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Control de la actividad enzimática, Apuntes de Bioquímica

Asignatura: bioquimica, Profesor: Jose Carlos Diez, Carrera: Biología, Universidad: UAH

Tipo: Apuntes

2016/2017

Subido el 13/05/2017

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TEMA 8. CONTROL DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA. ENZIMAS
ALOSTÉRICAS. ISOENZIMAS.
CONTROL DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
Hay enzimas reguladoras en la Glucolisis, que llevan a cabo unas reacciones que
permiten construir una ruta metabólica (Las rutas metabólicas son conjuntos
ordenados de reacciones relacionadas entre sí)
Hay tres enzimas reguladoras en la Glucolisis: Hexoquina--sa, Fosfofructoquinasa
1 y Piruvato quinasa. Sobre estas enzimas va a haber activadores e inhibidores.
El primer sustrato activa la primera enzima de la Glucolisis. Cuando no se necesita
más glucosa, se detiene la formación de esta, para que se pueda almacenar en el
hígado.
Si hay un nivel de ATP muy alto, no se necesita más energía, y lo que ocurre es
que las enzimas reguladoras serán inhibidas para que no se forme más ATP.
La velocidad de cada ruta está controlada para que se ajuste a las necesidades de
la célula. Generalmente, la primera enzima es la reguladora y limitante de la
velocidad global de la ruta. Si se inhibe la hexoquinasa, en el caso de la glucolisis,
no se producen el resto de reacciones. Las enzimas reguladoras suelen ser
alostéricas, y la primera reacción es la que tiene la Velocidad máxima más baja.
RETROINHIBICIÓN Y RETROALIMENTACIÓN
1. RETROINHIBICIÓN ON INHIBICIÓN FEED-BACK: Inhibición de la enzima
reguladora de la ruta por el producto nal de la ruta (producto de la última
reacción de la misma). Se evita la acumulación del producto nal, la acumulación
de metabolitos intermedios y la utilización innecesaria del primer compuesto de la
ruta.
2. RETROALIMENTACIÓN: Activación o inhibición por producto nal de una ruta.
Puede darse que el Producto nal (E) inhiba la 1ª etapa; que sean los productos D
y E (que uno de estos inhiba y otro active); o, por último, que se inhiban diferentes
ramicaciones de la ruta por inhibición secuencial.
REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
- Control a nivel de sustrato: Se produce la interacción de sustratos y productos
con la enzima. La glucosa 6 fosfato inhibe el enzima hexoquinasa, por lo que no se
produce más Glucosa 6 fosfato.
- Control por la concentración de enzima: Se produce la síntesis de la enzima
(expresión génica) o por la degradación (proteólisis).
1. Control por inducción o represión de la síntesis de la enzima por regulación de
la expresión del gen.
2. Control por degradación de la enzima: Puede ser lisosomal (utilizando proteasas
hidrolíticas) o citosólica (utilizando proteasas citosólicas, ubiquitina)
REGULACIÓN POR MODIFICACIÓN DE LA EFICACIA CATALÍTICA
Las enzimas alostéricas: Son proteínas con múltiples subunidades (proteínas con
estructura cuaternaria). Presentan más de un centro activo y catalítico. Hay
moduladores alostéricos tanto positivos (como el O2 en caso de la Hemoglobina)
como negativos La unión de estos moduladores alostéricos es no covalente.
Presentan una cinética sigmoidea y cooperatividad entre sitios. Existe una
concentración crítica de sustrato por debajo de la cual la enzima no es eciente.
Un pequeño aumento del sustrato, por encima de la concentración crítica de
sustrato, produce un gran aumento de velocidad (enzima eciente).
El centro alostérico y el centro activo son distintos. Los reguladores alostéricos son
metabolitos o cofactores que se unen a sitios distintos del centro activo y
modican la actividad enzimática.
Ejemplos:
1. PFK: Fosfofructoquinasa (PFK-PFK-1): 6 fosfofructo-1-quinasa: Interviene en
la glucólisis, en la transformación de piruvato de la glucosa. Bajos niveles
energéticos en la célula, hace que se active la creación de ATP, por medio de la
activación de PFK1. Con un alto contenido de ATP, se inhibe la PFK1, para que no
siga creando ATP.
2. PKA: Algunas enzimas alostéricas presentan sitios catalíticos y sitios
reguladores en diferentes subunidades.
Proteína quinasa A: Presenta 2 subunidades catalíticas y 2 subunidades
reguladoras con activación por AMPc. Cuando hay una descarga de adrenalina,
hay una serie de reacciones que activan el AMPc, que es un “segundo mensajero”.
AMPc actúa como efector alostérico positivo, es decir, como activador.
Efectos homotrópicos y heterotrópicos de las enzimas alostéricas:
Homotrópico:
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TEMA 8. CONTROL DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA. ENZIMAS

ALOSTÉRICAS. ISOENZIMAS.

