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Genoma humano, Apuntes de Genética

Asignatura: Genética, Profesor: , Carrera: Medicina, Universidad: UEM

Tipo: Apuntes

2014/2015

Subido el 27/02/2015

aleana-4
aleana-4 🇪🇸

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Tema 1: Genoma humano
El genoma es el contenido genético total de un individuo.
El genoma humano se divide en dos tipos de genoma: el nuclear y el mitocondrial
a. Mitocondrial: Se encuentra en poca cantidad no obstante el 93% es codificante .Se
encuentra en forma de 1 molécula de adn circular. Forma 37 genes.
b. Genoma nuclear: Se encuentra en bastante cantidad. Forma 46 moléculas. El 95% no
codifica para nada. Hay dos tipos de secuencias : repetitivas y únicas
Genoma nuclear
Son secuencias repetitivas
a. Adn altanamente repetitivo
Es el más repetido
Se emeplea la Ultracentrifugaciónen gradiente de densidadde Cloruro de cesio para
saber la densidad de adn ya que cuanto más absorbancia haya de luz significa que
más adn hay. Hacendo esta prueba se observó dos tipos de adn: satélite y principal
-Adn satélite
Tiene distinta densidad del adn principal. No existe en procariotas. En humanos es
más denso porque tiene mayores pares G-C ya que son más enlaces. Están en forma
de tándem es decir que están pegadas unas a otras. Están en forma de cromatina que
es más densa y está asociado a centrómeros
El adn centromerico en humanos forma la secuencia alfoides. Forman 171 pares de
bases repetitivas que se repiten hasta completar regiones. No se transcriben. Quizás
no tengan función o si la tienen este asociada a centrómeros.
Adn telomerico:
Hay dos tipos de secuencias: adn telomerico y adn asociado a telomeros.
Adn telomerico : Es muy repetitivo, la secuencia que se repite es 5´TTAGGG3 que
es lo que codifica para que la telomerasa pueda alagar el telomero en células
germinales. Esta muy conservativo y su función es que da estabilidad del
cromosoma en la parte Centroamérica
adn asociado a telomeros : Es altamente repetitivo , también se encuentra en zonas
adyacentes , no están conservado evolutivamente. Su función puede que no la tenga
y si la tiene puede que sea poco importante.
b. ADN MODERADAMENTE REPETITIVO EN TÁNDEM
Secuencias que se encuentran unas pegadas unas a otras . Forman agrupaciones y se
diseminan por el genoma. Hay dos tipos: microsatelites y minisatleites.
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Tema 1: Genoma humano El genoma es el contenido genético total de un individuo. El genoma humano se divide en dos tipos de genoma: el nuclear y el mitocondrial a. Mitocondrial: Se encuentra en poca cantidad no obstante el 93% es codificante .Se encuentra en forma de 1 molécula de adn circular. Forma 37 genes. b. Genoma nuclear: Se encuentra en bastante cantidad. Forma 46 moléculas. El 95% no codifica para nada. Hay dos tipos de secuencias : repetitivas y únicas

Genoma nuclear Son secuencias repetitivas a. Adn altanamente repetitivo Es el más repetido Se emeplea la Ultracentrifugaciónen gradiente de densidadde Cloruro de cesio para saber la densidad de adn ya que cuanto más absorbancia haya de luz significa que más adn hay. Hacendo esta prueba se observó dos tipos de adn: satélite y principal

  • Adn satélite Tiene distinta densidad del adn principal. No existe en procariotas. En humanos es más denso porque tiene mayores pares G-C ya que son más enlaces. Están en forma de tándem es decir que están pegadas unas a otras. Están en forma de cromatina que es más densa y está asociado a centrómeros

El adn centromerico en humanos forma la secuencia alfoides. Forman 171 pares de bases repetitivas que se repiten hasta completar regiones. No se transcriben. Quizás no tengan función o si la tienen este asociada a centrómeros.

Adn telomerico: Hay dos tipos de secuencias: adn telomerico y adn asociado a telomeros. Adn telomerico : Es muy repetitivo, la secuencia que se repite es 5´TTAGGG3 que es lo que codifica para que la telomerasa pueda alagar el telomero en células germinales. Esta muy conservativo y su función es que da estabilidad del cromosoma en la parte Centroamérica

adn asociado a telomeros : Es altamente repetitivo , también se encuentra en zonas adyacentes , no están conservado evolutivamente. Su función puede que no la tenga y si la tiene puede que sea poco importante.

b. (^) ADN MODERADAMENTE REPETITIVO EN TÁNDEM Secuencias que se encuentran unas pegadas unas a otras. Forman agrupaciones y se diseminan por el genoma. Hay dos tipos: microsatelites y minisatleites.

