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Asignatura: Biologia Celular Aplicada, Profesor: Pepa Hazen, Carrera: Biología, Universidad: UAM
Tipo: Apuntes
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En el tráfico intracelular de membrana participa el RE, Golgi, compartimento endosomal y la propia membrana plasmática.
El transporte corresponde a un proceso de movilización de proteínas y lípidos a través de carriers con el fin de llevarlos a sus destinos correspondientes. Hay dos vías dentro de este tráfico:
El transporte puede ir en uno u otro sentido. Las proteínas a veces, tiene que llegar a un determinado destino, pero en otros casos deben ser recicladas para posteriormente reutilizarse.
La vía biosintética así como todos sus compartimentos fue definida por Palade, utilizando pulso y caza a través de MET. Consiste en meter una molécula marcada, la incorporan en el RE y la caza es ir viendo donde se encuentra esa molécula. Por otra parte, Brown y Goldstein descubren la endocitosis mediada por receptor.
Hay dos tipos de retículo endoplásmico:
- RER: Presenta ribosomas adheridos. Su papel fundamental es la síntesis y el procesamiento de las proteínas.
La síntesis de proteínas siempre se inicia en ribosomas libres del citosol, pero algunas de estas proteínas van a completar su síntesis en el RER. Las proteínas que se sintetizan en ribosomas adheridas al RER son:
Las proteínas que terminan su síntesis en ribosomas libres no participan en el tráfico celular, estas proteínas son las que se dirigen al núcleo, a las mitocondrias o a los peroxisomas.
Para que se dirijan estas proteínas tienen una secuencia señal , a la cual se unirán cofactores que la guiarán a su destino. Si una proteína no tiene secuencia señal se quedaría en el citosol. La importación al RER puede ser:
Dependiendo del tipo de proteína que se sintetice, vamos a tener un proceso distinto, ya que hemos hablado que en el tráfico intracelular existían tanto proteínas solubles como transmembranosas.
La tipología puede ser diversa, tenemos distintas proteínas que se pude sintetizar en el RER. Una de las características es la posición que tengan los extremos N-terminal y C-terminal.
La chaperona Bip son proteínas que acompañan a otras proteínas. Esta chaperona es del grupo de as HsP70, característica del RE y se encuentra en la luz.
Es necesaria para tirar de la cadena polipeptídica por el canal hacia el RER. La chaperona mantiene el canal de translocación en la conformación con unión a ADP y experimenta un cambio conformacional inducido por la unión de ATP que abre el poro una vez el polipéptido haya alcanzado una longitud de 70aa. La chaperona permite la apertura del canal de translocación y asegura el correcto plegamiento de la proteína, permaneciendo unida a ella.
Es característico de la proteínas del RE el hecho de que se encuentren N-glicosiladas que, consiste en la formación de un enlace covalente. Las proteínas que se están glicosilando forman un compuesto formado por:
La N-glicosilación sirve para:
En el retículo se sintetizan:
Síntesis de fosfolípidos.
En los hepatocitos es donde se sintetizan mayor cantidad de moléculas lipídicas. Todos los enzimas que participan en la síntesis de fosfolípidos van a tener sus lugares activos mirando al citosol. En principio como todo tiene lugar en la cara citosólica, es lógico pensar que los nuevos fosfolípidos se localizan en esa cara. Para que no crezca una monocapa y la otra no, existen lipasas inespecíficas que mueven los fosfolípidos de una monocapa a la otra. En los distintos compartimentos habrá lipasa específicas que van a situar los fosfolípidos en la monocapa correspondiente. La membrana en el RE es simétrica, mientras que en la membrana plasmática, en lo lisosomas o en el Golgi es asimétrica, porque las específicas sitúan a los fosfolípidos en la monocapa correspondiente.
Síntesis esfingolípidos. Se van a producir a partir de la ceramida en una reacción secuencial que tiene lugar en el REL, pero a continuación el hecho del procesamiento final de ese esfingolípido va a tener lugar en el complejo de Golgi, donde hay una O-glicosilación que modifica las proteínas.
Síntesis de colesterol. La síntesis empieza en el citosol a partir de Acetil CoA y acetoacetil CoA. Una vez formado Farnesil pirofosfato, la síntesis pasa a tener lugar en el REL.
