Programa de Bioquímica Estructural: Facultad de Ciencias Biológicas, Monografías, Ensayos de Biología Celular

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UNIVERSIDAD JUÁREZ DEL ESTADO DE DURANGO

FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS

BIOQUIMÍCA ESTRUCTURAL

FCB-UJED

PROGRAMA ELABORADO POR: Cristo Omar Puente Valenzuela

GOMEZ PALACIO, DURANGO, MÉXICO

07 DE FEBRERO DE 2017/ MODIFICADO EL 30 MAYO DE 2018

FCB-UJED

PRESENTACIÓN

En el estudio de la biologia es importante el dominio de los distintos niveles de organización de los seres vivos, desde simples atomos

a ecosistemas, en la unidad de aprendizaje de Bioquimica estructural se establecen las bases para el estudio de las biomoleculas; su

estructura, organización, interacción y relevancia dentro de los seres vivos. En esta unidad de aprendizaje tambien se establecen las

bases metodologicas para el aislamiento y analisis de las principales biomoleculas.

La unidad de aprendizaje se ubica dentro del area de formación disiplinar en el mapa curricular, en el tercer de las carreras de

Biologo y licenciado en ecología, se relaciona de manera vertical con las unidades de aprendizaje de bioquimica metabolica, biologia

molecular, biotecnologia y procesos biotecnologicos para la carrera de biologo, de manera horizontal con la genetica I y biologia

celular.

La unidad de aprendizaje contribuye con las siguientes competencias especificas del perfil de egreso de biologo y ecologo: Explicar

los principios que rigen los procesos vitales de la biosfera en sus diferentes niveles de organización, Manejar metodologias de

biologia molecular y Manejar procesos biotecnologicos. De igualmanera contribuye con las competencias genericas de: capacidad de

abstracción, analisis y sintesis, Habilidad para obtener y sistematizar información procedente de fuentes diversas, Habilidad para

trabajar de manera autonoma y los compromisos con la calidad, etica y con el medio socio-cultural.

La unidad de aprendizaje consta de cuatro competencias a desarrollar en las cuales los aspectos congnitivos – procedimentales se

desarrollan de manera simultenes a traves del curso y la parte actitudinal es evaluada de manera continua.

Objetivo General de la Unidad de Aprendizaje

Explicar la estructura y función de las biomoléculas y Aplicar métodos para aislar, analizar e identificar biomoléculas

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PRIMERA PARTE 1.ASPECTOS GENERALES DEL CURSO 1.1. Datos de la unidad de aprendizaje

Nombre de la unidad de aprendizaje: BIOQUIMÍCA ESTRUCTURAL

Clave de la asignatura: 3112

Programa en el que se imparte Tronco comun

Área de formación: Diciplinar

Semestre en el que se imparte: Tercero

Horas/semana: Seis

Teoria: 3

Practica: 3

Horas por ciclo: 90

Créditos asignados: 6

Carácter de la Unidad de aprendizaje: Obligatoria

Modalidad: Presencial

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COMPETENCIA COGNITIVOS PROCEDIMENTALES ACTITUDINALES

péptidos, proteínas y enzimas;

además la función de estos en

los seres vivos

2. Analiza proteínas

3. Explica la estructura de

las proteínas

4. Explica la función de las

proteínas y de las

enzimas

unidad de aprendizaje.

2. Elaboración de

productos escritos y

visuales.

3. Calcula puntos

isoeléctricos de

aminoácidos a través

de su titulación.

4. Caracteriza

aminoácidos usando

pruebas con ninhidrina,

Glioxilic, Millon, Pauly,

Ehrlich, Nitroprusiato,

Acetato de plomo,

Sakaguchi

5. Calcula puntos

isoeléctricos de

proteínas por técnicas

de precipitación.

6. Explica las principales

técnicas colorimétricas

para la cuantificación

de proteínas

7. Calcula parámetros

y manifestación de

dudas.

