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Tipo de ARN Función ARN ribosómico (~75% del total) Componente catalíticos para formar las nuevas proteínas ARN pequeños y estables (~15% del total) ARNt: transferir el patrón copiado por el ARNm al ARN ribosómico ARNsn: Maduración del ARNm ARNr 5S: componente estructural y funcional de la subunidad mayor del ribosoma ARNm y su precursor, el ARN nuclear heterogéneo (ARNhn) (~10% del total) Contiene la información genética necesaria para elaborar las proteínas ncRNA (~1%) Poco abundantes, participan en procesos de regulación. ARNi: suprime la expresión de genes específicos ARNnc largo: regulan la expresión génica (Xist) ARNmi: 19- 24 nts. Regulan transcripción y/o traducción, asociados a Drosha y Dicer Las células eucariotas tienen cuatro tipos diferentes de ARN:
ETS: espaciador transcribible externo ITS: espaciador transcribible interno
- El ARN de transferencia se sintetiza en el núcleo y en el citoplasma se carga con aminoácidos para participar en la síntesis de proteínas
- Los snRNA se sintetizan y procesan en el núcleo. Desde allí, migran al citoplasma, donde adquieren proteínas esenciales, y luego regresan al núcleo para catalizar reacciones de empalme de ARN ETS: espaciador transcribible externo ITS: espaciador transcribible interno Aminoacil- ARNt-sintetasa
Características de las ARN polimerasas
- Sintetizan una cadena de ARN en dirección 5’ a 3' complementaria a una de las cadenas de
ADN cromosómico.
- Diferencias importantes con la replicación:
1. Las ARN polimerasas sintetizan una hebra de ribonucleótidos.
2. Pueden iniciar la transcripción sin un cebador.
3. Las secuencias recién transcritas no permanecen emparejadas con la plantilla.
- En bacterias existe una única ARN polimerasa compuesta por seis polipéptidos
(holoenzima):
1. Enzima central: Dos copias de la subunidad α, y una de subunidades β, β ′ y ω (omega)
2. Subunidad σ.
Una vez la iniciación, σ se disocia de la enzima central. En bacterias el factor σ reconoce dos secuencias conservadas en el promotor:
- Promotor corriente arriba de la secuencia larga en tándem de pre-ARNr superpuesto al inicio de la transcripción
- Elemento control a - 100 pb estimula la transcripción. No todos los promotores de la polII contienen todos estos elementos. Gen de ARNt contiene caja A y la caja B (11 pb) a 15 pb de los extremos 5 'y 3' de la secuencia codificante Gen 5S-rRNA contiene un solo elemento interno, la caja C, ubicada en el centro de la región codificante. (TRGYNNARNNG) (RGTTCRANTCC) R: A ó G (Purinas), Y: C ó T (Pirimidinas), Py: Pirimidina
- La fosforilación del CTD libera a la polimerasa de las interacciones con los GTF permitiéndole salir del promotor y entrar en la fase de elongación de la transcripción TAF: Factores asociados a TBP TBP: Proteínas de union a TATA Act. helicasa
La velocidad de la ARN polimerasa no es constante. Las pausas se deben a:
- Concentraciones bajas de NTP
- Secuencias autocomplementarias cortas (~ 20 pb) en el ARN naciente
- Después de la transcripción de secuencias ricas en U, asociada en procariotas con la terminación de la transcripción
Terminación
PROCARIOTAS
- Los terminadores intrínsecos constan de una horquilla estable rica en GC y una serie de residuos U consecutivos. La polimerasa se detiene y se libera el ARN
- Terminación dependiente de rho (helicasa): Rho se une a secuencias ricas en C en el ARN y por hidrólisis de ATP se mueve a lo largo del ARN hasta llegar a la ARN polimerasa y liberarla Helicasa Rut (^) (Rho utilisation site)
EUCARIOTAS
- ARN Pol I termina por un factor proteico (Nsi1) de unión a una secuencia de ADN corriente abajo del sitio de terminación que bloquea el alargamiento adicional, dejando un híbrido ARN-ADN rico en U.
- Finalmente, escisión 5'-3’ por Rat1 también está implicada en la terminación.
- ARN Pol III La secuencia de terminación es suficiente para dirigir la terminación.
- ARN Pol III no requiere factores proteicos, termina después de transcribir residuos U consecutivos Factores de escisión
Regulación en Procariotas
- Los procariotas normalmente regulan la expresión génica en respuesta a señales ambientales como la presencia de nutrientes
- Estas señales se transmiten a los genes apropiados mediante proteínas reguladoras que se unen a secuencias específicas cercanas a los genes que controlan para activar o reprimir la transcripción. Producido con baja glucosa intracelular Estabiliza la interacción ARNpol-promotor CAP: Proteína activadora del catabolito
- El acercamiento entre los genes y los amplificadores que los regulan (presentes a miles de bases de su promotor) se logra por interacción directa cuando la cromatina forma un bucle que pone al amplificador y al promotor en contacto.
- Tales interacciones entre amplificadores y promotores involucran el complejo de cohesina, el cual forma un anillo alrededor de dos cadenas de ADN que estabilizan el bucle.
Correguladores eucariotas actúan como un puente entre factores específicos de genes, la plantilla de cromatina y la ARN polimerasa con sus GTF asociados