El tráfico vesicular se da en dos sentidos opuestos:
- Transporte anterógrado : desde el retículo endoplásmico hacia el Golgi.
Ambos sentidos son necesarios, tanto para que las proteínas lleguen a sus destinos, como para que puedan producirse procesos de reciclaje de otras proteínas.
Cualquier estructura de transporte (vesícula o túbulo-vesícula) se originará a partir de una determinada membrana (del Golgi, por ejemplo) y se desplazará a través del citoesqueleto (gracias a proteínas motoras) hasta su destino, donde se fundirá con la membrana aceptora (membrana del compartimento aceptor).
El tráfico se da a través de la cooperación de dos estructuras de transporte:
- Vesículas : Carriers o transportadores.
El tráfico intracelulare va a depender de un grupo de proteínas que son las G monoméricas, y que van a estar implicadas en rutas de señalización, regulando todas las etapas del tráfico intracelular.
El tráfico intracelular va a depender de un grupo de proteínas que son las G monoméricas que van a estar implicadas en rutas de señalización. Estas G van a regular toda la etapa del tráfico intracelular. Van a recular el brote y revestimiento de la vesícula, el transporte de las vesículas y van a regular la fusión con la membrana aceptora. En cualquier etapa del tráfico intracelular nos vamos a encontrar con un control de la GTPasas monoméricas. Dentro de estas nos podemos encontrar distintas familias (ras, rho, rhab,sari/Arf y Ran).
Las GTPasas monoméricas tienen un papel fundamental en el transporte. Actúan como interruptor molecular alternando entre estado activo e inactivo. Las GTPasas monoméricas implicadas en el transporte pertenecen a la familia Rab y la familia Sar1/Arf.
Unidas a GDP, las GTPasas están inactivas; unidas a GTP están activas. Además del ciclo GTP/GDP, estos interruptores moleculares requieren de una serie de cofactores para funcionar :
GDI (inhibidor de la disociación de nucleótidos: mientras esté unido a la GTPasa, el GDP no se puede retirar y la GTPasa se mantiene inactiva). ¿Puede mantener el GTP unido para mantener la GTPasa activa?
El movimiento tanto de proteínas como de cargas que llevan los componentes del tráfico celular, se va a producir a través de diferentes tipos de estructura de trasportes y no solo a través de vesículas.
Son vesículas revestidas y por tanto lo primero que tienen que hacer es formar la vesícula, formar el revestimiento y formar la carga. Luego se escinde de la membrana, pierde el revestimiento y se une con la membrana del compartimento aceptor donde participaban las proteínas SNARE. Este proceso es el mismo independientemente del tipo de vesícula de la que hablemos.
Las vesículas de trasporte para el tráfico intracelular son de tres tipos:
- Vesículas COPII. Siempre participan en el transporte anterógrado. - Proteínas de revestimiento: Complejos Sec23/Sec24 y Sec13/Sec31, Sec 16 - GTPasa asociada: Sar - Vesículas COPI. Participan en el transporte retrógrado. - Proteínas de revestimiento: Coatómeros que contienen 7 subunidades COP diferentes. - GTPasa asociada: ARF - Vesículas de clatrina. Participan tanto en el direccionamiento desde la red trans Golgi hasta el compartimento endosomal, como en la endocitosis. - Proteínas de revestimiento: Clatrina + complejos AP1; Clatrina + GGA; Clatrina + complejos AP2; complejos AP3. - (^) GTPasas asociadas: Siempre ARF
Todas estas vesículas presentan una estructura bastante homóloga (conservada durante la evolución) y todas presentan GTPasas asociadas, que pueden ser Sar1 o ARF. Actúan tanto en la ruta biosintética como en la ruta endocítica.
FORMACIÓN DE VESÍCULAS COP II (transporte anterógrado).
Las proteínas citosólicas responsables del reclutamiento de los componentes de revestimiento de la vesícula son las GTPasas , en el caso de las vesículas COPII la GTPasa sería Sar1.
