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centrifugacion celular, Resúmenes de Biología Molecular

tecnica de centrifugacion celular

Tipo: Resúmenes

2020/2021

Subido el 26/05/2022

Makarena-Pacheco
Makarena-Pacheco 🇨🇱

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CENTRIFUGACIÓN
DIFERENCIAL
PREGUNTAS
¿Qué es la compartimentalización celular?
Es la organización interna de las células
eucariontes, donde estructuras delimitadas por una
o dos membranas (organelos) realizan reacciones
metabólicas que permiten el funcionamiento
celular.
¿Qué tienen en común estos compartimientos?
Su estructura; presencia de membrana
fosfolípidos, proteínas, azucares y otros
metabolitos en su interior.
¿Qué diferencia a estos compartimientos?
Las funciones que realizan para mantener el
funcionamiento celular; cada uno tiene. su función
específica. Para que funciones de manera correcta
deben interactuar entre sí. Formas diferentes,
tamaños diferentes, etc. Todo esto permite
separarlos.
FRACCIONAMIENTO SUBCELULAR
Técnicas y procedimientos que permiten separar y
purificar un orgánulo especifico de las células para
su estudio a partir de sus características
moleculares, bioquímicas y formas de los
diferentes gránulos.
El tamaño es clave porque permite separarlos
mediante un pequeño llamado centrifuga.
LECTURA 1: PURIFICACIÓN DE LAS CÉLULAS Y SUS
PARTES
Se separan componentes internos de la célula, por
lo que se debe romper la membrana:
Western Blot: se utiliza detergente para
cambiar solubilidad presentes en
membrana y se destruya la membrana.
Utilización de medio hipotónico (baja
concentración de sales entra agua, se
hincha y se rompe, mejor conocido como
citólisis) para no causar daño a la célula ni
organelos. Se libera todo el contenido de la
célula.
Fuerza mecánica (presión): presionar de
manera de desgarrar la membrana para que
se libere el contenido.
Sonicación: aplicación de fuerza vibratoria
que genera ondas que produce la
destrucción de la membrana plasmática y se
libera contenido.
Para separar los componentes subcelulares,
debemos romper la membrana plasmática. Esto se
logra ajustando el pH, utilizando sonicación,
soluciones hipotónicas o equipos especializados
para homogenizar tejidos.
Todo se realiza a través de un tubo de ensayo y se
homogeniza, se mantiene a través de un medio
líquido que tenga las condiciones óptimas de la
célula y posteriormente comienza el proceso de
centrifugación de forma seriada.
En el proceso de centrifugación se utiliza una
centrifuga que gira y produce que:
Moléculas de mayor tamaño (núcleo) caigan
al fondo del tubo.
Moléculas de menor tamaño quedan en
sobrenadante (ribosomas, unidades
ribosomales).
A medida que aumenta la velocidad van cayendo
estructuras más pequeñas.
De mayor a menor tamaño:
- Núcleo.
- Mitocondria tiene doble membrana.
- Lisosomas contiene enzimas ácidas.
- Peroxisoma.
- Cloroplastos.
- Fracciones microsomales fragmentos
de RE (membranas microsomales).
- Ribosomas.
- Subunidades ribosomales.
- Soluble en el citoplasma citosol.
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CENTRIFUGACIÓN

