45 bp. Escriba la secuencia del fragmento original. a) 5' GTAAGGACTCATCTATTGTTAAAACTACCGATACAAACTTCACG 3' b) 5' CATTCCTGAGTAGATAACAATTTTGATGGCTATGTTTGAAGTGC 3' c) 5' GCACTTCAAACATAGCCATCAAAATTGTTATCTACTCAGGAATG 3' d) 5' CGTGAAGTTTGTATCGGTAGTTTTAACAATAGATGAGTCCTTAC 3' e) Ninguna de las cuatro secuencias anteriores corresponde al gel presentado.
c) ambos mapas son correctos. d) no hay información para saber si A o B es el correcto, pero ambos pueden ser. e) ninguno de los mapas es correcto. 4.4. Se tiene un plásmido con un gen de resistencia a gentamicina y otro de resistencia a ampicilina. Este plásmido posee un sitio único de corte para la enzima Hind III que mapea dentro del gen de resistencia a gentamicina. Se introduce un fragmento de ADN de interés en el sitio de Hind III (cortando ambos fragmentos de ADN con esta enzima), se liga el plásmido y se transforman bacterias con dicho material genético. Luego se plaquean colonias en tres cajas de cultivo. La 1 no lleva antibiótico, la 2 lleva gentamicina, la 3 lleva ampicilina y la 4 ambos antibióticos. Las colonias que portan el ADN de interés: a) crecen en las cajas 1 y 4. b) crecen en las cajas 1 y 3. c) crecen en las cajas 1 y 2. d) sólo crecen en la caja 1. e) crecen en todas las cajas. 4.5. El resultado de la digestión de un fago lineal con longitud total de 7 kb, dio como resultado los siguientes tamaños de fragmentos: Enzimas Tamaño del(os) fragmento(s) XbaI HindIII BamHI X/B X/H B/H 3.5 kb 6.0, 0. 5.5, 1. 3.5, 2.0, 1. 3.0, 0. 5.0, 1.0, 0. ¿Cual de los siguientes mapas cromosómicos corresponde a los resultados anteriores? a) HindIII Xbal BamHI HindIII
b) HindIII BamHI Xbal HindIII c) BamHI Xbal BamHI HindIII d) BamHIXbal BamHI HindIII 4.6. En el siguiente esquema se representan los resultados obtenidos por medio de una técnica común para secuenciar el ADN, completa las oraciones que se encuentran más adelante de acuerdo con lo que observas en el esquema y lo que sabes del proceso.
4.9. Completa el siguiente cuadro, escribiendo la secuencia de reconocimiento de las Endonucleasas de Tipo II (enzimas de restricción) y el tipo de borde que generan: Endonucleasa Secuencia de reconocimiento Tipo de borde EcoRI GAATTC Pegajoso BamHI BglII PvuI PvuII HindIII HinfI Sau3A AluI SHaeIII NotI ECOGNITION BLUNT OR
4. 10. En el siguiente esquema se muestra la amplificación por PCR de una cadena de ADN empleando cebadores que amplifican zonas no conocidas y que son hipervariables ( fingerprints ), se emplean para conocer el polimorfismo genómico. En el esquema se muestra que el cebador se ha hibridado en las zonas 2 a 6. Subraya la respuesta correcta: a) 1 ) El fragmento A es sintetizado a partir de las secuencias hibridadas en las zonas: a) 4 y 5 b) 2 y 3 c) 2 y 5 2 ) El fragmento B es sintetizado a partir de las secuencias hibridadas en las zonas: a) 2 y 3 b) 3 y 6 c) 5 y 6