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Tarea 2 genome data viewer, Ejercicios de Genética Médica

Introducción a la genética genome data

Tipo: Ejercicios

2021/2022

Subido el 08/03/2023

arleth-gallardo
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TAREA 2 DE GENÉTICA: TRABAJAR EN EL GENOME DATA VIEWER
Busca con el Genome data viewer la secuencia FASTA del gen que se encuentra en 11p15.4, de las
bases 5.225 Mb a 5.227 Mb. Viene descrita en sentido 5´ a 3´.
Este gen tiene dos intrones: el intrón 1 va desde la base 143 a la base 272 y el intrón 2 desde la
base 496 a la base 1345.
La TAREA consiste en:
1) Ubica el gen en el mapa físico y el ideograma.
2) Identifica qué gen es y qué función cumple en la biología humana.
3) Ordena la secuencia de bases del gen en columnas de 10 en 10,
dejando dos espacios intermedios entre cada columna. Forma seis
columnas de bases en cada renglón y escribe un numerador de bases
antes de la primera columna en cada renglón, como se ve en esta
imagen:
1) Ubicación del gen
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TAREA 2 DE GENÉTICA: TRABAJAR EN EL GENOME DATA VIEWER

Busca con el Genome data viewer la secuencia FASTA del gen que se encuentra en 11p15.4, de las

bases 5.225 Mb a 5.227 Mb. Viene descrita en sentido 5´ a 3´.

Este gen tiene dos intrones: el intrón 1 va desde la base 143 a la base 272 y el intrón 2 desde la

base 496 a la base 1345.

La TAREA consiste en:

1) Ubica el gen en el mapa físico y el ideograma.

2) Identifica qué gen es y qué función cumple en la biología humana.

3) Ordena la secuencia de bases del gen en columnas de 10 en 10,

dejando dos espacios intermedios entre cada columna. Forma seis

columnas de bases en cada renglón y escribe un numerador de bases

antes de la primera columna en cada renglón, como se ve en esta

imagen:

1) Ubicación del gen

2) ¿Qué gen es y qué función tiene?

Gen HBB: Hemoglobin subunit beta

Función: contribuye a la unión de haptoglobina, permite la unión de

hemoglobina, hemoglobina alfa, iones metálicos, ácidos orgánicos, oxígeno,

permite el transporte de oxígeno, la unión a proteínas, etc.

3) Ordenar la secuencia de bases del gen en columnas de 10 en 10 :

ACATTTGCTT CTGACACAAC TGTGTTCACT AGCAACCTCA AACAGACACC ATGGTGCATC

TGACTCCTGA GGAGAAGTCT GCCGTTACTG CCCTGTGGGG CAAGGTGAAC GTGGATGAAG

TTGGTGGTGA GGCCCTGGGC AGGTTGGTAT CAAGGTTACA AGACAGGTTT AAGGAGACCA

ATAGAAACTG GGCATGTGGA GACAGAGAAG ACTCTTGGGT TTCTGATAGG CACTGACTCT

CTCTGCCTAT TGGTCTATTT TCCCCACCCT TAGGCTGCTG GTGGTCTACC CTTGGACCCA

GAGGTTCTTT GAGTCCTTTG GGGATCTGTC CACTCCTGAT GCTGTTATGG GCAACCCTAA

GGTGAAGGCT CATGGCAAGA AAGTGCTCGG TGCCTTTAGT GATGGCCTGG CTCACCTGGA

CAACCTCAAG GGCACCTTTG CCACACTGAG TGAGCTGCAC TGTGACAAGC TGCACGTGGA

TCCTGAGAAC TTCAGGGTGA GTCTATGGGA CGCTTGATGT TTTCTTTCCC CTTCTTTTCT

ATGGTTAAGT TCATGTCATA GGAAGGGGAT AAGTAACAGG GTACAGTTTA GAATGGGAAA

CAGACGAATG ATTGCATCAG TGTGGAAGTC TCAGGATCGT TTTAGTTTCT TTTATTTGCT

GTTCATAACA ATTGTTTTCT TTTGTTTAAT TCTTGCTTTC TTTTTTTTTC TTCTCCGCAA

TTTTTACTAT TATACTTAAT GCCTTAACAT TGTGTATAAC AAAAGGAAAT ATCTCTGAGA

TACATTAAGT AACTTAAAAA AAAACTTTAC ACAGTCTGCC TAGTACATTA CTATTTGGAA

TATAGTGTGC TTATTTGCAT ATTCATAATC TCCCTACTTT ATTTTCTTTT ATTTTTAATT

GATACATAAT CATTATACAT ATTTATGGGT TAAAGTGTAA TGTTTTAATA TGTGTACACA

TATTGACCAA ATCAGGGTAA TTTTGCATTT GTAATTTTAA AAAATGCTTT CTTCTTTTAA

TATACTTTTT TGTTTATCTT ATTTCTAATA CTTTCCCTAA TCTCTTTCTT TCAGGGCAAT

AATGATACAA TGTATCATGC CTCTTTGCAC CATTCTAAAG AATAACAGTG ATAATTTCTG

GGTTAAGGCA ATAGCAATAT CTCTGCATAT AAATATTTCT GCATATAAAT TGTAACTGAT

GTAAGAGGTT TCATATTGCT AATAGCAGCT ACAATCCAGC TACCATTCTG CTTTTATTTT

ATGGTTGGGA TAAGGCTGGA TTATTCTGAG TCCAAGCTAG GCCCTTTTGC TAATCATGTT

CATACCTCTT ATCTTCCTCC CACAGCTCCT GGGCAACGTG CTGGTCTGTG TGCTGGCCCA

TCACTTTGGC AAAGAATTCA CCCCACCAGT GCAGGCTGCC TATCAGAAAG TGGTGGCTGG

TGTGGCTAAT GCCCTGGCCC ACAAGTATCA CTAAGCTCGC TTTCTTGCTG TCCAATTTCT

ATTAAAGGTT CCTTTGTTCC CTAAGTCCAA CTACTAAACT GGGGGATATT ATGAAGGGCC

TTGAGCATCT GGATTCTGCC TAATAAAAAA CATTTATTTT CATTGCAA