La proteína citosólica responsable del reclutamiento de los componentes de revestimiento de la vesícula que actúa como GTPasa, es la Arf6. Las proteínas de recubrimiento serán:
- Clatrina
El monómero de la clatrina se conoce como trisquelión constituido por 3 cadenas pesadas y 3 ilgeras. Este trisquelión se autoensamblan hasta que finalmente da lugar a una malla que recubre a la clatrina. Pero además tiene que ir acompañada de complejos adaptadores que van a reconocer la carga. Los complejos adaptadores, por tanto, se unen físicamente a la carga y son responsables de la regulación de la ruta en la que están funcionando. Hay 3 tipos de adaptadores funcionando en distintos tipos de transporte:
Los complejos AP funcionan tanto en la ruta endocítica como en la ruta biosintética. AP1-B se dirige de la red trans del Golgi hacia la membrana plasmática basolateral (ruta biosintética); AP1-A se dirige desde el endosoma a la red trans del Golgi (ruta endocítica, transporte retrógrado). AP-2 está presente únicamente en las vesículas que incorporan a la célula proteínas por endocitosis. AP-3 desde el endosoma hacia lisosomas, o desde la red trans del Golgi a lisosomas. AP-4 no se tiene claro.
Los complejos GGA aparecen en vesículas que se dirigen desde la red trans del Golgi hasta el compartimento endosomal. Esas vesículas contienen enzimas lisosomales (proteínas solubles) y proteínas transmembrana (forman la membrana del compartimento).
Las estoninas participan en la vía endocítica en la que antes participaba AP-2. A veces, las vesículas que incorporan a la célula proteínas por endocitosis exponen AP-2 + estonina, o únicamente AP-2 (no se han visto vesículas con solo estonina).
En la escisión de la vesícula, participa la dinamina (y no la GTPasa, como para COPII y COPI). La dinamina se polimeriza alrededor del cuello de la vesícula y la escinde.
No hay proteínas GEF en las vesículas de clatrina y la actividad GAP de desensamblaje de la cubierta realizada por componentes proteícos en las anteriores vesículas, se produce espontáneamente en las vesículas de clatrina, sin ayuda de proteínas GAP. La dinamina es capaz de hidrolizar GTP (al escindir la vesícula imagino), y esa energía es la que utiliza para el desensamblaje.
Tengo puesto que esto último es equivalente al rol de la GTPasa en las vesículas COPI y COPII; sin embargo, el rol de la GTPasa en estas vesículas es actuar como una dinamina, enrollarse al cuello y escindir, mientras que el rol de las proteínas GAP en estas vesículas es hidrolizar GTP y desensamblar la cubierta.
¿No sería por tanto el rol de la dinamina equivalente al de la proteína GAP a la hora de hidrolizar GTP para aportar energía para el desensamblaje?
Hay varios tipos de elementos túbulo-vesiculares:
Se trata de una secreción constitutiva, que lleva a cabo cualquier célula y que se encarga de liberar a la matriz los componentes de la misma. Se produce un trasporte retrogrado desde el Golgi.
En estos casos no se lleva a cabo por vesículas sino por elementos túbulos-vesiculares.
En el ERGIC y en la zona de trasporte retrogrado vemos que tenemos COPI y COPII, por lo que presenta revestimiento. Esto es debido a que la sección de la carga depende del revestimiento de la vesícula, siendo el caso de clatrina en las proteínas trasportadoras. Para reconocer la caga por tanto, necesitan el mismo tipo de túbulos.
Hay grandes dudas acerca de cómo las vesículas o las estructuras tubulares llegan hasta el ERGIC. Se habla de la presencia de microtúbulos que obligarían a las vesículas a llegar hasta el ERGIC, pero también puede haber un movimiento independiente de los microtúbulos de forma que las vesículas podrían moverse a través de un complejo proteico. Todo está dirigido hacia Sec23. Se ha visto que si despolarizamos los microtúbulo y estabilizamos cargas por COPII, estas cargas llegarían al ERGIC.
Hay que tener en cuenta que en la región ERES del retículo, cualquier estructura que se vaya a dirigir hacia el complejo de Golgi lo va a hacer siempre con un revestimiento del tipo COPII. Este revestimiento de tipo COPII a medida que las vesículas van avanzando hacia el Golgi van, a perder el revestimiento y van a quedar como vesículas desnudas que se van a fundir unas con otra (fusión homotípica de membrana). Esa fusión es lo que origina el ERGIC. El ERGIC es un compartimento que se va a producir por la fusión de vesículas o carriers que proceden del ERES. Es en este ERGI donde la carga que nos queda, o se va al Golgi o vuelve al retículo.