 Mostrar compromiso,

responsabilidad y

tolerancia

 Disponibilidad para

compartir

conocimientos y

experiencias

 Habito por la lectura

 Respeto por los

reglamentos en

laboratorio

 Compromiso por la

calidad

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COMPETENCIA COGNITIVOS PROCEDIMENTALES ACTITUDINALES

bioquímicos de enzimas

8. Expone ejemplos de

enzimas y actividades

enzimáticas

III. Explica y expone las

características de los

carbohidratos, la glicobiologia,

lípidos y transporte de

membranas biológicas

1. Conoce los

monosacáridos,

disacáridos y

polisacáridos

2. Conoce los

proteoglicanos,

glicoproteínas y

glicoesfingolipidos

3. Conoce los lípidos y

lípidos de membranas

4. Explica la función de los

lípidos como

señalizadores,

cofactores y pigmentos

5. Explica la composición y

arquitectura de

membranas

6. Explica el transporte de

solutos a través de la

1. Analiza y explica textos

especializados de la

unidad de aprendizaje.

2. Elaboración de

productos escritos y

visuales.

3. Analiza y caracteriza

azucares usando el

método de antrona,

acido dinitrosalisilico,

Fehling, Benedict y Bial

4. Analiza el contenido de

ácidos grasos de

distintas muestras.

5. Establece el valor de

saponificación de una

grasa

6. Establece las

instauraciones de un

 Iniciativa para la

participación en clase

y manifestación de

dudas.

 Mostrar compromiso,

responsabilidad y

tolerancia

 Disponibilidad para

compartir

conocimientos y

experiencias

 Habito por la lectura

 Respeto por los

reglamentos en

laboratorio

 Compromiso por la

calidad

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1.3. Metodología de trabajo

La unidad de aprendizaje de Bioquímica estructural se emplean la combinación de los métodos tradicional y colaborativo para su

desarrollo y esta constituida por 4 competencias en las cuales la parte cognitiva y procedimental se realizan simultáneamente como

se desglosa en el apartado 1.4 inciso b). De igual manera el alumno debe de desarrollar trabajos autónomos , independientes del

avance temático frente al grupo para poder acreditarla, como se establece en el apartado 1.4 inciso a), se tienen un total de 11

trabajos autónomos los cuales deberán de ser entregados semanalmente a partir de la tercer semana del inicio oficial del semestre.

La parte procedimental será evaluada con el llenado de las practicas dentro de una bitácora de laboratorio la cual es evaluada de

acuerdo a la rubrica de evaluación de bitácora de laboratorio anexada a este programa. La parte conductual se evaluara con la

rubrica de la asistencia activa en clase la cual también se anexa a este programa.

1.4. Sistema de evaluación del curso

a) Para acreditación

CRITERIOS INSTITUCIONALES DE ACREDITACIÓN CRITERIOS DE ACREDITACIÓN PROPIOS DE LA MATERIA

Asistencia mínima al curso: 80% Asistencia mínima al curso: 90%

Calificación mínima para acreditar la materia: 60/100 Calificacion mínima para acreditar la materia: 60/

Un total de 3 intentos (recursos) para aprobar la materia Acreditar con un mínimo de 60/100 la parte teórica de la unidad de aprensdizaje

Entrega del 90% de los trabajos autonomos asignados

b) Para la calificación

COMPETENCIAS ASPECTOS A TOMAR EN CUENTA % PARCIAL % FINAL

Competencia I. Explica y describe los fundamentos de bioquímica y al agua como una biomolécula

