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Domande di bioinformatica, Esercizi di Bioinformatica

Università degli Studi di Napoli Federico II (UNINA)Bioinformatica

Domande anni scorsi di bioinformatica

Tipologia: Esercizi

2022/2023

Caricato il 22/04/2026

rosa-celiento-1
rosa-celiento-1 🇮🇹

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bg1
La rappresentazione binomiale del numero 14 è: 1110
2. Quale affermazione relativa alla centrifugazione in gradiente di densità
all'equilibrio è errata:
a. avviene in CsCl
b. è indipendente dal tempo di centrifugazione
c. la separazione avviene in base al differente grado di densità
d. avviene in gradiente di saccarosio
e. tutte le affermazioni sono esatte
3. Tramite elettroforesi cosa è possibile conoscere sulle componenti da
separare?
a. concentrazione
b. peso molecolare
c. forma
d. struttura
e. tutte le precedenti
4. Quali di queste molecole può fungere da fase stazionaria in una
cromatografia ad affinità?
a. anticorpo
b. enzima
c. ormone
d. acido nucleico
e. tutte le precedenti
5. Gli anfoliti servono a:
a. cromatografare i lipidi
b. creare un differente gradiente di densità
c. rompere le interazioni idrofobiche
d. formare diverso gradiente di pH
e. rappresentano la fase stazionaria di una cromatografia ad affinità
9. Una PAM32 rispetto ad una PAM90 è:
pf3
pf4
pf5
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pf9
pfa
pfd
pfe
pff
pf12

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Scarica Domande di bioinformatica e più Esercizi in PDF di Bioinformatica solo su Docsity!

La rappresentazione binomiale del numero 14 è: 1110

2. Quale affermazione relativa alla centrifugazione in gradiente di densità all'equilibrio è errata: a. avviene in CsCl b. è indipendente dal tempo di centrifugazione c. la separazione avviene in base al differente grado di densità d. avviene in gradiente di saccarosio e. tutte le affermazioni sono esatte

  1. Tramite elettroforesi cosa è possibile conoscere sulle componenti da separare? a. concentrazione b. peso molecolare c. forma d. struttura e. tutte le precedenti
  2. Quali di queste molecole può fungere da fase stazionaria in una cromatografia ad affinità? a. anticorpo b. enzima c. ormone d. acido nucleico e. tutte le precedenti
  3. Gli anfoliti servono a: a. cromatografare i lipidi b. creare un differente gradiente di densità c. rompere le interazioni idrofobiche d. formare diverso gradiente di pH e. rappresentano la fase stazionaria di una cromatografia ad affinità
  4. Una PAM32 rispetto ad una PAM90 è :

a. più stringente b. meno stringente c. sono intercambiabili d. non esiste una PAM e. non esiste una PAM

  1. Per un allineamento di tipo locale quale algoritmo scegliereste? a. Needle b. Water c. PAM d. tutte le precedenti e. nessuna delle precedenti
  2. Quale di queste tecniche non permette di valutare il peso molecolare di un campione? a. spettrofotometria b. elettroforesi con SDS c. cromatografia ad esclusione molecolare d. nessuna delle precedenti e. tutte le precedenti
  3. La centrifugazione all'equilibrio : a. si effettua in gradiente continuo di saccarosio b. è legata al tempo c. serve a separare particelle con densità simili d. nessuna delle precedenti e. tutte le precedenti
  4. Quale di queste sostanze è utile per la valutazione indiretta della concentrazione di proteine in un campione? a. albumina b. NADH e NAD+ c. biureto
  1. E' preferibile per allineamenti euristici proteici: a. fasta b. blast c. blosum d. water e. needle
  2. Swissprot è : a. un algoritmo di allineamento b. una banca dati proteica c. un programma che permette di visualizzare più banche dati d. una banca dati svizzera e. nessuna delle precedenti
  3. In un albero filogenetico: a. la lunghezza dei rami rappresenta sempre la distanza evolutiva b. la radice è l'elemento evolutivo più recente c. si visualizzano duplicazioni e speciazioni d. rooted non è presente legame evolutivo tra le foglie e. i nodi rappresentano unità tassonomiche note
  4. Un computer instradatore è detto : a. router X b. server c. packager

d. multiuser e. nessuna risposta è corretta

  1. Matcher è un programma di allineamento: a. globale b. locale c. multiplo d. euristico e. più di una corretta
  2. ClustalW è usato per: a. allineamenti singoli b. allineamenti globali c. allineamenti locali d. sequenziamento e. nessuna è corretta
  3. Valori elevati di p-value sono: a. molto significativi b. poco significativi c. decisionali d. non auspicabili dall'utente e. non esiste p-value
    1. Una Blosum 30 rispetto ad una Blosum 40 è: a. più specifica b. meno specifica c. uguale d. non esiste Blosum 40 e. non si può determinare
  4. Una gel filtrazione lascia eluire:

