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Asignatura: fundamentos de ingenieria genetica y genomica, Profesor: Julián Perera, Carrera: Biología, Universidad: UCM
Tipo: Apuntes
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FUNDAMENTOS DE INGENIERÍA GENÉTICA Y GENÓMICA Grado en Biología
Departamentos de Bioquímica y Biología Molecular, I y Genética Facultad de Ciencias Biológicas. U.C.M.
EJERCICIO 1.1. A partir de 4 ml de un cultivo bacteriano (primer tubo de la serie indicada en la figura) se tomó una alícuota cuyo volumen se indica encima de la flecha y se diluyó hasta el volumen indicado en el segundo tubo. De manera similar se realizaron varias diluciones tal como se indica. Finalmente, 100 μl de la última dilución se extendieron en una placa con agar nutritivo. Tras su incubación a 37ºC apareció el número de colonias que se indica. ¿Cuál es el nº de células/ml presentes en cada una de las diluciones y en el cultivo original?.
volumen de alícuota 1 μl 1 μl 10 μl 100 μl nº células en alícuota 2x10 7 2x10 4 50 50 volumen del tubo 4 ml 1 ml 4 ml 100 μl nº células en tubo 8x10 10 2x10 7 2x10 4 50 conc en tubo (cel/ml) 2x10^10 2x10 7 5x10 3 5x10 2
EJERCICIO 1.2. Se desea realizar una reacción de restricción en un volumen final de 20 μl. La mezcla de reacción ha de contener 2 μl de la disolución de enzima de restricción, BSA a una concentración de 1 mg/ml, un tampón a una concentración 1x y 100 μg de DNA. Calcula los volúmenes que deberán de tomarse de las correspondientes soluciones stock de: BSA (20 mg/ml), tampón (10x) y DNA (50 mg/ml).
FUNDAMENTOS DE INGENIERÍA GENÉTICA Y GENÓMICA Grado en Biología
Departamentos de Bioquímica y Biología Molecular, I y Genética Facultad de Ciencias Biológicas. U.C.M.
stock tomar final enzima disolución 2 μl 2 μl BSA 20 mg/ml 1 μl 1 mg/ml Tampón 10 x 2 μl 1 x DNA 50 mg/ml 2 μl 100 μg Agua 13 μl 20 μl
EJERCICIO 1.3. Se quiere preparar un gel al 1,1 % (p/v) de agarosa en 20 ml de tampón MOPS 1x. Indica los gramos de agarosa y los ml de tampón MOPS 10x que se necesitan. La composición del tampón MOPS 10x es: MOPS 0,4 M, NaAc 0,1 M, EDTA 0,02 M. Conociendo el Pm de los componentes, calcula los gramos de cada uno de ellos que se necesitan para preparar 1 litro de dicho tampón 10x. SOLUCIÓN
Gel 1,1 % stock tomar final Agarosa 220 mg 1’1 g / 100 ml MOPS 10 x 2 ml 1 x Agua hasta... 20 ml
MOPS 10x Pm g para 1l de disolución conc. Final MOPS 0,4 M 209,3 83,72 g 0,4 M NaAc 0,1 M 82 8,2 g 0,1 M EDTA 0,02 M 372,3 7,446 0,02 M
EJERCICIO 1.4. Un cultivo en fase estacionaria de E.coli contiene, aproximadamente, 5x10^9 células/ml. La estirpe CDV3 contiene 25 copias por célula de un plásmido de 5.0 kb. ¿Qué masa de plásmido debería obtenerse en una miniprep de 3 ml de un cultivo de CDV3?. SOLUCIÓN En 3 ml del cultivo hay 5 x 10 9 x 3 células 5 x 10 9 x 3 x 25 moléculas de plásmido En 3 ml del cultivo hay 5 x 10^9 x 3 x 25 x 5 10 3 pares de bases Dividiendo por el nº de Avogadro 5 x 10 9 x 3 x 25 x 5 10 3 / 6,023 x 10 23 moles de pb Multiplicando por el Pm medio de un pb (660) 5 x 10 9 x 3 x 25 x 5 10 3 x 660 / 6,023 x 10 23 Resultan = 2,05 x 10 -6^ g (unos 2 μg) de plásmido