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Transporte de membranas, Pepa Hazen
Tipo: Apuntes
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Proceso imprescindible para que se mantenga la homeostasis en la células eucarióticas.
Se considera el orgánulo de mayor tamaño en una célula eucariota. Consta de dos regiones:
Siempre cualquier proteína inicia su síntesis en el citosol en polisomas. Luego tenemos dos vías:
Va a depender del péptido o secuencia señal que dirige a la proteína a su destino correspondiente, consiste en una secuencia de unos 20 aminoácidos que puede estar en el extremo N o C terminal o bien en situaciones internas de la proteína y dependiendo del destino que va a tener encontramos distintos péptidos de distinta longitud y estructura. Puede ser cortada o ser mantenida una vez llega al destino. Las proteínas que se dirigen para terminar su sintesis en el RER son las proteínas de sintesis cotraduccional. Pueden ser proteínas solubles (destinadas a la secreción) o transmembranosas hasta ser liberadas por la membrana plasmática por exocitosis. Las proteínas solubles son todas las destinadas a la secreción. Van a caer a la luz de retículo endoplásmico y van a ser transferidas por estructuras de transporte hasta ser liberadas por la membrana plasmática. Estas proteínas también pueden pertenecer al interior de orgánulos como las residentes del retículo endoplásmico, Golgi o los endosomas por ejemplo. Las proteínas transmembrana no caen a la luz de retículo endoplásmico sino que quedan embebidas en la membrana. Si es del retículo endoplásmico se quedará formando parte de la membrana, pero si pertenece a otro orgánulo saldrá en vesículas desde el retículo manteniendo la misma topología que tenía en el retículo y por fusión de membranas llegará a formar parte de la membrana diana. En función de si una proteína es soluble o transmembrana, el proceso esa formación cotraduccional, aunque tienen una base común puede variar. Las proteínas transmembranosas tienen diferentes señales de parada en su traducción. Una primera señal para ir al retículo endoplásmico pero aparecen más señales que indicaban una parada, esa región quedaba embebida en la membrana y a continuación hay otra señal que dice que siga la traducción y así sucesivamente; dependiendo de los dominios transmembrana que tenga la proteína. En el caso de la translocación de proteinas al retículo se producía al a vez de esa translocación una N - glicosidación y un plegamiento y control de calidad de plegamiento. El polisacárido incorporado en la glicosidación es siempre el mismo para todas las proteínas. El enzima encargado de la glicosidación es la oligosacárido - transferasa. En la membrana del retículo endoplásmico hay un lípido, el diolicol fosfato, que es el que va a proporcionar al retículo 2 grupo de olgosacáridos que se transfieren en bloque a la proteína. El polisacárido constaba de un residuo de N - acetilglucosamina , 9 manosas y 3 glucosas. Una vez completo el oligosacárido, la oligosacárido-transferasa lo transfiere desde el dolicol - fosfato hasta ese primer residuo de Asp de la proteína. Este proceso de glicosidación es fundamental para regular el plegamiento y el control de calidad. La proteína se glicosida tantas veces como residuos de asparagina haya. No solo se necesita que se produzca esta glicosidación, sino que va a sufrir otro tipo de modificaciones, tanto durante la importación como después que afectan al plegamiento de la proteína. Van a actuar una serie de chaperonas y de enzimas relacionados con el plegamiento de las proteína: la calnexina (membrana del retículo endoplásmico) y la calreticulina (lúmen del retículo endoplásmico), son proteínas proteínas residentes. Además de estas proteínas tenemos la Protein disulfuro - isomerasa que producían enlaces para favorecer el plegamiento.
