TEMA 11. ELS RETROVIRUS I ELS RETROTRANSPOSONS
AMB LTRs
Tipus i Fiolgènia
Estructura
Cicle vital
Transcriptasa reversa
Retrotranscripció i integració en el genoma de l’hoste
Expressió dels gens gag, pol i env
Retrotransposons semblants a retrovirus
________________________________________________
Els retrovirus són virus que tenen RNA com a material hereditari i un
pas obligat de retrotranscripció (pas de RNA a DNA) per integrar-se
com en el genoma de l’hoste. Alternativament, els retrovirus podrien
ésser considerats retrotransposons (element genètics de DNA que tenen
un pas obligat de transcripció per mobilitzar-se) que per moure’s d’un
lloc a l’altre del genoma han de sortir de la cèl·lula inicial i infectar una
nova cèl·lula. En aquest sentit, quan es comparen amb els
retrotransposons, els retrovirus són elements genètics que han adquirit
una nova funció. La filogènia ens demostra que tots els retrovirus tenen
un origen comú i que el virus de la SIDA (lentivirus) forma part del grup
més evolucionat. El genoma bàsic que comparteixen tots els retrovirus
està format per tres gens: gag, pol (la transcriptasa reversa) i env
flanquejats per dues seqüències repetides (R) i dues úniques (U5 i U3).
El seu cicle vital inclou un pas de retrotranscripció previ a la integració
d’una còpia de DNA dúplex en una o varies localitzacions
cromosòmiques de la cèl·lula hoste. Les formes províriques dels
retrovirus contenen un extrem LTR que fa la funció de promotor i
garanteix un nivell alt d’expressió dels gens provírics. La síntesi de les
proteïnes gag i pol es produeix a partir d’un mateix RNA, ja que de
vegades la traducció pot "saltar-se" el codó stop entre gag i pol, bé per
un canvi de pauta de lectura causat per estructures secundàries que es
formen transitòriament en el mRNA que fan que el ribosoma
s'equivoqui en una seqüència específica (i "rellisqui", habitualment a -
1), o bé per uns tRNAs “particulars” que poden ometre aquest codó stop.
Molts retrovirus son agents oncogènics, bé perquè alteren l’expressió de
gens cel·lulars “normals” (agents oncogènics febles), o perquè són
transductors d’oncogens (agents oncogènics forts).
Els retrotransposons semblants-a-retrovirus són un tipus
d’elements genètics transposables (EGT) que es mobilitzen via RNA, és
a dir, que depenen de la transcripció inversa (RT) per a la transposició.
En el seu interior tenen regions codificants homòlogues a dues de les tres
regions codificants dels retrovirus. Són les que els permeten sintetizar els
enzims responsables del seu cicle biològic: regió POL, per als enzims
transcriptasa inversa, integrasa i proteasa; i regió GAG, per a proteïnes
de càpside interna. També tenen extrems semblants als retrovirus (amb
LTR, repeticions terminals llargues). Així doncs els seus genomes es
diferencien dels genomes retrovirics per l’absència de regió codificant
ENV, per a proteïnes d’embolcall extern. D’acord amb això, aquest
