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Replicación del DNA, Apuntes de Biología Celular

Asignatura: Biología Celular e Histología, Profesor: Ricardo Paniagua, Carrera: Biología Sanitaria, Universidad: UAH

Tipo: Apuntes

2015/2016

Subido el 06/10/2016

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Replicación del DNA
En la replicación, ambas cadenas se separan y forman una horquilla de
replicación. Actúan la DNA helicasa (abre la hélice) y proteínas desestabilizadoras de
la hélice o de unión a DNA de una cadena (mantiene recta y abierta la hélice). Cada
cadena es recorrida por la enzima DNA polimerasa, que la va copiando e
incorporando las bases específicas.
La copia la inicia un RNA cebador o primer, que es una pequeña cadena de
unas 10 bases, sintetizadas por la RNA primasa, que se une a la DNA helicasa
formando el primosoma.
El DNA sintetiza en sentido 5´ 3´. Esto hace que la replicación de una
cadena sea continua, pero hay otra en sentido 3´5´que se copia a trozos que se
suceden a medida que se van separando las cadenas madres y, estos trozos
terminan unidos por la DNA ligasa.
Estos trozos se denominan fragmento de Okasaki, y tienen unos 1000-2000
nucleótidos. Conforme se va haciendo la copia, los RNA primer se van cayendo.
Las topoisomerasas son proteínas que evitan que el DNA se enrede al girar
durante la replicación.
Si se empezara abrir una horquilla de replicación sólo por una punta, el DNA
tardaría mucho en replicase, por lo que tienen muchos puntos en los que se replica
a la vez. Así, suelen tener varias burbujas de replicación. Puede haber unas 20.000
burbujas en un cromosoma, pero no suelen darse todos a la vez, sino que lo hacen
en grupos denominados “unidad de replicación, que se distancian unos de otros en
10-100µm.
El origen de replicación es el punto de inicio de replicación.
Algunas burbujas funcionan a la vez en dos direcciones, lo que hace que la
replicación sea el doble de rápido.
Las histonas se unen muy rápido conforme se va replicando el DNA. Las
histonas se sintetizan en el citoplasma, no en el núcleo, y lo hacen antes de la
replicación. El proceso ocurre de la siguiente manera:
El octámero de histonas se dividen en un tetrámero H3-H4 y dos dímeros
H2A-H2B.
Los tetrámeros H3-H4 se reparten por igual en ambas cadenas, mientras
que los H2A y H2B se liberan del DNA.
Los nuevos tetrámeros H3-H4 se sitúan en los huecos de los dobles
helicoides, mientras que los H2A-H2B, junto con los antiguos liberados se
reparten al azar entre ambas cadenas.
Hay unas proteínas llamadas chaperonas que intervienen en este proceso
ayudando a las histonas.
La cadena terminada en 5´ se copia de foram continua desde el último origen
de replicación avanzando la copia en dirección 5´3´ hacia el extremo. La terminada
en 3´puede copiarse:
Desde el origen de replicación situado justo en ese extremo; pero los
nucleótidos ocupados por el RNA cebador no pueden ser reemplazados
por DNA.
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Replicación del DNA

En la replicación, ambas cadenas se separan y forman una horquilla de replicación. Actúan la DNA helicasa (abre la hélice) y proteínas desestabilizadoras de la hélice o de unión a DNA de una cadena (mantiene recta y abierta la hélice). Cada cadena es recorrida por la enzima DNA polimerasa, que la va copiando e incorporando las bases específicas. La copia la inicia un RNA cebador o primer, que es una pequeña cadena de unas 10 bases, sintetizadas por la RNA primasa, que se une a la DNA helicasa formando el primosoma.

El DNA sintetiza en sentido 5´ 3´. Esto hace que la replicación de una cadena sea continua, pero hay otra en sentido 3´5´que se copia a trozos que se suceden a medida que se van separando las cadenas madres y, estos trozos terminan unidos por la DNA ligasa.

Estos trozos se denominan fragmento de Okasaki, y tienen unos 1000- nucleótidos. Conforme se va haciendo la copia, los RNA primer se van cayendo.