DIFERENCIAL

PREGUNTAS

¿Qué es la compartimentalización celular? Es la organización interna de las células eucariontes, donde estructuras delimitadas por una o dos membranas (organelos) realizan reacciones metabólicas que permiten el funcionamiento celular. ¿Qué tienen en común estos compartimientos? Su estructura; presencia de membrana fosfolípidos, proteínas, azucares y otros metabolitos en su interior. ¿Qué diferencia a estos compartimientos? Las funciones que realizan para mantener el funcionamiento celular; cada uno tiene. su función específica. Para que funciones de manera correcta deben interactuar entre sí. Formas diferentes, tamaños diferentes, etc. Todo esto permite separarlos. FRACCIONAMIENTO SUBCELULAR Técnicas y procedimientos que permiten separar y purificar un orgánulo especifico de las células para su estudio a partir de sus características moleculares, bioquímicas y formas de los diferentes gránulos. El tamaño es clave porque permite separarlos mediante un pequeño llamado centrifuga. LECTURA 1: PURIFICACIÓN DE LAS CÉLULAS Y SUS PARTES Se separan componentes internos de la célula, por lo que se debe romper la membrana:  Western Blot: se utiliza detergente para cambiar solubilidad presentes en membrana y se destruya la membrana.  Utilización de medio hipotónico (baja concentración de sales  entra agua, se hincha y se rompe, mejor conocido como citólisis) para no causar daño a la célula ni organelos. Se libera todo el contenido de la célula.  Fuerza mecánica (presión): presionar de manera de desgarrar la membrana para que se libere el contenido.  Sonicación: aplicación de fuerza vibratoria que genera ondas que produce la destrucción de la membrana plasmática y se libera contenido. Para separar los componentes subcelulares, debemos romper la membrana plasmática. Esto se logra ajustando el pH, utilizando sonicación, soluciones hipotónicas o equipos especializados para homogenizar tejidos. Todo se realiza a través de un tubo de ensayo y se homogeniza, se mantiene a través de un medio líquido que tenga las condiciones óptimas de la célula y posteriormente comienza el proceso de centrifugación de forma seriada. En el proceso de centrifugación se utiliza una centrifuga que gira y produce que:  Moléculas de mayor tamaño (núcleo) caigan al fondo del tubo.  Moléculas de menor tamaño quedan en sobrenadante (ribosomas, unidades ribosomales). A medida que aumenta la velocidad van cayendo estructuras más pequeñas. De mayor a menor tamaño:

  • Núcleo.
  • Mitocondria  tiene doble membrana.
  • Lisosomas  contiene enzimas ácidas.
  • Peroxisoma.
  • Cloroplastos.
  • Fracciones microsomales  fragmentos de RE (membranas microsomales).
  • Ribosomas.
  • Subunidades ribosomales.
  • Soluble en el citoplasma  citosol.

Se puede separar utilizando un gradiente de densidad (poner liquido que tienen distintas concentraciones y características de densidad).

  • Agua y aceite: agua es más denso y queda abajo, mientras que aceite queda arriba por ser menos denso. Una fracción de una mezcla de organelos puede ser separada posteriormente por centrifugación en gradiente de densidad en equilibrio.
  • Mas sacarosa o glicerol  más denso (zona de mayor densidad).
  • Con pipeta se puede sacar muestras de fracción y verlas por microscopia electrónica (se puede ver concentración de enzimas o moléculas y actividad enzimática).
  • Sustrato de catalasa (catalasa se sintetiza en citosol)  peróxido de hidrogeno, se puede colocar en diferentes tubos para ver actividad enzimática (peroxisoma). LECTURA 2: ESTUDIOS DE FRACCIONAMIENTO TISULAR Fueron los primeros hallazgos con respecto a la distribución. ¿Cuál es el problema que se quiere resolver? La ubicación intracelular de las enzimas catalasa, D- aminoácido oxidasa y monoamino oxidasa en hígado. ¿Cómo van a abordar el problema? Re-investigar la ubicación de las enzimas utilizando un esquema de centrifugación desarrollado por Appelmans, Wattiaux y de Duve. ¿Cuál es la importancia de utilizar otras enzimas como citocromo oxidasa en el experimento? Son enzimas (citocromoxidasas, entre otras) que servirán como control (referencia). Utilizan método de centrifugación:
  1. Se toma el tejido.
  2. Se homogeniza.
  3. Se agrega TritonX100 para romper membrana.
  4. Comienza centrifugación a baja velocidad (núcleo, citoesqueleto, restos de membrana).
  5. Sobrenadante se pasa a otro tubo y se centrifuga a velocidad media (se obtiene pellet 2).
  6. Se aumenta velocidad (se obtiene pellet 3).
  7. A máxima velocidad (se obtiene pellet 4). Estructuras más pequeñas. En el estudio, se encontró el pellet 2 y se dieron cuenta que había una fracción M (nitrógeno y actividad citocromo-oxidasa  mitocondrias y peroxisomas) y otra L (mitocondrial liviana  lisosomas).  Fosfatasa ácida es una proteína que se utilizó de referencia para marcar lisosomas.  Urato oxidasa  peroxisomas.  Glucosa-6-Fosfato  fragmentos de membrana microsomal.  Fosfatasa  RE.  Citocromo oxidasa  mitocondrias. DISCUSIÓN  Enzimas de referencia: la distribución de las enzimas de referencia fue similar a lo descrito en experimentos anteriores, a excepción de urato oxidasa. Este cambio no se le puede atribuir al cambio de la temperatura durante el experimento.  Monoamino oxidasa: aparentemente tiene una distribución bimodal, ya que su actividad se encuentra en mitocondria (70%) y en cuerpos microsomales (24%).  Catalasa: patrón de distribución similar a la D-aminoácido oxidasa, donde la mayor parte de estas enzimas no está asociada a la mitocondria y con propiedades de sedimentación similares a las enzimas de lisosomas y de los “microbodies” que contiene urato-oxidasa.