CONTROL DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA

Hay enzimas reguladoras en la Glucolisis, que llevan a cabo unas reacciones que permiten construir una ruta metabólica (Las rutas metabólicas son conjuntos ordenados de reacciones relacionadas entre sí)

Hay tres enzimas reguladoras en la Glucolisis: Hexoquina--sa, Fosfofructoquinasa 1 y Piruvato quinasa. Sobre estas enzimas va a haber activadores e inhibidores.

El primer sustrato activa la primera enzima de la Glucolisis. Cuando no se necesita más glucosa, se detiene la formación de esta, para que se pueda almacenar en el hígado.

Si hay un nivel de ATP muy alto, no se necesita más energía, y lo que ocurre es que las enzimas reguladoras serán inhibidas para que no se forme más ATP.

La velocidad de cada ruta está controlada para que se ajuste a las necesidades de la célula. Generalmente, la primera enzima es la reguladora y limitante de la velocidad global de la ruta. Si se inhibe la hexoquinasa, en el caso de la glucolisis, no se producen el resto de reacciones. Las enzimas reguladoras suelen ser alostéricas, y la primera reacción es la que tiene la Velocidad máxima más baja.

RETROINHIBICIÓN Y RETROALIMENTACIÓN

  1. RETROINHIBICIÓN ON INHIBICIÓN FEED-BACK: Inhibición de la enzima reguladora de la ruta por el producto final de la ruta (producto de la última reacción de la misma). Se evita la acumulación del producto final, la acumulación de metabolitos intermedios y la utilización innecesaria del primer compuesto de la ruta.
  2. RETROALIMENTACIÓN: Activación o inhibición por producto final de una ruta. Puede darse que el Producto final (E) inhiba la 1ª etapa; que sean los productos D y E (que uno de estos inhiba y otro active); o, por último, que se inhiban diferentes ramificaciones de la ruta por inhibición secuencial.

REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA

  • Control a nivel de sustrato: Se produce la interacción de sustratos y productos con la enzima. La glucosa 6 fosfato inhibe el enzima hexoquinasa, por lo que no se produce más Glucosa 6 fosfato.
  • Control por la concentración de enzima: Se produce la síntesis de la enzima (expresión génica) o por la degradación (proteólisis).
  1. Control por inducción o represión de la síntesis de la enzima por regulación de la expresión del gen.
  2. Control por degradación de la enzima: Puede ser lisosomal (utilizando proteasas hidrolíticas) o citosólica (utilizando proteasas citosólicas, ubiquitina)

REGULACIÓN POR MODIFICACIÓN DE LA EFICACIA CATALÍTICA

Las enzimas alostéricas: Son proteínas con múltiples subunidades (proteínas con estructura cuaternaria). Presentan más de un centro activo y catalítico. Hay moduladores alostéricos tanto positivos (como el O2 en caso de la Hemoglobina) como negativos La unión de estos moduladores alostéricos es no covalente. Presentan una cinética sigmoidea y cooperatividad entre sitios. Existe una concentración crítica de sustrato por debajo de la cual la enzima no es eficiente. Un pequeño aumento del sustrato, por encima de la concentración crítica de sustrato, produce un gran aumento de velocidad (enzima eficiente).

El centro alostérico y el centro activo son distintos. Los reguladores alostéricos son metabolitos o cofactores que se unen a sitios distintos del centro activo y modifican la actividad enzimática.

Ejemplos:

  1. PFK: Fosfofructoquinasa (PFK-PFK-1): 6 fosfofructo-1-quinasa: Interviene en la glucólisis, en la transformación de piruvato de la glucosa. Bajos niveles energéticos en la célula, hace que se active la creación de ATP, por medio de la activación de PFK1. Con un alto contenido de ATP, se inhibe la PFK1, para que no siga creando ATP.
  2. PKA: Algunas enzimas alostéricas presentan sitios catalíticos y sitios reguladores en diferentes subunidades.

Proteína quinasa A: Presenta 2 subunidades catalíticas y 2 subunidades reguladoras con activación por AMPc. Cuando hay una descarga de adrenalina, hay una serie de reacciones que activan el AMPc, que es un “segundo mensajero”. AMPc actúa como efector alostérico positivo, es decir, como activador.