al ERGIC con forma túbulo-vesicular. Estas estructuras tienen carga que viene liberado del retículo. A partir de ahí se mueve al complejo de Golgi. GOLGI Es una estructura en forma de cisternas en forma de de más o menos aplanadas con polaridad cis-trans. En la región próxima al ERGIC encontramos la red cis , con aspecto tubular, a continuación están las cisternas medianas , las cisternas trans y por último la red trans golgi. Va a llevar a cabo una serie de funciones:
TIPOS DE ESTRUCTURAS DE TRANSPORTE Hay múltiples transportadores que mueven miles de moléculas entre todos los compartimentos que participan en el traspaso de componentes que hemos visto antes. Todos esos compartimentos están recibiendo y emitiendo material para procesarlo de una manera u otra. Este movimiento tiene que ser muy eficiente y está basado fundamentalmente en carriers o transportadores que se mueven tanto en sentido retrógrado ( COP I ) como anterógrado ( COP II ) como en ambos ( Clatrina ). Todos estos transportadores implican a pequeñas vesículas (60-80nm) como a estructuras tubulares elongadas o grandes estructuras. Tenemos revestimientos en todas las estructuras, como las anteriormente descritas. Para que el movimiento tenga lugar se necesitan:
REVESTIMIENTO COP I La GTPasa que recluta las cubiertas es Arf1 y la proteína que actúa como GEF van a ser proteínas de la membrana del Golgi. Arf1 unida a GDP es citosólica, es activada por la proteína de la membrana del Golgi y va a exponer esa cola de ácido graso que la permite unirse a la membrana. A continuación se une el coatómero (revestimiento de COP I), 7 subunidades proteicas que se unen en bloque. El coatómero completo se une a la Arf1 activa. También se encarga de reclutar las cargas. Con las cargas reclutadas, al irse uniendo distintos coatómeros se va a activar el ArfGAP de Arf1 ( GAP devuelve el estado inactivo a la GTPasa ) y es el que va a estimular la hidrólisis. Antes de que esto ocurra, la escisión de la vesícula es a partir de Arf activa (unida a GTP) la que va a formar el anillo y escindir la vesícula y el GAPArf produce la hidrólisis del GTP y desensamblar la cubierta de COP I. REVESTIMIENTO DE CLATRINA Aparece revistiendo vesículas y estructuras tubulares en distintas regiones de la célula durante ese tráfico intracelular. Algunas vesículas que brotan de la membrana plasmática, en la región trans Golgi y algunos endosomas. Las proteínas citosólicas del reclutamiento de cubiertas es ARF1 y ARF6 dependiendo de donde se forme el revestimiento de clatrina. Tenemos un caso particular, la clatrina no reconoce cargas y necesita otras proteínas que van a actuar como adaptadores para reconocer y reclutar las cargas que lleven este tipo de transportadores. Estos adaptadores forman parte del revestimiento total de la estructura, dentro están los adaptadores y fuera está la clatrina. La clatrina tiene una estructura denominada trisquelión. Hay tres cadenas pesadas y tres ligeras y mediante la ayuda de proteínas accesorias va a ir formando estructuras tipo hexágono y tipo pentágono hasta dar lugar a un revestimiento de 26 trisqueliones. Los adaptadores son de dos tipos, AP-1,2,3,4 , ( 5 recién descubierto se desconoce función) y GGAs. Ayudan a la clatrina en el reconocimiento de las cargas. En estos adaptadores están localizados en las distintas zonas donde vamos a encontrar el revestimiento de clatrina. La región central de estos adaptadores sería la responsable de reclutar y reconocer la carga en la correspondiente membrana, mientras que los otros dominios externos van a interaccionar con la clatrina y las proteínas accesorias. Dependiendo de en qué lugar se está produciendo un revestimiento de clatrina vamos a tener unos adaptadores u otros.
Si se produce este revestimiento en la membrana plasmática o en determinadas regiones del compartimento endosomal, voy a necesitar ARF6 que funciona con AP-2. En ambos casos la escisión de la vesícula la produce la dinamina , una GTPasa citosólica que se arrolla alrededor del cuello de la vesícula hasta que la libera y una vez que está liberada se produce el desensamblaje de la clatrina. Para ello necesitamos la chaperona Hsc70 ayudada por distintos cofactores, pero fundamentalmente de la proteína auxilina. PROTEINAS MOTORAS Todas las vesículas o estructuras tubulares que se van a mover en esas rutas secretoras o endocíticas se van a ayudar de los los microtúbulos son los elementos del citoesqueleto que más van a actuar en estos movimientos de transporte. Cuando las distancias soon largas, los microtúbulos son los elementos del citoesqueleto que más van a actuar en el movimiento de las vesículas.
La maduración del ERGIC es lo que translada la carga al complejo de Golgi. Las proteínas que llevan a cabo el movimiento retrógrado son por ejemplo las proteínas residentes del retículo endoplásmico con su señal específica y que si bien llevan en su estructura una señal para permanecer en el retículo endoplásmico, ocurre que en ocasiones, al formarse las vesículas COP II pueden salir alguna de esas proteínas. En ese caso, una vez que llegan al ERGIC, van a ser llevadas al retículo endoplásmico. En el ERGIC y en el complejo de golgi también hay ese tipo de proteinas que deben se devueltas. Todas las proteínas que deben volver a su compartimento van a ser transportadas en vesículas COP I. Lo mismo pasa con las proteínas transmembrana, con esa señal de retención que se encuentra también en el ERGIC y el Golgi hace que permita la vuelta de las proteínas a su lugar de residencia. Transporte y reciclaje en el Golgi Lo microtúbulos van a ser los carriles que utilice el complejo de golgi para liberar los elemento que llevan las cargas correspondientes. Si no se sintetizan estos microtúbulos, se observa que la estructura del Golgi se fragmenta y pierde su forma. Dentro del complejo de Golgi hay mucha más actividad en cuanto a transporte. En el complejo de Golgi teníamos una red cis , aquella que se está formando por maduración del ERGIC y una region trans Golgi que se fragmenta para liberar la carga. En esas zonas y en los laterales del complejo se ha visto que hay una mayor actividad de transporte que en la zona central y se denominan zonas compactas. Hay dos mecanismos para explicar como se mueven las cargas en el complejo de Golgi:
La formación de este retrómero podría se equivalente a la formación de una vesícula revestida. Siempre va a haber una GTPasa ( Rab7 ) que actúa para reclutar al complejo de proteínas VPS. Una vez reclutadas las proteínas del complejo VPS se van a reclutar las nexinas y se sitúan en la membrana. Al reclutarse las nexinas se empieza a curvar la membrana para formar la vesícula. Va a ayudar un tercer complejo, el complejo WASH que provoca la polimerización de actina para ayudar a empujar la formación de la vesícula. A continuación las nexinas 5 y 6 se unen al p de la dineína, favoreciendo el movimiento a través de los microtúbulos. Después actúa una GTPasa para librar la estructura de la membrana del compartimento endosomal, estas GTPasas son EHD1 y dinamina. Tras todo este proceso, la vesícula pierde el revestimiento. Desde el compartimento endosomal, los endosomas tempranos, es donde se va a producir la mayor parte del transporte retrógrado hacia la red trans golgi, pero el compartimento endosomal no solo tiene endosomas tempranos sino que también los tiene tardíos pueden devolver en pequeñas vesículas algunos materiales a la red trans golgi. En este caso, lo que funciona es un complejo formado por una GTPasa Rab9 y TIP47 , un efector de la GTPasa. La Rab9 ayudado de TIP47 se encuentra en la membrana de estos endosomas tardíos que crea pequeñas vesículas desnudas para devolver algunos receptores para reciclarlos a la red trans golgi. RUTA ENDOCÍTICA Los procesos de endocitosis son procesos fundamentales para que las células eucarióticas sean capaces de internalizar productos o macromoléculas y para internalizar determinadas determinadas proteínas de membrana como pueden ser los receptores ( permeasas , canales , etc.) para controlar las rutas de señalización en una célula. Los mecanismos de endocitosis se dedican al reciclaje de receptores y canales más que a la captación de moléculas desde el exterior. Van a ser los que regulen las vías de señalización. Cuando analizamos una ruta endocítica, noss damos cuenta que hay distintios tipos de vias por las que esas proteínas de membrana o estructuras externas se pueden incorporar. Todas tienen en común que una vez que se incorporan van al compartimento endosomal porque todo lo que incorpora la célula es o bien para reciclarlo o bien es para degradarlo. Una excepción son los procesos de fagocitosis , que la carga va directa al lisosoma. Dentro de los posibles mecanismos de entrada tenemos las endocitosis dependientes de clatrina , dependientes de caveolina y otra serie de mecanismos descubiertos más tarde denominados de manera global como endocitosis independientes de clatrina y caveolina. La endocitosis mediada por clatrina es constitutiva y se ocupa casi del 60% de todos los receptores de membrana. En determinadas situaciones experimentales se observó que inhibiendo esta ruta de endocitosis por clatrina se seguían incorporando receptores de membrana muchas veces con una velocidad mucho menor, pero en otras con una velocidad bastante alta. Por último está el mecanismo de macropinocitosis. Este mecanismo aunque se puede activar por determinados receptores, otras veces lo hace de manera espontánea, por ejemplo cuando hay muchas rutas de señalización activa en na célula, esta tiene que rebajar esa señalización. Si tiene que retirar uno a uno los receptores por endocitosis mediada por clatrina podría tardar demasiado tiempo, mientras que la pinocitosis, que permite la entrada de una gran cantidad de material permite que una región bastante amplia de la membrana plasmática se incorpore al interior de la célula, parando varias rutas de señalización a la vez. En todos los casos se va al compartimento endosomal, que depende del citoesqueleto, tanto actina como tubulina. La entrada de las partículas cuando el transporte se tiene que ir a distancias largas, suelen actual los microtúbulos y sus correspondientes proteínas motoras, mientras que si el movimiento es más corto pueden intervenir los filamentos de actina. COMPARTIMENTO ENDOSOMAL El compartimento endosomal no se trata de un conjunto de orgánulos, sino de un continuo de estructuras pleiomórficas que van madurando poco a poco y cada una de ellas realiza sus propias funciones.
Un endosoma temprano es capaz de llevar a cabo situaciones de reciclaje bastante rápidas. También lo hace un endosoma tardío. Sin embargo los cuerpos multivesiculares son estructuras más bien de transporte y los lisosomas serían en sí mismos la zona del compartimento donde se produce la digestión (solo están activas en ellos las hidrolasas ácidas ). El lisosoma es además el único que no tiene contacto ni con la red trans golgi ni con la membrana plasmática. Esta clasificación del compartimento endosomal tiene mucho que ver con el pH , que va a cambiar a lo largo del proceso de maduración. En los endosomas tempranos tenemos un pH de 6,5 que va siendo inferior a medida que avanzamos en esa maduración. Un endosoma tardío tiene un pH de 4,5 igual que el del lisosoma y este cambio de pH permite esta primera clasificación porque los ligandos y receptores se van a separar. Dependiendo de qué tipo de ligando y receptor que sean se van a separar en el endosoma temprano o en el tardío. En los endosomas tempranos se van a producir el reciclaje de la mayoría de los receptores de la membrana plasmática. Los receptores LDL para la entrada de las partículas LDL por endocitosis mediada por clatrina, en el momento en que llegan al compartimento endosomal pueden ser reciclados. Sin embargo hay otro tipo de receptores, como los receptores de M6P, que si bien pueden ser reciclados a través de endosomas de reciclaje desde el endosoma temprano, pueden mantenerse hasta un pH de 4,5 a sus ligandos y por lo tanto en el endosoma tardío también podrían ser reciclados hacia la red trans golgi. Aparte del reciclaje de receptores y ligandos hay un proceso de degradación en el compartimento endosomal. En este sentido, en los endosomas tempranos ( zona vacuolar ), cuando se trata de un procesos de degradación, pueden sufrir un proceso de maduración que los va a convertir en cuerpos multivesiculares, estructuras de transporte, que no modifican la carga que llevan. Para que los endosomas tempranos s e transformen en cuerpos multivesiculares acumulan vesículas intraluminares que clasifican la carga que va a ser degradada. Las vesículas intraluminares se forman por invaginación de la membrana del endosoma temprano. Para que se produzcan las vesículas se tienen que dar una serie de circunstancias.