c. 200 e 0 d. 300 e 200 e. più di una è corretta f. tutte corrette

  1. Una matrice PAM0 : a. è equivalente ad una matrice di similarità b. non esiste c. è equivalente ad una matrice di identità d. è una matrice di soli amminoacidi rari
  2. PHP è : a. un linguaggio di programmazione X b. un sistema operativo c. un codice crittografico d. un componente hardware
  3. Quale di questi algoritmi è usato per allinementi di tipo locale: a. Needleman-Wunsch b. Smith-Waterman X c. FASTA d. ClustalW
  4. PAM e BLOSUM sono matrici: a. multidimensionali b. di sostituzione X c. filogenetiche d. di relazione
  1. Una ORF batterica tipicamente termina con: a. un codone di stop X b. codone di start c. codone raro d. codone qualsiasi
    1. Gapped-BLAST a. utilizza "word" per la ricerca di hit più grandi di 30 b. utilizza un algoritmo di allinemento di tipo locale X c. utlizza un algoritmo di allineamento di tipo globale d. non assegna agli hit un e-value
  2. Una matrice BLOSUM 62 è stata generata usando: a. sequenze con al massimo 62% identità b. sequenze con almeno il 62% identità X c. sequenze di 62 amminoacidi d. sequenze più piccole di 62 amminoacidi
  3. Il programma Stratcher: a. esegue allineamenti multipli b. esegue allineamenti di tipo locale c. ricerca omologie in banche dati di sequenze d. esegue allineamenti di tipo globale
  4. La risoluzione media delle mappe STS è di: a. 1.0 Mb b. 10 Mb c. 1.5 Mb d. 0.1 Mb
  1. L'esistenza di geni ortologhi presuppone: a. un evento di duplicazione genica b. un evento di duplicazione genica seguito da speciazione c. un evento di speciazione d. un evento di trasposizione
  2. La programmazione dinamica: a. è una tecnica usata per la scansione dinamica delle immagini b. è una tecnica utile per l'allineamento di sequenze X c. è tipica di linguaggi di programmazione a basso livello d. è utilizzata per determinare l'idropatia di proteine
  3. La mappa dei marcatori cromosomici è utile per: a. la predizione della funzione delle proteine b. l'identificazione di geni paraloghi c. l'assemblaggio di sequenze genomiche d. l'identificazione dei promotori
  4. In un terreno di coltura, il glucosio : a. assicura il bilancio di cationi ed anioni b. è indispensabile per la sintesi di vitamine c. è importante per le funzioni legate al fabbisogno energetico X d. è un componente non importante e può essere omesso
  5. Le proteine possono essere purificate sfruttando (risp. errata): a. carica b. densità c. capacità di assorbimento di energia radiante X d. dimensioni

1. Le interfacce WEB di programmi che funzionano a linea di comando A. hanno lo scopo di facilitare l'accesso e l'uso del programma B. sono necessarie per il corretto funzionamento del programma C. rappresentano l'unica modalita' di accesso remoto al programma D. sono necessarie se non si vogliono specificare tutte le opzioni del programma

  1. Attraverso la ricerca di Open Reading Frame e' possibil e A. identificare siti di splicing B. identificare nuovi geni/proteine C. eseguire una mappa di restrizione D. calcolare il contenuto in GC
  2. La sigla PAM sta per A. Percent Accepted Mutation B. Point Alignment Mutation C. Point Accepted Mutation D. Protein Alignment Mutation
  3. Il C e' un linguaggio A. non piu' in uso B. di programmazione a basso livello C. di programmazione ad alto livello D. riservato alla produzione di sistemi operativi
  4. I programmi del pacchetto 'BLAST' A. allineano solo sequenze nucleotidiche B. confrontano una sequenza con un banca dati di sequenze C. generano allineamenti multipli D. utilizzano algoritmi di tipo globale
  5. Quale di questi programmi e' presumibilmente meno accurato per la comparazione di due sequenze? A. MATCHER B. FASTA C. NEEDLE

D. la percentuale di identita' dell'allineamento

  1. Needleman e Wunsh sono gli autori di A. un algoritmo per il riarrangiamento di alberi B. un algoritmo per la costruzione di alberi C. un metodo di allineamento locale D. un metodo di allineamento globale
  2. Un database relazionale A. e' essenziale per la gestione di dati di sequenze B. prevede una organizzazione dei dati in piu' tabelle C. e' stato utilizzato per costruire la banca dati EMBL D. non puo' essere usato in biologia
  3. Un algoritmo di allineamento di tipo 'globale' A. utilizza solo matrici di tipo 'PAM' B. utilizza solo matrici BLOSUM60 o superiore C. non prevede l'inserimento di 'gap' nell'allineamento D. prevede, se necessario, l'inserimento di 'gap' nell'allineamento
  4. I programmi che mostrano graficamente gli alberi di similarita' utilizzano A. le matrici di distanza B. le sequenze allineate C. le sequenze in formato FastA D. i dendrogrammi
  5. Una matrice di punteggio per acidi nucleici A. e' una matrice 10x B. puo' tenere conto delle coppie AG e CT C. e' una matrice costituita solo da valori 0 e 1 D. non puo' essere applicata ad RNA ribosomali
  6. Quali delle seguenti sequenze NON sono marker genetici A. STS B. SSLP

