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Tarea sobre el Paseo Genómico (PDF)
Esta tarea podrá realizarse por parejas. Se aconseja que al menos uno de los
componentes de la pareja tenga suficiente conocimiento de inglés. La tarea se
entregará el primer día de Prácticas de Genómica.
Nombre y Apellidos: Grupo:
Nombre y Apellidos:
Realizar el paseo guiado por el genoma humano y el de ratón siguiendo los
pasos que se indican en el PDFadjunto: Paseo Genómico (preparado por el European
Molecular Biology Laboratory).
Este documento fue revisado en 2009, pero debido a las constantes
actualizaciones de Ensembl el aspecto de algunas de las imágenes, y los datos que
presentan, pueden diferir entre lo que usted encontrará y lo que aparece en el PDF. En
caso de “perdida” puede volver al paseo pinchando directamente en el PDF las
direcciones que aparecen en azul.
1. A partir de los datos estadísticos que aparecen para cada cromosoma, estimar la
densidad génica (genes/megabase) de los siguientes cromosomas humanos: 1,10, 13, 19,
21,22, X, Y. Discutir los resultados. (Los genes aparecen indicados como “protein
coding gene”).
- Cromosoma 1: 1,644*10-5
- Cromosoma 10: 1,235*10-5
- Cromosoma 13: 7,640*10-5
- Cromosoma 19: 4,148*10-5
- Cromosoma 21: 1,186*10-5
- Cromosoma 22: 1,748*10-5
- Cromosoma X: 1,012*10-5
- Cromosoma Y: 3,587*10-5
2. ¿Cuántos tránscritos (mRNAs) distintos tiene el gen GIPC2, y cuál es el tamaño de
los mismos?
Tiene 12 transcritos :
- Gato: 4790 pbs
- Pollo: 1186 pbs
- Chimpancé: 1255 pbs
- Vaca: 1545 pbs
- Perro: 4735 pbs
- Humanos: 3847 pbs
- Marmota: 2802 pbs
- Ratón: 1596 pbs
- Orangután: 2646 pbs
- Conejo: 708 pbs
- Rata: 963 pbs
- Pez cebra: 1803 pbs