Requisito cognitivo 1 – 3

Requisito procedimental 3

Requisito procedimental 4

Requisito cognitivo 4 – 5

Requisito procedimental 5 – 6

Trabajo Autonomo 1 : Resumen, Terminos clave, Problemas del capitulo 1 de la

bibliografia basica

Examen practico 1: De pipeteo preciso con micropipetas, pipeta serologica y

pipeta volumetrica

Practica 1. Calculo de Entropia, Etalpia y Energia libre de Gibs de una reaccion

quimica, usando grafico de VanGoff

Trabajo Autonomo 2: Resumen, Terminos clave, Problemas del capitulo 2 de la

bibliografia basica

Practica 2. Preparación de soluciones acuosas, medicion de pH

Practica 3. Titulacion de un acido debil, un acido poliprotico y calculo de pK

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COMPETENCIAS ASPECTOS A TOMAR EN CUENTA % PARCIAL % FINAL

Requisito cognitivo 1 – 5

Requisitos actitudinales

Practica 4. Preparacion de soluciones buffer y titulacion de una solucion buffer

Examen practico 2: Preparación de soluciones buffer

Examen teorico competencia 1

Rublica de asistenca activa en clase (Ver anexos)

Competencia II. Explica y expone las características aminoácidos, péptidos, proteínas y enzimas; además la función de estos en los

seres vivos

Requisito cognitivo 1

Requisito procedimental 3 - 4

Requisito cognitivo 2 – 3

Requisito procedimental 5 - 6

Requisito cognitivo 4

Requisito procedimental 7-

Requisito cognitivo 1 – 4

Requisitos actitudinales

Trabajo Autonomo 3: Resumen, Terminos clave, Problemas del capitulo 3 de la

bibliografia basica

Practica 5. Calculo de puntos isoelectricos de aminoacidos puros

Practica 6. Caracterización de un aminoacido

Examen practico: Identificacion de un aminoacido puro

Trabajo Autonomo 4: Resumen, Terminos clave, Problemas del capitulo 4 de la

bibliografia basica

Practica 7. Calculo de punto isoelectrico de una proteina

Practica 8. Cuantificación de proteinas por metodos espectrofotometricos.

Trabajo Autonomo 5: Resumen, Terminos clave, Problemas del capitulo 5 de la

bibliografia basica

Trabajo Autonomo 6: Resumen, Terminos clave, Problemas del capitulo 6 de la

bibliografia basica

Practica 9. Calcula parametros bioquimicos – cineticos de enzimas

Practica 10. Factores que afectan la actividad enzimatica

Examen practico: Calculo de Km y Vmax de una enzima

Trabajo Autonomo 7: Cartel expositivo de un ejemplo de una actividad

enzimatica

Examen teorico competencia 2

Rublica de asistenca activa en clase (Ver anexos)

Competencia III. Explica y expone las características de los carbohidratos, la glicobiologia, lípidos y transporte de membranas

biológicas

Requisitos cognitivos 1 – 2

Requisito procedimental 3

Requisitos cognitivos 3 – 4

Requisito procedimental 4 - 6

Trabajo Autonomo 8: Resumen, Terminos clave, Problemas del capitulo 7 de la

bibliografia basica

Practica 11. Caracterización de azucares y cuantificación de azucares totales

Trabajo Autonomo 9: Resumen, Terminos clave, Problemas del capitulo 10 de la

bibliografia basica

Practica 12. Analisis de contenido de acidos grasos

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Bioquímica de los Procesos Metabólicos Segunda Edición, Virginia Melo/Oscar Cuamatzi, Editorial Reverte, S. A. 2010

Fundamentos de Bioquímica, la vida a nivel molecular Segunda Edición, Voet, Voet y Pratt, Editorial Medica Panamericana.

Bioquímica las Bases Moleculares de la Vida Cuarta Edición, Trudy McKee y James R. McKee, Editorial Mc Graw Hill, 2009

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Anexos Instrumento de Evaluación: Asistencia activa en clase

Rubrica

Asignado

Escala

Tiempo 1

Puntualidad 5

El alumno llega después de media hora de iniciada la clase o no llega a la clase El alumno llega después de los 15 minutos de la hora de clase y antes de los 30 minutos de la hora de la clase El alumno llega después de los 10 minutos de tolerancia pero antes de los 15 minutos de la hora de la clase El alumno llega dentro de la tolerancia de 10 minutos para iniciar la clase El alumno esta presente al momento de la toma de asistencia, dentro del tiempo 1 del formato de clase

