Taxonomía bacteriana: Clasificación, Nomenclatura y Métodos de Identificación - Prof. Sánc, Apuntes de Farmacia

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Tema 2

Taxonomía bacteriana

Tema 2. Taxonomía bacteriana 2.1. Introducción2.2. Evolución y diversidad microbiana2.3. Rangos taxonómicos

2.3.1. Concepto de especie 2.4. El Manual de Bergey2.5. Sistemas de clasificación

2.5.1. Clasificación fenética2.5.2. Clasificación filogenética 2.6. Métodos para la clasificación e identificación de los

microorganismos2.6.1. Características clásicas2.6.2. Características moleculares 2.7. Nomenclatura bacteriana

2.2. Evolución y diversidad microbiana

- Antigüedad planeta: 4.600millones de años.- Procariotas: 3.500 a 3.800millones de años. -^ Probable orden de aparición:

anaerobiascianobacteriasfotosíntesis productorade O

(2.500 a 3.000 2 millones de años).

-^ Árbol con tres gruposprimarios Bacteria, Archaea y Eucarya

Metanógenas Arqueobacterias

Urcariotas

Eubacterias

Eucariotas Ancestro universal

Thermoproteus

Hongos Halófilasextremas Thermoplasma Sulfolobus

Bacteriasgram positivas Plantas Animales

Ratones Protozoos

Mitocondrias

Cloroplastos Cianobacterias Bacteriasfotosintéticaspúrpura

Espiroquetas Bacteriasfotosintéticasverdes

Metanógenas

2.3. Rangos taxonómicos - Estructura jerárquica en taxonomía bacteriana:

Enterobacter

Escherichia

Klebsiella

Proteus

Salmonella

Yersinia

Serratia

Shigella

Género

Eubacteria Proteobacteria

β-proteobacteria

δ-proteobacteria

γ-proteobacteria

ε-proteobacteria

α-proteobacteria Chromatiales Thiotrichales Legionellales Pseudomonadales

Enterobacteriales Pasteurellales

Orden

Vibrionales

Enterobacteriaceae

Dominio^ Reino^ Sección Familia Especie

S. boydii

S. dysenteriae

S. flexneri

S. sonnei

• Los sufijos característicos de cada nivel son: Familia (-aceae) y Orden (-ales).

Colecciones de Cultivo Son organizaciones que se ocupan de guardar las cepas demicroorganismos y suministrarlas a la comunidad científica

• Recolección - Conservación - Suministro

CECT: Colección Española de Cultivos Tipo ATCC: American Type Culture CollectionDSMZ: Deutsche Sammlung von Mikroorganismenund Zelkulturen

International Journalos Systematic and Evolutionary Microbiology

Descripción de los nuevos microorganismos

Publicado en 1923 por David Bergey ycol. “Bergey’s Manual of DeterminativeBacteriology”

, 9ª edición

“Bergey’s Manual of SystematicBacteriology”

, un trabajo

2.4. El manual de Bergeymás detallado con descripciones detodos los procariotasidentificados

David H. Bergey

1860-

Otros recursos: The Prokariotes

http://www.prokaryotes.com

Recursos on-line de Taxonomía:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

Lista de nombres validados:

http://www.bacterio.cict.fr/

2.6. Métodos para la clasificación e identificación de los microorganismos

Características

clásicas

MorfológicasFisiológicas y metabólicasEcológicasGenéticas

Características

moleculares

Comparación de proteínasComposición de ácidos nucleicosHibridación de ácidos nucleicosSecuenciación de ácidos nucleicosPCR

Operón ARNrOperón ARNr

ARr 16S

Aprox. 1500 nucleótidos

ARr 23S

Aprox. 3000 nucleótidos

ARr 5S

Aprox. 120 nucleótidos

PCR (aprox. 1500 n)

PCR (aprox. 1700 n)

PCR (aprox. 1300 n)

PCR (aprox. 1450 n)

16F

16R

16F

16R 23F

5R

23F

23R

• La especie suele hacer referencia a una característica específica o relevante:

Color de la colonia

:^ Bacillus

cereus

,^ Micrococcus

luteus

Staphylococcus

roseus

,^

Streptomyces

griseus.

Enfermedad producida

:^ Vibrio

cholerae

,^ Klebsiella

pneumoniae

Clostridium

botulinum

,^ Bacillus

anthracis.

Lugar de aislamiento

:^ Haloarcula

hispanica

,^ Halomonas

hispalensis

Pseudomonas

congolensis

,^ Streptomyces

venezuelae.

Localización

:^ Helicobacter

pylori

, Escherichia

coli

, Treponema

oralis.

Descubridor

:^ Coxiella

burnetii.

Morfología especial

:^ Leptospira

interrogans.

Hospedador animal

:^ Brucella

canis

,^ Mycoplasma

hominis.

2.7. Nomenclatura bacteriana

• Algunas bacterias tienen un nombre común:

Neisseria gonorrhoeae

(gonococo

Neisseria meningitidis

(meningococo

Streptococcus pneumoniae

(neumococo

Enterococcus faecalis

(enterococo

Mycobacterium tuberculosis

(bacilo de Koch

Mycobacterium leprae

(bacilo de Hansen

• Se pueden castellanizar los nombres cuando se alude a grupos:^ Estafilococos, estreptococos, legionelas, neiserias, micobacterias,

2.7. Nomenclatura bacteriana salmonelas, etc.