 Hacia el núcleo  regulación en activación de genes (transcripción).  Molécula difunde, se encuentra con receptor y va al núcleo a producir el control en la activación de genes (controla síntesis de ARN mensajeros).  Los receptores de este tipo tienen en su secuencia proteica una secuencia de aminoácidos que se une al ADN. Cuando se une al ADN genera respuesta primaria en donde se activan los genes (ARN mensajeros que se transformarán en proteínas). Proteínas sintetizadas vuelven al núcleo y vuelven hacia el ADN para generar respuesta secundaria (productos del receptor):

  • Procesos de inhibición (bloqueo de síntesis de genes).
  • Activar procesos de síntesis de genes  proteínas. MANIPULACIÓN DE RECEPTORES CELULARES: AGONISTAS Y ANTAGONISTASAgonistas : imitan la función de una hormona natural anclándose a su receptor, y producen la misma respuesta. Activan.  Antagonistas : se anclan al receptor y no inducen la respuesta, por este efecto se reduce la respuesta fisiológica a la hormona. Bloquean. CUANTIFICACIÓN DE RECEPTORES:  Ensayos de unión: uso de ligandos sintéticos (agonista o antagonista) se marcan con radioactivos o fluorescencias. Para receptores de alta afinidad con sus ligandos. Para identificar la cantidad de receptor unido a ese ligando.  Ensayos de competición: se añaden cantidades crecientes de un ligando de baja afinidad no marcado (el competidor) a una muestra de células con una cantidad constante de ligando de algo afinidad, radiomarcado. La unión del competidor no marcado al receptor bloqueo la unión de ligando radioactivo al receptor.
  • Se añaden agonista 1 y 2, se unen al mismo receptor y si se mide la respuesta celular, uno de ellos genera mayor respuesta celular.
  • Sirve para medir el efecto de algún medicamento y su eficiencia. DETECCIÓN DE RECEPTORES: USO DE ANTICUERPOS  Inmunohistoquímica  se ven estructuras celulares, ver localización de receptores.  Enzimoinmunoensayo (ELISA)  cuantificar cantidades de receptores. RECEPTORES DE ESTEROIDES Y CÁNCER DE MAMA Técnica de inmunodetección permite visualizar.  Células neoplásicas que tienen estos receptores (estrógeno y progesterona) cuando se activan, se activa la cascada y la respuesta es un aumento del crecimiento tumoral.  Para tratar este cáncer se deben bloquear los receptores con ayuda del fármaco tamoxifeno (antagonista).