Tiempo 2

Conducta 15

El alumno se encuentra realizando trabajos de otras materias y no se concentra en el desarrollo de la clase El alumno se distrae frecuentemente y distrae a sus compañeros, hace burla de otros, fomentando el no desarrollo de la clase El alumno no presta atención, se aprecia una actitud indiferente al desarrollo de la clase El alumno utiliza dispositivos inteligentes fuera del contexto de la clase El alumno se concentra únicamente en el desarrollo de la clase

Notas y/o

apuntes

El alumno no realiza un resumen del tema a desarrollar dentro de la clase El alumno solo desarrolla el resumen del tema especifico a desarrollar dentro de la clase El alumno solo presenta un resumen general del tema de la clase, pero no ubica dentro de sus anotaciones los temas desarrollados El alumno se presenta y ubica los temas a desarrollar dentro de la clase en el resumen del tema El alumno además de los criterios del punto anterior resalta conceptos, y enlista dudas del tema a desarrollar en clase

Tiempo 3

Externa Dudas^20

El porcentaje de esta rubrica se otorgara a cualquier alumno que externe dudas o quiera reforzar la comprensión de un tema y/o concepto dentro de la clase, por lo que la escala de evaluación no aplica, en caso de alumnos que manifiesten no tener dudas este porcentaje solo se les será respetado si la calificación de su examen teórico de competencia es aprobatoria

Resuelve dudas

a sus

compañeros

40 El alumno no participa para explicar a sus compañeros

El alumno explica a sus compañeros, pero refleja un poco dominio de los conceptos y tema a explicar El alumno explica a sus compañeros, refleja dominio de los conceptos y tema a explicar El alumno explica a sus compañeros, refleja dominio de los conceptos y tema a explicar de dificultad moderada El alumno además de los puntos anteriores prepara material adicional para poder explicar a sus compañeros, conceptos y temas de gran dificultad

Notas:

1. Tres retardos equivalen a una falta, cinco faltas quitan el derecho a la fracción de la calificación asignada para la asistencia. Personas con más de cinco faltas serán

evaluadas de acuerdo al porcentaje de asistencia que hayan obtenido. Las faltas solo serán justificadas presentado un justificante oficial en periodo de 5 dias maximo

(Emitido por el secretario académico) y solo se justificaran las faltas que se establezcan en dicho justificante.

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Tiempo 4

Limpieza del área

de trabajo 5

El alumno deja sucia su área de trabajo, y no se apega a los tiempos establecidos para el desarrollo de la practica. El alumno no termina su actividad en el laboratorio en los tiempos establecidos y entrega limpia su área de trabajo después de la hora en que termina la clase El alumno termina su actividad en el laboratorio en los tiempos establecidos y entrega limpia su área de trabajo a la hora que termina la clase El alumno termina su actividad en el laboratorio en los tiempos establecidos y entrega limpia su área de trabajo faltando 5 minutos para terminar la clase El alumno termina su actividad en el laboratorio en los tiempos establecidos y entrega limpia su área de trabajo faltando 10 minutos para terminar la clase

Notas:

1. La asistencia a las practicas será considerada solo cuando el alumno llegue al laboratorio dentro de los primeros 30 minutos después de la hora programada de la practica.

2. Si el alumno llega después de los 30 minutos, este solo tendrá derecho al criterio de evaluación de reporte en caso de que este lo presente.