-microsatelites: secuencias de 2 a 5 pb

  • minisatelites: secuencias de 6 a 100 pb

Este tipo de adn se conoce como huella molecular. Se emplea en pruebas de maternidad y paternidad. El número de copias varía según el individuo ya que es difícil que se repitan de la misma forma en los individuos. Se considera poliformismo genético si una variante se encuentra superior al 1% en toda la población c. ADN MODERADAMENTE REPETIDO DISPERSO Se transponen y mueven por el genoma. Se cree que lo hemos adquirido de parásitos. Hay dos tipos: Retrotrasposones y transposones

  • Retroransposones Se encuentran en un 42%. Se mueven a través de un intermediario que es el arn ADN – ARN – cADN El Cadn no es la misma copia ya que es una copia de arn procesado. Al final tienes más adn Hay dos tipos de secuencias: TRANSPOSONES LTR Tiene repeticiones largas, se transponen poco y son parecidos a retrovirus TRANSPOSONES NO-LTR Son los más numerosos. Se mueven a. Secuencia line ( 20%): Posee el gen de la transcriptasa. Familia L1 (15%) 6 kb (>800,000 elementos/genoma) ‐ Menos de 100 copias están activas en el genoma humano b. Sines(13%) : Necesita de las secuencias de Line ya que no tiene gen de la transcriptasa. Familia Alu (10%) 300 pb (1.5x106 copias/genoma) ‐ Derivadas de secuencia 7S de la PRS c. SVA(1%) Contienen la secuencia HERV denominada “Retrovirus endógeno humano” Son los más activos y son los que están relacionados con los canceres. Está formado por : sine , vntr y secuencia parecida a alu.
  • Transposones Emplea un mecanismo de cortar y pegar. Su mecanismo requiere una Transposasa, codificada por el transposón. Presentan secuencias invertidas terminales de 9-40 pb. La mayoría son fósiles inactivos en humanos al tener

Normal: 1 gen /100kb HLA: 1 gen/15kb

Genes dentro de genes :en el intrón 26 del genNF1(gen de la neurofibromatosis tipo I): -OGMP: Glucoproteína de mielina del oligodendrocito -EVI2AyEVI2B :se creen relacionados con el origen de la leucemia

PROYECTO GENOMA HUMANO Y GENÓMICA Estudio de la estructura y función del genoma. Se inició en Estados Unidos en

  1. Comenzaron buscando marcadores de ADN que son zonas de ADN que nos indican una posición genómica conocida. Estos marcadores fueron : microsatélites,minisatélites,SNPs.

En1998 ,revisión de nuevos objetivos: 1ºborradorsecuenciacióncompleta→ 2003 Continuar el desarrollo de tecnologías desecuenciación Estudio de variación y polimorfismos del genoma humano Desarrollo de tecnología de genómica funcional: CraigVenter estudiodeEST (expressedsequencetags)→secuenciación de secuencias decADN debibliotecas de tejidos Genómica comparada :genomas de distintas especies implicaciones éticas ,legales y sociales Desarrollo de herramientas bioinformáticas

El primer borrador en2003:

  • <2%escodificante
  • 20.000y25.000genes
  • ≈50% es ADN repetitivo
  • 1gen/100kb,
  • (^) Tamaño medio de un gen humano :2030kb
  • ≈7-8exones/gen
  • 1exóntiene≈150pb
  • intrones: gran variación de tamaño
  • G+C=41%
  • Genes en zonas ricas en G+C

GRAN VARIACIÓN GENÉTICA INTERINDIVIDUAL

-Diferente susceptibilidad a enfermedades -Diferente susceptibilidad ante respuesta a fármacos

  • Diferencias dentro y entre grupos étnicos. -proyecto HapMap: estudio SNPs más frecuentes en diferentes grupos étnicos

Los chips de adn son capaces de detectar mutaciones ya que son pequeños trozos de adn

-Organización El ADN mitocondrial es más pequeño que el ADN nuclear. El ADN mitocondrial contiene 37 genes que condifican para. 13 ARN mensajero (proteínas), 22 ARN de transferencia y 2 ARN ribosómico. Encontramos dos hebras

  • (^) Hebra h: Es más pesada ya que tiene una alta concentración en guanina, codifica para : 2 ARNr, 14 ARNt, 12 proteínas
  • Hebra L: Es la hebra ligera porque tiene una mayor concentración en citosoina, codifica para : 8 ARNt, y 1 proteína