Docsity
Docsity

Prepara tus exámenes
Prepara tus exámenes

Prepara tus exámenes y mejora tus resultados gracias a la gran cantidad de recursos disponibles en Docsity


Consigue puntos base para descargar
Consigue puntos base para descargar

Gana puntos ayudando a otros estudiantes o consíguelos activando un Plan Premium


Orientación Universidad
Orientación Universidad


transcripció, Apuntes de Bioquímica

Asignatura: Bioquímica, Profesor: biosca biosca, Carrera: Biología, Universidad: UPV-EHU

Tipo: Apuntes

2013/2014

Subido el 20/01/2014

havanna0101
havanna0101 🇪🇸

1

(1)

1 documento

1 / 42

Toggle sidebar

Esta página no es visible en la vista previa

¡No te pierdas las partes importantes!

bg1
Tema 9. Transcripció
Transcripció
Mecanisme de la transcripció
RNA polimerasa d’E.coli
RNA polimerases eucariotes
Processament del RNA
Processament del transcrit primari
RNAs catalítics
Mecanismes de tall i relligat (“splicing”)
Retrotranscripció
Retrovirus i transcriptasa inversa
Telomerasa
pf3
pf4
pf5
pf8
pf9
pfa
pfd
pfe
pff
pf12
pf13
pf14
pf15
pf16
pf17
pf18
pf19
pf1a
pf1b
pf1c
pf1d
pf1e
pf1f
pf20
pf21
pf22
pf23
pf24
pf25
pf26
pf27
pf28
pf29
pf2a

Vista previa parcial del texto

¡Descarga transcripció y más Apuntes en PDF de Bioquímica solo en Docsity!

Tema 9. Transcripció

 Transcripció

 Mecanisme de la transcripció

 RNA polimerasa d’ E.coli

 RNA polimerases eucariotes

 Processament del RNA

 Processament del transcrit primari

 RNAs catalítics

 Mecanismes de tall i relligat (“splicing”)

 Retrotranscripció

 Retrovirus i transcriptasa inversa

 Telomerasa

La transcripció és el procés enzimàtic pel que la informació genètica emmagatzemada en una doble cadena de DNA es transfereix a una cadena de RNA senzilla.

  • El RNA pot desenvolupar alhora funcions informatives i catalítiques
  • Trobem 3 tipus principals de RNA cel · lular segons la seva funció:
    • RNA ribosomal: component majoritari dels ribosomes, té un paper estructural i catalític en la síntesi de proteïnes. En els ribosomes d ’E. coli hi ha 3 classes de rRNA: 23S, 16S i 5S
    • RNA de transferència: transporta els aminoàcids en la seva forma activada al ribosoma per tal de formar els enllaços peptídics en una seqüència dictada pel mRNA.
    • RNA missatger: és el motlle per la síntesi de proteïnes. És molt heterogeni en tamany.

Tipus d’àcid ribonucleic (RNA )

La cadena de RNA és sintetitzada emprant com a motlle una cadena de DNA (en el cas de la figura, la cadena de DNA motlle és la inferior). La cadena de RNA sintetitzada té la mateixa seqüència que la cadena de DNA codificant (canviant les T de la cadena de DNA per U en la cadena de RNA), que en la figura de dalt és la superior. En la figura de dalt l’enzim que ha sintetitzat el RNA (RNA polimerasa) ha emprat com a motlle la cadena de baix, encara que en altres gens podria haver emprat com a motlle la cadena de dalt: Aquesta figura representa el genoma d’un adenovirus i es veu que la cadena de dalt del DNA és la codificant per 7 transcrits de RNA, mentre que la cadena de DNA de baix codifica per 3 transcrits de RNA. Cadena codificant Cadena motlle

RNA polimerasa d’ E. coli

  • La síntesi de RNA es dóna en direcció 5’  3’
  • Requereix un motlle de DNA
  • No necessita un encebador ( primer )
  • La transcripció és selectiva, iniciant-se als promotors
  • Es poden transcriure gens de qualsevol de les dues cadenes de DNA
  • Tindrem tants punts d’inici com gens a transcriure
  • Incorporació d’errors aprox. ~1 base cada 10^5 : la baixa fidelitat en la síntesi de RNA es pot tolerar perquè els errors no es transmeten a la progènie i perquè donat que es fan molts transcrits de cada gen, serà improbable que alguns defectuosos siguin molt perjudicials.
  • Les topoisomerases eliminaran la tensió topològica deguda al superenrotllament

Etapa d’inici de la transcripció

L’inici de la síntesi de RNA no té lloc a qualsevol punt a l’atzar de la seqüència de DNA, sino que la RNA polimerasa s’uneix a seqüències específiques nomenades promotors, que dirigeixen la transcripció de segments de DNA adjacents (gens). La subunitat σ dirigeix a la RNA polimerasa al lloc d’unió al DNA on començarà la síntesi de RNA. E. coli te varis tipus de subunitats σ:

Aquesta figura mostra les seqüències de diferents promotors (de la cadena codificant) reconeguts per la σ^70. Per convenció el primer nucleòAd de la cadena de DNA codificant corresponent al primer nucleòAd de la cadena de RNA s’anomena +1 i l’anterior -­‐1 (no hi ha 0). Comparant les seqüències d’aquests promotors, es veu que son diferents, però hi ha dues regions semblants centrades en les posicions -­‐35 i -­‐10, a parAr de les que s’elabora la seqüència consens per la σ^70

Quan la RNA polimerasa s’uneix al promotor sofreix un canvi de conformació que desenrotlla parcialment la doble hèlix de DNA (“complex obert”) i incorpora el primer nucleòtid del RNA. Després va sintetitzant la cadena de RNA movent-se al llarg de la doble cadena de DNA que va desenrotllant, emprant el DNA motlle per a fer la cadena de RNA complementari ( fase d’elongació). Per tant no requereix encebador.

  • Síntesi per addició de nucleòtids en l’extrem 3’
  • El grup 3’OH actua de nucleòfil atacant el fosfat en posició α del nucleòtid trifosfat (NTP) entrant
  • S’incorpora a la cadena en síntesi un nucleòtid monofosfat (NMP) i s’allibera pirofosfat (PPi)
  • El primer nucleòtid incorporat en l’extrem 5’ manté el grup trifosfat (NMP)n + NTP ----------> (NMP)n+1 + PPi

Alguns gens són transcrits emprant una de les cadenes de

DNA com motlle, mentre que d’altres empren l’altra cadena.

La direcció està determinada pels promotors al principi de

cada gen.

Etapa d’elongació de la transcripció

La velocitat d’elongació és d’uns 50

nucleòtids/segon

Alguns antibiòtics inhibeixen la transcripció: rifampicina i actinomicina D Actinomicina D

La rifampicina inhibeix l’inici de la transcripció i no inhibeix les RNA polimerases eucariotes. S’empra contra la tuberculosis. La actinomicina D té seqüències peptídiques i s’uneix al DNA per “intercalació”: l’anell de fenoxazona s’intercala entre els parells de bases del DNA, inhibint la transcripció i la replicació del DNA: s’empra també com anticancerígen.