Efectos homotrópicos y heterotrópicos de las enzimas alostéricas:

Homotrópico:

Estado T: inactivo Estado R: Activo

Heterotrópico:

• Efector positivo: Al interactuar con la enzima permitirán que con

concentraciones de sustrato menores obtengamos mayores velocidades de reacción debido a que incrementan la acción de la enzima

• Efector negativo: El inhibidor es diferente al sustrato. Cuando interactúan con

la enzima disminuyen su actividad

Efecto de moduladores alostéricos positivos y de moduladores alostéricos negativos: La presencia de un modulador positivo aumenta la velocidad y desplaza la curva a la izquierda, y la presencia de un Modulador negativo disminuye la velocidad y desplaza la curva a la dcha.

REGULACIÓN POR MODIFICACIÓN COVALENTE

En algunas enzimas su actividad se regula por unión covalente de otras moléculas (ligandos). Puede ser reversible o no.

• Fosforilación: (ESTE ES EL MÁS IMPORTANTE) A la enzima se le une un fosfato,

por lo que se fosforila el aminoácido (que puede ser Tyr, Ser, Thr o His)

• Adenilinación: se produce sobre residuos de Tyr y consume ATP.

• Acetilación: Unión covalente de un grupo acetilo sobre residuos de Lys.

• Miristolación.

• Ubiquitinación: Sirve para que la proteína que capta ubiquitina pueda servir

posteriormente para la degradación de proteínas.

• ADP-Ribosilación: Se pasa de NAD a nicotinamida.

• Metilación: Se pasa de 5-adenosil-metionina a 5-adenosil-homocisteína.

FOSFORILACIÓN: Se da por el enzima quinasa, que consume ATP y da ADP. La reacción es reversible, pero en este caso se da por la fosfatasa.

Glucógeno fosforilasa: Es una enzima alostérica regulada por efectores en respuesta a la carga energética permitiendo la liberación de glucosa almacenada en forma de glucógeno. Descargas de adrenalina. La forma inactiva es la B, que no tiene grupo fosfato. Cuando se necesita, se une a un fosfato, liberando ATP. Se obtiene la glucógeno

fosfatasa activa (A). La reacción se da por la quinasa. La reacción en sentido contrario se da por la fosfatasa.

PROTEOLISIS: Muchas enzimas se sintetizan en una forma inactiva más grande llamada zimógeno, y para activarse necesitan romperse, dando lugar al fragmento activo, para luego unirse al sustrato. No requiere ATP y es irreversible. El pepsinógeno (se tiene que proteolizar para dar la pepsina).

Esto se da también en la coagulación (que es una serie de reacciones en cadena). La protrombina da lugar a la trombina, que actúa sobre el fibrinógeno (proteína plasmática soluble) que se rompe y da lugar a fragmentos que se unen y forman una red de Fibrina, que es el coágulo sanguíneo insoluble.

ISOENZIMAS

Son diferentes formas (isoformas) de la enzima que catalizan la misma reacción: Tienen estructura ligeramente diferente que les confiere propiedades físico- químicas diferentes (carga, punto isoeléctrico, secuencia) que se aprovechan para su separación. Difieren en afinidad por el sustrato (Km), Vmáx y en sus propiedades reguladoras. Pueden ser características de un tipo celular (órgano, tejido) Están codificadas por genes diferentes. Algunas son oligoméricas, poseen varias subunidades: la combinación de estas subunidades de las isoenzimas. Presentan diferencias de punto isoeléctrico, por lo que se pueden desplazar por electroforesis.

Ejemplo: La lactato hidrogenasa (LDH) que produce la oxidación de piruvato a lactato. El piruvato inhibe alostéricamente H4y no para M4.

COMPLEJOS MULTIENZIMÁTICOS

Son asociaciones de enzimas: se canalizan los intermedios metabólicos de una enzima a otra y permiten una regulación coordinada. El complejo piruvato deshidrogenasa (PDH) cataliza la transformación de piruvato en acetil-CoA. Es un complejo multienzimático que presenta 3 actividades enzimáticas diferentes (piruvato deshidrogenasa, dihidrolipoildeshidrogenasa y dihidropoiltransacetilasa) y 5 coenzimas o grupos prostéticos.

TEMA 8.2. Vitaminas y Coenzimas.

Una coenzima es una molécula orgánica necesaria para que se pueda producir una reacción.

dióxido de carbono por carboxilasas, descarboxilasas y transcarboxilasas. Su carencia produce en ratas dermatitis.