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Typology: Exercises

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plesse-deloresse 🇨🇮

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EXERCICE D’EVALUATION :
Ci-dessous la matrice de programmation dynamique suivante :
Compléter le système de scores appliqué sachant que le cout pour un mésappariement est
égal à 0. Expliquer le choix des scores
Daprès le tableau les colonnes horizontales et verticales on trouve le gap=-1
A
C
A
1
0
C
0
2
Compléter le remplissage de cette matrice
A
C
G
T
C
0
-1
-2
-3
-4
-5
A
-1
1
0
-1
-2
-3
C
-2
0
2
1
0
-1
T
-3
-1
1
2
2
1
G
-4
-2
0
2
2
2
C
-3
-1
1
2
3
Horizontal : 0 -1= -1
Vertical : 0 1 = -1
Il reste la diagonal, on a un match C-C et le max des
scores trouvé est 2 donc 1+1 alors le match=1
pf2

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EXERCICE D’EVALUATION :

Ci-dessous la matrice de programmation dynamique suivante :

Compléter le système de scores appliqué sachant que le cout pour un mésappariement est égal à 0. Expliquer le choix des scores

D’après le tableau les colonnes horizontales et verticales on trouve le gap=-

A C

A 1 0

C 0 2

Compléter le remplissage de cette matrice

A C G T C

A - 1 1 0 - 1 - 2 - 3

C - 2 0 2 1 0 - 1

T - 3 - 1 1 2 2 1

G - 4 - 2 0 2 2 2

C - 5 - 3 - 1 1 2

Horizontal : 0 - 1= - 1 Vertical : 0 – 1 = - 1 Il reste la diagonal, on a un match C-C et le max des scores trouvé est 2 donc 1+1 alors le match=

Donner un exemple détaillé de calcul pour une case bien déterminée.

A C

C

- 2 0

T - 3

(EXPLIQUER)

Le score de l’alignement maximal est 3

DECRIRE L’ALIGNEMENT OPTIMAL OBTENU

QUELLE CONCLUSION TIREZ-VOUS DE CETTE ALIGNEMENT?

C’est le meilleur alignement correspondant

0 -1= -

-3 -1= -

-2 + 0= -2 Max= - 1

A C G T C

A C T G C