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Asignatura: biolgia celular, Profesor: , Carrera: Biología, Universidad: UCM
Tipo: Resúmenes
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Resumen I parte Conferencias
El PGH aporto los datos, la genómica funcional buscaba establecer las interacciones entre los genes y las proteínas
Las ómicas analizan datos y generan avances Biología y biotecnología han avanzado de la mano -------¿Qué es transcriptómica?
-------¿Qué es proteómica? -------¿Qué es metabolómica?
A partir del genoma se ha investigado en muchas disciplinas La genómica tiene como objetivo predecir la función de los genes a partir de su secuencia
La genómica tiene implicaciones socioeconómicas y ambientales Las técnicas de alto rendimiento me permiten obtener datos en masa, la bioinformática me los almacena y establece patrones
La expresión génica en una célula es el proceso por medio del cual todos los organismos procariotas y eucariotas transforman la información codificada en
los ácidos nucleicos en las proteínas necesarias para su desarrollo y funcionamiento.
Hay genes esenciales expresados en todas las células y hay otros que lo hacen dependiendo de la función de la célula
Transcriptoma surge para representar todo este ARN transcrito en una serie de circunstancias fisiológicas pero de forma global.
Hay muchas clases de transcriptomas La transcriptómica cuenta con micromatices que, por medio de sondas, me permite saber la cantidad de ARN que hay en el momento
Las sondas se diseñan a partir de una secuencia conocida o un arn mensajero predicho
Los chips de adn para genotipado sirven para halar la secuencia genómica y determinar snps causantes de variaciones y enfermedades
cDNA: Adn complementario obtenido de un arn mensajero El arreglo de oligonucleótidos en la matriz colocado dentro de un chip de genes. II. Las muestras de RNA son retrotranscritas a cDNA. III. Los cDNA se hibridizan con la micromatriz. IV. Se Excitan los fluoróforos. V. Se obtiene una
imagen no procesada de las intensidades de fluorescencia producto de hibridización. VI. Se analizan los datos.
Los chips de adn ayudan a estudiar la expresión de diversos genes transcritos en una determinada condición fisiológica (perfil de expresión)
Un chip de adn es una matriz de fragmentos de ADN
Con los chips de adn podemos determinar poblaciones de arn que se pueden traducir o no a proteínas, enfermedades producidas, etc
Para cada condición se debe usar un chip En ensayos de dos canales con micromatrices de adn se utilizan ADNc obtenido de dos muestras biológicas diferentes, macadas con fluoróforos
diferentes
Los chips funcionan gracias a la propiedad de hibridación de dos cadenas complementarias
El proteoma se define como la totalidad de las proteínas específicas complementarias al genoma tanto temporalmente como por el tipo de célula. Esto incluye todas las proteínas que se expresan en una célula en un
determinado momento, ya sean las isoformas como las proteínas modificadas.
De las lecturas cuantitativas sobre la intensidad de la fluorescencia, se obtiene una medición relativa de la abundancia de los mensajeros expresados.
El proteoma es complejo, numeroso y variable Se puede modificar dependiendo de las condiciones Los principales mecanismos generadores de dicha variabilidad son tres: ---1. El ayuste alternativo (―alternative splicing‖) del ARN
---2. Las modificaciones postraduccionales que sufren las proteínas ---3. Los SNPs ("single nucleotide polymorphisms").
La variabilidad del proteoma depende de varias condiciones, tiene varias causas y consecuencias serias
La proteómica se ha ceñido a sistemas muy específicos. En los demás casos la bioinformática ha permitido acercamientos importantes.
Las principales áreas de estudio de la proteómica son:
postraduccionales
En la electroforesis el detergente dodecilsulfato sódico con el fin de desnaturalizar las proteínas y asegurar así su migración (algunas proteínas no
migran al aplicar una fuerza electromotriz, al encontrarse en su punto isoeléctrico).
La espectrometría de masas (MS) permite analizar la composición de diferentes elementos químicos e isótopos atómicos, separando los núcleos por su relación masa-carga.
En la identificación por huella peptídica las proteínas se identifican porm comparación de una lista de masas peptídicas experimentales con la lista de masas peptídicas calculaas en una base de datos