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Asignatura: Microbiología, Profesor: Ricardo Amils, Carrera: Biología, Universidad: UAM
Tipo: Apuntes
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Los elementos de la tabla periódica según su relación con los microorganismos se clasifican en micronutrientes (carbono, hidrógeno, oxígeno, nitrógeno, fósforo, azufre, potasio, magnesio, sodio, calcio y hierro) y microelementos (boro, cromo, cobalto, cobre, hierro, manganeso, molibdeno, níquel, selenio, tungsteno, vanadio o zinc)
- Metabolismo asimilativo : ruta metabólica para incorporar un determinado elemento en algún componente celular, se asimila lo necesario para la célula. Un ejemplo de este sistema es la asimilación del C, que se puede realizar por distintas rutas como el ciclo de Calvin, o la fijación de nitrógeno. - Metabolismo desasimilativo : ruta metabólica asociada a la obtención de energía. Cuanto más mejor. Ejemplos de esto es la respiración anaerobia o respiración aerobia.
Se parte de una forma muy reducida del carbono (heterótrofo) o muy oxidada (autótrofos). Intervienen distintos procesos como la fotosíntesis aerobia y anaerobia y la espiración aerobia que vuelve al carbono a su forma oxidada. Hay además bacterias metanógenas que producen metano.
La mayor parte del carbono procede de la fotosíntesis, por lo que los organismos autótrofos se encuentran en la base del ciclo. Así el carbono atmosférico es fijado en moléculas orgánicas por los autótrofos que se acumula en las células. Este carbono es degradado por diversos organismos y queda acumulado en forma de metano o de dióxido de carbono. El CH 4 se produce por la actividad de las metanogenas y el CO 2 por diversos quimioorganotrofos mediante la respiración aerobia, fermentación y la respiración anaerobia. El metano es muy poco soluble por lo que es fácilmente transportado a zonas oxidadas y pasa a ser CO 2 por los metanotrofos. En consecuencia todo el carbono se revierte a CO 2 a partir del cual comienza el metabolismo autótrofo.
Las bacterias suelen utilizar el ciclo de Calvin para asimilar carbono, pero otras tienen rutas alternativas. Entre estas rutas destacan el ciclo de los ácidos tricarboxilicos (al revés, ciclo reductivo) o el ciclo reductivo de acetil-CoA. Hay otros ciclos más peculiares, como el ciclo del 3- hidroxipropionato, que sólo se ha encontrado en una bacteria verde NO de azufre, hay autores que piensan que fue el primer sistema de autotrofía. Hay dos nuevos caminos recién descubiertos en algunas arqueas.
Ciclo de : Calvin ciclo que parte de 6 moléculas de CO2 que dan lugar a una molécula de fructosa-6- fosfato. Algunos microorganismos tienen orgánulos especializados para que haya una alta concentración de enzimas encargadas de este ciclo (carboxisomas).
CoA : introduce en CO2 por dos reacciones. Una de ellas o n intermediarios usa como núcleos Fe y Ni. Esto lo utilizan las bacterias metanógenas.
Es más complejo que el del carbono. Podemos encontrarlo muy reducido en forma de amoniaco, oxidado en nitrato y muy oxidado nitrito. Solamente algunas bacterias y procariotas son capaces de
asimilar el N 2 atmosférico. En el caso del nitrógeno lo importante es la asimilación y por otro lado las
reacciones que son capaces de oxidarlo para usarlo como fuente de energía.
La conversión de nitrato a nitrógeno gaseoso se conoce como desnitrificación y es el principal proceso biológico de formación de N (^) 2. Es un proceso de consumo de nitrato. El amoniaco que se produce durante la descomposición de restos biológicos se encuentra en forma de amonio. La nitrificación es la oxidación de NH 3 a NO 3 -^ ocurre por la acción de las bacterias nitrificantes. Es un proceso de producción de nitrato.
El amoniaco es el sustrato de reacciones que catalogan la formación de aminoácidos (glutamina). También puede transformar la glutamina en glicerol.
El nitrógeno atmosférico más poder reductor da lugar a dos moléculas de amoniaco y H que podría usar como fuerte de energía alternativa.
La formas más oxidada es el sulfato (SO 4 2-^ ) y la más reducida el sulfidrico (H (^) 2S), pero hay mucha variedad de estado de oxidación y por eso es un ciclo complejo. Tiene algunas reacciones asimilativas y otras desasimilavita. El camino desasimilativo del sulfato es una reacción que sirve para obtener energía. Esta ruta se da con APS, pero si se da con PAPS, se da un H2S que sirve para el metabolismo.
El hierro elemental no existe en la naturaleza, siempre lo encontramos como reducido u oxidado. La asimilación del hierro no está muy estudiada, se sabe que es fundamental pero no como se introduce en la célula. Se sabe que no puede introducirse libre ya que esto daña a la célula. Par a evitar esto se tienen unas estructuras denominada ferritina que almacenan hierro.
La vida se desarrolla a pH 7, en estas condiciones está en forma de roca y no es soluble, por lo que los organismos se lo roban unos a otros. Para resolver el problema del hierro limitaste se han creado unas estructuras muy específicas que secuestran hierro, este mecanismos es muy específico.