Las topoisomerasas son proteínas que evitan que el DNA se enrede al girar durante la replicación.

Si se empezara abrir una horquilla de replicación sólo por una punta, el DNA tardaría mucho en replicase, por lo que tienen muchos puntos en los que se replica a la vez. Así, suelen tener varias burbujas de replicación. Puede haber unas 20. burbujas en un cromosoma, pero no suelen darse todos a la vez, sino que lo hacen en grupos denominados “unidad de replicación, que se distancian unos de otros en 10-100μm.

El origen de replicación es el punto de inicio de replicación. Algunas burbujas funcionan a la vez en dos direcciones, lo que hace que la replicación sea el doble de rápido. Las histonas se unen muy rápido conforme se va replicando el DNA. Las histonas se sintetizan en el citoplasma, no en el núcleo, y lo hacen antes de la replicación. El proceso ocurre de la siguiente manera:

  • El octámero de histonas se dividen en un tetrámero H3-H4 y dos dímeros H2A-H2B.
  • Los tetrámeros H3-H4 se reparten por igual en ambas cadenas, mientras que los H2A y H2B se liberan del DNA.
  • Los nuevos tetrámeros H3-H4 se sitúan en los huecos de los dobles helicoides, mientras que los H2A-H2B, junto con los antiguos liberados se reparten al azar entre ambas cadenas. Hay unas proteínas llamadas chaperonas que intervienen en este proceso ayudando a las histonas.

La cadena terminada en 5´ se copia de foram continua desde el último origen de replicación avanzando la copia en dirección 5´3´ hacia el extremo. La terminada en 3´puede copiarse:

  • Desde el origen de replicación situado justo en ese extremo; pero los nucleótidos ocupados por el RNA cebador no pueden ser reemplazados por DNA.
  • Con un origen de replicación algo alejado de ese y fragmentos de Okazaki; pero puede que no haya espacio para producir el RNA cebador que inicie el ultimo fragmento.

Por eso, la cadena retardada tiene unos 50-100 nucleótidos nuevos que la original.

Esto implica que en cada generación los cromosomas se van acortando en cada generación. Para evitarlo, en los extremos 3´de cada cadena hay una corta secuencia repetitiva especial de DNA, adyacente a la última secuencia de DNA replicable por la DNA polimerasa. Es el DNA telomérico, rico en bloques G y muy similar en todas las especies. En humanos es GGGTTA.

Aunque la secuencia telomerica apareciese muchas veces, desparecería en varias generaciones. Para evitarlo, la enzima telomerasa amplifica repetitivamente esta secuencia alargándola desde el extremo 3´en sentido 3´5´ hasta unos 10. pares de nucleótidos, usando un molde propio de RNA.

De este modo, en los extremos de los cromosomas, la cadena original terminada en 3´ es más larga que la otra y se repliega. El fragmento añadido es lo suficientemente largo como para servir de molde para la elongación de la copia mediante un nuevo fragmento de Okazaki.

Las células que no suelen dividirse no tienen DNA telomerasa, pues no la necesitan. En cambio, las células madre sí las tienen, ya que sufren muchas divisiones.

Las células procariotas tampoco necesitan telomerasa.

Corrección de errores en la replicación

En la replicación se produce un error cada 10pb. Una base alterada incorporada no es reconocida por la cadena complementaria y la destruye una exonucleasa. Tras esto se puede continuar la elongación de la cadena. En bacterias se reconocen porque todas las bases adenina se metilan. En cambio, en vertebrados las adeninas no se metilan.

Reparaciones del DNA

Hay miles de cambios aleatorios en el DNA producidos por energía térmica. Predominan:

▲ Desaminación. (Eg, que una citosina se trasforme en uracilo) ▲ Despurinización (Eg, la guanina se desprende)

La mayoría de estas lesiones se solucionan con la reparación del DNA, pues predisponen a la célula a padecer cáncer y enfermedades.

La reparación se basa en la disposición del DNA formando un doble helicoide. En los virus, las mutaciones no se reparan porque no tienen una cadena en la que reflejarse. Si se altera una base de una sola cadena: