TP : Transfert horizontal
1. Hypothèse (verticale / ancêtre) : un gène codant pour II-AFP existait chez un ancêtre
commun des poissons froids ; il a été conservé dans les lignées vivant en eaux froides et
perdu dans certaines lignées vivant en eaux chaudes.
2. Hypothèse (transfert horizontal) : le gène II-AFP a été transmis horizontalement d’un poisson à un
autre (par transfert génétique entre espèces vivant dans le même milieu), expliquant sa présence
chez espèces non apparentées.
But du TP : tester la validité de ces hypothèses à partir des séquences nucléotidiques/protéiques et des
arbres phylogénétiques fournis.
pourquoi l’hypothèse horizontale plutôt que l’hypothèse verticale
1. Incongruence topologique : l’arbre d’espèces (ARNr) n’est pas identique à l’arbre du gène (II-AFP).
Une transmission strictement verticale aurait produit des arbres concordants.
2. Similitude élevée entre II-AFP de poissons non apparentés : des séquences très proches dans
des espèces éloignées (selon ARNr) suggèrent un transfert récent plutôt que une conservation
depuis un ancêtre très ancien (qui aurait engendré beaucoup plus de divergences).
3. Perte multiple improbable : pour expliquer la distribution par héritage vertical, il faudrait invoquer
de nombreuses pertes indépendantes du gène dans plusieurs lignées — scénario moins
parcimonieux que l’hypothèse d’un transfert récent.
4. Argument écologique : le transfert horizontal est plausible si des espèces cohabitent dans le même
milieu (eaux polaires), augmentant les chances d’échanges moléculaires (via vecteurs, parasites,
transferts d’ADN environnemental, etc.).
