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software bioinformatico para el alineamiento simple y múltiple
Tipo: Guías, Proyectos, Investigaciones
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Arenas Salinas Mauricio Antonio Alumno: Dante Abraham Joseph Aguirre Solis Matrícula: 2019430016 Talca, 17 de Mayo, 2019.
Ejercicio N° En primera instancia se ingresa la cadena nucleotídica al “Query” de Blast n, se selecciona con que base de datos se comparará y se le da a Blast, luego esta muestra, según un algoritmo, cuáles son las secuencias con mayor identidad en comparación con la ingresada. Luego podemos ver la relación estadística entre la cadena ingresada y la de las bases de datos, ordenando de manera jerárquica comenzando con la que, según el algoritmo, posee un mejor puntaje, al seleccionar alguna nos llevará a una representación grafica de la identidad entre las cadenas. Al seleccionar el código de una de las coincidencias encontradas por Blast, esta nos abrirá una nueva página con información detallada sobre lo que se ha estudiado acerca de esa secuencia en particular, además de los aminoácidos que codifica.
Se presenta la gráfica de la proteína en 3D al seleccionar el link en la página anterior. Ejercicio N° 3 Se ingresan las secuencias en formato Fasta en el cuadro indicado, da como resultado el análisis de alineamiento múltiple de las secuencias indicadas, se puede descargar esta información en varios formatos, en este caso para utilizarse en BioEdit.
Análisis de alineamiento múltiple visualizado en BioEdit.