Necesitamos la presencia de calcio para que se produzca la fusión de membrana. En la vesícula llevamos una v-SNARE, y vemos como en la membrana aceptora nos encontramos con t-SNARE. Para que se produzca la fusión se tiene que dar:
La ruta biosintética será aquella en la que a partir de componentes que se han sintetizado en el RE va a haber un tráfico en dirección a la MP, tráfico que va a pasar por el ERGI, por el Golgi y a partir de ahí se va a dirigir a la MP o bien a que se produzca un producto de secreción o al compartimento endosomal.
La ruta endocítica se inicia en la MP con distintos tipos de trasportadores, o bien que se integren moléculas que o bien estaban en el interior o como ya hemos visto, porque sean proteínas de la mb y que se deben reciclar o retirar de la mb.
Para que una determinada proteína se dirija a una determinada vesícula o molécula de trasporte necesita llevar una secuencia señal que nos va a indicar que tipo de vesícula la va a trasportar y por tanto que destino tiene. Por ejemplo las proteínas que van marcadas con manosa 6-fosato que pertenecen al compartimento endosomal. Cada proteína que va a salir de RE tiene que llevar una secuencia señal que tiene que ser reconocida por una vesícula y que la lleve a su destino.
La primera ruta de la ruta biosintética es el trasporte que se produce entre el RE al complejo de Golgi. Antes de salir del RE todas las proteínas que se han sintetizado en él tienen que sufrir el control de calidad, que asegura que esas proteínas tengan un correcto plegamiento y que estén perfectamente gliosiladas. Para eso las mb del retículo su contenido cuenta con proteínas chaperonas, y que se encargan de hacer la modificaciones oportunas para la proteína recién sintetizada y permitirle la salida del RE.
Las proteínas a partir de su secuencia de aa tienen que sufrir plegamiento hasta llegar a su estructura. Para ello es necesario la formación de puentes disulfuro y el ensamblaje de las proteínas. Hay una proteína en el RE que son chaperonas moleculares que se encargan del primer proceso de control de calidad. Si una vez que han actuado las chaperonas la proteína no está correctamente plegada, entonces va a ser retrotranslocada al citosol y va a ser degradada mediante el proteasón. Este proceso de retrotranslocación y degradación se denomina proceso de ERAD.
Las proteínas sintetizadas en el RE llevan un residuo de oligosacáridos formado por 3 glucosas y una manosa. A través de glucosidasa se retira dos de las 3 glucosas finales. El oligosacárido ahora solo tiene glucosa, este paso es necesario ya que las chaperonas solo pueden actuar cuando solo tienen una glucosa. Cuando ya tenemos una sola glucosa se une la proteína a una chaperona en el RE, que puede ser la calnexina o la calreticulina (soluble). Cuando se ha unido a la chaperona, la proteína queda retenida y una serie de enzimas como la proteindisulfuroisomerasa (PDI) sea capaz de establecer puentes disulfuro en la proteína. Una vez que se han establecido esos puentes vuelve a actuar una glucosidasa dos y retira la última glucosa que quedaba. En estas condiciones esta proteína en principio está correctamente plegada y podría salir. Normalmente en un primer ciclo esto no se consigue, entonces si la proteína no está correctamente plegada va a actuar una glucosiltransferasa que vuele a unirle una glucosa. Si no es capaz de plegarse correctamente se retrotransloca se ubiquitiniza y se degrada en el proteasón (ERAD).
Podemos encontrar dos tipos de transportes:
Una vez que tenemos las vesículas estructuradas salen de RE para dirigirse al complejo de Golgi. Esta salida es la que por fusión homotípca va a originar el compartimento ERGIC, esta fase se lo que no está lar como se producía en cuanto al movimiento. Las vesículas COPII cuando salen con las pt, pierden el revestimiento y se funden unas con otras dando lugar al ERGIC.
