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Asignatura: Estructura de Macromoléculas, Profesor: Mauricio García Mateu, Carrera: Bioquímica, Universidad: UAM
Tipo: Apuntes
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Grado en Bioquímica, UAM, curso 2015- 16
1 - Microscopía de fuerzas atómicas ultra-rápida: ejemplos de su utilización para el estudio de la dinámica y funcionamiento de proteínas y complejos moleculares. 2 - Métodos computacionales para predecir interacciones proteína-ligando. Casos recientes de aplicación de estos métodos para el diseño de nuevos fármacos. 3 - La teoría neutralista de la evolución molecular: qué es; qué evidencia experimental la apoya o la contradice, y cómo se complementa con otras ideas sobre la evolución molecular. Relevancia para el estudio de las proteínas. 4 - Estabilización de proteínas mediante modificaciones de su secuencia y estructura: Ejemplos recientes con posibles aplicaciones en biotecnología. 5 - El método de los valores phi para la determinación de la estructura del estado de transición en la reacción de plegamiento de una proteína. 6 - Evidencia experimental que apoya el modelo teórico del embudo de plegamiento. 7 - Proteínas intrínsecamente desplegadas: qué son y como funcionan; ejemplos. 8 - "Downhill folding": Concepto y evidencia experimental. 9 - Enfermedades amiloides debidas a defectos de plegamiento. Ejemplos y bases estructurales. 10 - Los mejores métodos de predicción de estructura secundaria: cuales son, en qué están basados y qué grado de fiabilidad ofrecen. 11 - Resultados más importantes sobre predicción de la estructura tridimensional de una proteína, obtenidos en alguno de los últimos concursos CASP. 12 - Dinámica conformacional de proteínas analizada mediante espectroscopía de resonancia magnética nuclear, con mención a algunos ejemplos recientes. 13 - Dinámica conformacional de proteínas mediante modelado por dinámica molecular, con mención a algunos ejemplos recientes. 14 - Diseño de proteínas "de novo": ejemplos recientes 15 - Evidencia experimental que apoya la presencia in vivo y función biológica del DNA Z. 16 - Evidencia experimental que apoya la presencia in vivo y función biológica del DNA G.