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Appunti sulla glicolisi (chimica organica)
Tipologia: Appunti
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è catalizzata dall’ enzima esochinasi che utilizza una molecola di ATP, la quale si trova nel sito arrivo dell’ enzima coordinata ad uno ione Mg o Mn. il glucosio viene fosforilato sul C6 e si forma il glucosio 6-fosfato ESOCHINASI: è un enzima allosterico, formato da due domini a forma di lobo. all’interfaccia dei due l’onu si trova il sito attivo dell’ enzima e ospita il glucosio e l’ATP. inizialmente il sito arrivo è vuoto, poi ATP entra e iniziano a stabilitisi le prime deboli interazioni e l’enzima cambia forma e un lobo ruota di 19 gradi rispetto all’altro (avviene per intrappolare il glucosio e direzionarlo in modo che l’OH del C6 si trovi vicino al fosfato dell’ATP). il motivo di questa chiusura sta anche nel fatto che si eviti l’ingresso di acqua che idrolizzerebbe l’ATP.
è regolata e catalizzata dalla fosfofruttochinasi (PFK) è la tappa di regolazione principale della glicolisi. Questo enzima possiede diversi domini e alcuni contengono siti di regolazione. la PFK presenta il sito aperto al fruttosio 6-fosfato a seconda delle condizioni energetiche della cellula: se la concentrazione di ADP o AMP sono elevate allora il sito arrivo sarà aperto, questo accade perché se questi hanno una concentrazione alta significa che di conseguenza l’ATP avrà una bassa concentrazione e sarà quindi attivata la glicolisi in modo tale da produrre ATP. ADP e AMP si infilano nei loro siti di regolazione e la PFK capisce che deve assumere una conformazione attiva per la via glicolitica. la rx è irreversibile e viene consumato ATP. isomerasi: ha una sorta di doppia personalità perché nella cellula agisce da enzima ma fuori è un messaggero molecolare. è una proteina prodotta dai globuli bianchi. ha la funzione di aiutare nel controllo della crescita e del movimento di diverse cellule.
fosfato che servirà poi per produrre ATP. l’enzima che reagisce è un enzima NAD dipendente. il NAD si trova nel sito attivo del l’enzima. una volta che il NAD sarà ridotto a NADH, lascerà l’enzima a differenza di quello che fa il FAD una volta risotto a FADH2. il cito solo cellulare in seguito a questa reazione perde un NAD, bisogna rimediare a questo, nel cito solo la concentrazione di NAD è molto bassa per cui per proseguire la via glicolitica bisognerà arricchire il citosol di NAD. (se la cellula avesse ossidato l’aldeide a acido fosfoglicerico non avremmo ottenuto un legame ad alta energia in grado di fornire successivamente ATP) GLI SCOPI DELLA FASE DI GUADAGNO:
è una tappa catalizzata da una chinasi (fosfoglicerato chinasi), qui si ha la prima sintesi dell’ATP l'acido 3 fosfoglicerico è un alfa idrossiacido. se viene trasformato in beta avremo un composto instabile che disidrata spontaneamente. il problema sta nel fosfato sul carbonio 3, per questo la mutasi nella tappa 8 fa avvenire una mutazione: il fosfato viene trasferito dal carbonio 3 al 2.
questi dipendono dal tipo di cellula in cui ci troviamo: nelle cellule del nostro organismo procede per la respirazione cellulare; nei lieviti o nei muscoli sotto sforzo può dare fermentazione lattica o alcolica. la fermentazione e la respirazione differiscono dall'accenttore finale di elettroni: nella prima è una molecola organica e nell’altra inorganica. la via glicolitica è comune a tutte le cellule e avviene anche nelle fermentazioni.