Se ha visto que hay receptores KDEL tanto en RE como en el Golgi con distinta afinidad. Si nosotros nos vamos desde el RE hasta la red trans del complejo de Golgi, vemos que el pH se va acidificando. Lo que ocurre es que en el RE done se sintetizan proteínas hay un pH neutro, lo que hace que las proteína tiendan a unirse unas a otras. Al agregarse lo que estamos es impidiendo que se unan a un receptor para salir. Algunas salen y se dirigen al ERGIC y complejo de Golgi. Se ha visto en el complejo de Golgi hay receptores KDEL, pero al ser pH acido, permiten que las proteínas encuentren su receptor y de esta forman vuelvan al retículo.
tener es una señal en la proteína que corresponde a la manosa 6-fosfato. Los enzimas lisosomales marcan en el cis Golgi a las manosas con fosfato y esa es la marca de la vesícula lisosomal. As vesículas que van a actuar son vesículas de clatrina que llevan como transportadores AP1 y GGA. El receptor M6P se une a las proteínas solubles en la red trans Golgi y las transporta a los endosomas primarios en vesículas revestidas de clatrinas. En esta red también va a haber una mecanismo de reciclaje.
Cuando son proteínas de mb tenemos dos vías alternativas: ■ Vesículas revestidas exclusamente por AP-3.
■ Vesículas revestidas por clatrina y AP.
No tienen señal, van a actuar en una vía por defecto (constitutiva). Estas proteínas tienen que mantener la topología durante todo el transporte vesicular. La posición que timen en la mb del retículo las proteínas destinadas a la mp, va a ser la misma posición que van a tener en la misma.
Este tipo de secreción constitutiva de vesículas que se van a dirigir hacia la MP, lo van a hacer desde la cisternas más próxima a la red trans, ya que no están recubierta de clatrina. Se ha visto que hay pequeñas diferencias en el revestimiento de los túbulos que llevan las proteínas hasta la mb. En células que no están polarizadas vemos como revestimiento proteínas adaptadoras de las que funcionabas con la clatrina, concretamente AP3 y AP4. A parte de estas esta la FAPP2 que se encarga de la elongación de esos túbulos. El resto de los componentes son la composición de la propia mb de la red trans Golgi, que proceden de regiones raft.
Este tipo de carriers lleva implícito el hecho de que se tienen que romper para llegar a la mb. Estos túbulos se rompían por dinamina y en otros casos por proteinkinasas.
Es el tipo de secreción mediante el cual algunas células especializadas van a liberar al medio productos como respuesta a un estímulo externo. En este caso la célula secretora va a sintetizar esta proteína y lo va a tener acumulada como gránulos de secreción. Solo ante un determinado estimula la célula va a liberar hacia el exterior su contenido. En este caso las proteínas que forman los gránulos de secreción si llevan señal que varía dependiendo de la proteína que se va a trasportar. El tipo de transporte que se produce es más complejo debido a que el gránulo que se forma va a pasar por procesos intermedios.
En un proceso de fagocitosis, la partícula que se incorpora a la célula va directamente al lisosoma para ser degradada. Este paso es el proceso que llevan a cabo las células que tienen capacidad de fagocitar (macrófagos, neutrófilos). En este caso la vesícula que se va a formar se va a fundir con el lisosoma para ser degradado. En los otros tipos de endocitosis siempre van a pasar por todo lo que es el compartimento endosomal, debido a que en todo este proceso hay reciclaje de componentes donde se trasportan proteínas y se van reciclando otras. En este sentido tenemos los procesos de macropinocitosis y de la misma manera veríamos distintos tipos de endocitosis que se dan por vías independientes a la clatrina y la caveolina. Otro tipo de endocitosis es dependiente de caveolinas, en este caso se va a formar una vesícula que va al
En los siguientes casos de endocitosis va desde el exterior hacia el compartimento endosoma. Dependiendo del tipo de carga que se va a incorporar en la célula, la célula va a utilizar un mecanismo u otro de endocitosis. Dependiendo del tipo de endocitosis va a haber o no estructuras intermedias, al igual que vamos a tener una serie de proteínas accesorias que están ayudando van al reclutamiento de los productos de endocitosis como el posterior traslado.
a través de una vesícula que no está revestida para introducir a los receptores. Esas vesículas como carga llevan los receptores de IL2 pero también se incorporan inmunoglobulinas a través de este mecanismo. La forma en la que la vesícula que va al compartimento endosomal a través de la membrana va a ser mediante dinamina. Van a tomar una vía de reciclaje, y se degradarán cuando los receptores dejen de actuar.
Todas las moléculas relacionadas con vías endociticas no mediadas por clatrina se dan en los raft lipídicos. En los raft e dan rutas de señalización y endocitosis.