3. El criterio de reporte de practicas, solo serán considerados las personas que estén incluidas en el reporte.

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Instrumento de Evaluación: Bitácora

Rubrica

Asignado

Escala

Organización y

cronología

No se encuentra ningún orden en la manera de llevar la bitácora No presenta manera alguna de poder fechar los eventos descritos en su bitácora El alumno organiza sus anotaciones de manera general, no se aprecia una sub-clase de organización Presenta poca cronología, de tal manera que resulta difícil saber la fecha exacta en que ocurrieron los eventos descritos en la bitácora El alumno organiza sus anotaciones por practica, generando subcategorías de objetivos, metodología, material y equipos a utilizar, cálculos, resultados obtenidos, observaciones implícitas en las anotaciones y conclusiones de los experimentos Presenta cronología de manera que se puede saber la fecha exacta en que ocurrieron los eventos descritos en la bitácora El alumno además del punto anterior genera listas de material y equipos a utilizar de manera especifica, hace observaciones de fuentes de posibles fuentes de error para el desarrollo de la practica y anota breves anotaciones del fundamento y uso de equipos e instrumentos a emplear Además del punto anterior, hace anotaciones de las responsabilidades de los integrantes del equipo de manera que el alumno sabe siempre la fecha exacta de los eventos descritos en la bitácora y por quien fueron realizados

Antecedentes 10 %

El reporte representa un entendimiento incorrecto de los conceptos científicos esenciales en el laboratorio. El reporte ilustra un entendimiento limitado de los conceptos científicos esenciales en el laboratorio El reporte representa un preciso entendimiento de la mayoría de los conceptos científicos esenciales en el laboratorio El reporte representa un preciso y minucioso entendimiento de los conceptos científicos esenciales en el laboratorio

Objetivos 2.5 %

El propósito del laboratorio o la pregunta a ser contestada durante el laboratorio es erróneo o irrelevante. El propósito del laboratorio o la pregunta a ser contestada durante el laboratorio está parcialmente identificado y es presentado en una manera que no es muy clara. El propósito del laboratorio o la pregunta a ser contestada durante el laboratorio está identificado, pero es presentado en una manera que no es muy clara. El propósito del laboratorio o la pregunta a ser contestada durante el laboratorio está claramente identificado y presentado.

Material y

Reactivos

Muchos materiales están descritos sin precisión o no están del todo descritos. La mayoría de los materiales usados en el experimento están descritos con precisión. La preparación del aparato está descrita con precisión. Casi todos los materiales usados en el experimento son descritos clara y precisamente. Un bosquejo etiquetado de un aparato está incluido. Todos los materiales usados en el experimento son descritos clara y precisamente. Los bosquejos de los aparatos y la preparación son ordenados, fáciles de leer y están completamente etiquetados.

Métodos 10 %

Los procedimientos no enlistan en forma precisa todos los pasos del experimento. Los procedimientos están enlistados, pero no están en un orden lógico o son difíciles de seguir. Los procedimientos están enlistados en un orden lógico, pero los pasos no están enumerados y/o no son oraciones completas. Los procedimientos están enlistados con pasos claros. Cada paso está enumerado y es una oración completa.

Cálculos 20 %

Realiza cálculos de manera desordenada de manera que es difícil ubicar los cálculos para un procedimiento en especifico Realiza cálculos con mayor orden los cuales no cuesta demasiado trabajo de ubicar por una persona ajena a la bitácora Realiza e identifica los diferentes cálculos realizados, los cuales son fácilmente entendibles por cualquier persona que tome su bitácora para reproducir la practica Además del punto anterior coloca enunciados que explican como realizar las mezclas para la preparación de las diferentes soluciones o la elaboración o finalidad del calculo

Resultados 10 % Una representación precisa de los datos en forma escrita

Una representación precisa de los datos en tablas y/o gráficas. Las gráficas y tablas están etiquetadas y tituladas Una representación profesional y precisa de los datos en tablas y/o gráficas. Las gráficas y las tablas están etiquetadas y tituladas Además del punto anterior, indaga y contrasta sus resultados con los de otros equipos para la generación de criterios al momento de discutir los resultados, en caso de que otros equipos no generen resultados hace anotaciones al respecto y genera observaciones de las posibles causas del porque no se obtuvieron los resultados

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Lectruas de la Unidad de Aprendizaje

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Practicas de laboratorio