Mediada por ARF6 : parece ser que no hay revestimiento, son vesiculas y la carga son moléculas de adhesión (cadherinas-E, integrinas, etc.). La importancia de este tipo de endocitosis mediada es que va a retirar cadherinas e integrinas de la membrana, que hacer que las células pierdan la adhesión que tenían con otras celulas, como en el caso del cáncer, que produce la transmisión epitelio mesénquima. El sistema que utiliza este tipo de endocitosis para retirar la vesícula se desconoce su funcionamiento, pero se cree que es una proteína relacionada con la dinamina. Flotilinas : las vesículas están sin revestimiento, la carga son proteínas ancladas por glicosil- fosfatidil-inositol GPI y algunos proteoglicanos. Un tipo de endocitosis muy especializado en recilar y asegurar la composición de los rafts lipídicos. El sistema de retirada de las vesículas de la membrana también se piensa que es dinamina , pero no está claro. Mediada CLIC/GEEC : ( CLIC = carriers dependientes de clatrina sin revestimiento)Se forma una estructura tubular (CLIC) y para que se forme la estructura tubular participan las galectinas. Esto nos dice que son procesos donde se localiza un raft lipídico, pero vuelve a ser un mecanismo de control de los rafts. La parte de GEEC (compartimentos endosomales enriquecidos en GPI) se piensa que el compartimento que surge del proceso de endocitosis tiene cierto caracter ácido. Procesos de endocitosis encargados de incorporar alguna toxina : ya sea de plantas o bacterias. El carrier que se forma es también tubular. La carga que se incorpora son toxinas y algunos autores dicen haber visto incorporación de galectinas por esta vía pero otros dicen que es por contaminación. En esta situación nos encontramos con que el sistema de separación de la membrana no es conocido por el momento. Se ha visto de forma global que todos los mecanismos de endocitosis son utilizados por virus, bacterias y toxinas en general. Este mecanismo de endocitosis que utilizan toda esta serie de patógenos, no lo hacen por mecanismos de reciclaje, evitan la vía de degradación e intentan ejercer un efecto tóxico en las células. En el caso de la endocitosis mediada por clatrina se pueden incorporar los virus del VIH, toxinas, etc. En estos tipos de endocitosis donde se sabe que pueden entrar patógenos se está estudiando para utilizar determinados inhibidores para no dejar entrar a los patógenos. Alternativamente se está utilizando otro inhibidor que evita que se desorganice el revestimiento de clatrina. Lo que ocurre es que se produce una vesícula de clatrina, pero no pierde el revestimiento. El reciclaje de componentes desde un endosoma temprano a la trans golgi se puede bloquear con iones Mn+ , que impide que se organice el retrómero. No es porque no queramos que el endosoma temprano no devuelva nada a la trans golgi, sino porque hay determinados tipos de patógenos como algunas toxinas que cuando llegan a los endosomas tempranos, en lugar de seguir la vía de degradación pueden seguir mecanismos específicos para infectar el complejo de Golgi. Por lo que bloqueamos ese tipo de toxinas que tiene como diana el aparato de Golgi. De la misma manera, determinados procesos de macropinocitosis como el de la salmonella , se ha conseguido que ese macropinnosoma de la bacteria no se pueda unir con un endosoma tardío y se pueden bloquear los movimientos dentro de la célula.