C. RFLP

D. SINE

  1. In un campo elettrico una proteina migra verso l'anodo se il tampone di corsa presenta : A. pH uguale al suo punto isoelettrico B. pH inferiore al suo punto isoelettrico C. pH maggiore del suo punto isoelettrico D. Alta forza ionica
  2. In una centrifugazione in un gradiente di densita' all'equilibrio : A. Il campione viene miscelato con una soluzione concentrata di cloruro di cesio B. il campione viene stratificato su di un gradiente di densita' preformato C. il campione raggiunge la sua densita' o posizione isopicnica in pochissimo tempo D. non puo' essere mai utilizzata per separare molecole di DNA
  3. Lo spettro di assorbimento : A. dipende dalla intensita' di luce trasmessa B. dipende dalla intensita' di luce assorbita C. dipende dalla intensita' di luce riflessa D. dipende dai gruppi funzionali presenti nelle molecole
  4. L'elettroforesi su gel di agarosio viene di solito utilizzata per separare : A. un estratto cellulare B. acidi nucleici C. proteine D. una sequenza di DNA
  5. La legge di Lambert-Beer: A. e' indipendente dallo spessore della soluzione B. e' valida solo nell'ultravioletto C. non e' valida per composti colorati D. Mette in relazione la luce assorbita con la concentrazione di una soluzione
  6. Indicare la lunghezza d'onda appropriata per misurare la concentrazione di un acido nucleico : A. 360 nm

4. Solitamente la dimensione del 'ktup' (o word-size) in fastA e' di A. 6 per le proteine

e 1 per gli acidi nucleici B. 2 per le proteine e 6 per gli acidi nucleici C. 6 per le

proteine e 2 per gli acidi nucleici D. 12 per le proteine e 6 per gli acidi nucleici

5. Nell'output di BLAST una similarita' migliore corrisponde a A. SCORE basso e

E-VALUE alto B. SCORE basso e E-VALUE basso C. SCORE alto e E-VALUE

basso D. SCORE alto e E-VALUE alto

6. Il programma ClustalW A. e' in grado di allineare due o piu' sequenze B. e' in

grado di allineare fino a 10 sequenze C. e' in grado di allineare una sequenza proteica

con sequenze nucleotidiche D. non e' in grado di allineare sequenze nucleotidiche

7. Due geni ortologhi A. sono simili almeno per il 90% B. derivano da uno stesso

gene progenitore C. derivano da un evento di inserzione D. appartengono solo ad

organismi animali

8. Nell'output di BLAST due match con lo stesso score A. possono corrispondere a

sequenze diverse B. non hanno mai lo stesso e-value C. mappano in regioni diverse di

una stessa sequenza D. corrispondono a sequenze della stessa lunghezza

9. BLAST prevede A. la necessaria suddivisione per specie del database di sequenze

B. il campionamento del numero di sequenze contenenti isole CpG C. il filtraggio

delle sequenze per rimuovere le guanine D. la pre-indicizzazione della collezione di

sequenze in cui cercare

10. Gli SNP possono essere usati come A. fattori mutageni B. marker genetici C.

sonde di ibridazione D. siti di poliadenilazione

11. In un genoma, puo' essere definito 'marker' genetico A. una sequenza di DNA

satellite B. una sequenza AATAAA C. una sequenza D. un RFLP

12. Nel genoma umano sono piu' abbondanti A. copie di plasmidi fagici B. i

retrotrasposoni virali C. le sequenze ALU D. i geni ribosomali

13. Lo studio delle frequenze di ricombinazione in famiglie puo' essere usato per A.

creare mappe genetiche B. determinare la sequenza del gene in esame C. creare

mappe di restrizione D. sequenziare il genoma di un singolo individuo

14. Quali delle seguenti sequenze NON sono marker genetici A. STS B. SSLP C.

RFLP D. SINE

15. Quale delle seguenti metodiche NON e' utilizzata per il sequenziamento di acidi

nucleidi A. Pyrosequencing B. Sanger C. Fish D. Shotgun

16. In una matrice di allineamento un 'path' corrisponde a A. l'allineamento

selezionato dalle opzioni prescelte B. il miglior allineamento possibile C. uno

specifico allineamento privo di gap D. uno specifico allineamento contenente gap

17. In un dotplot, aumentando la word W si evidenziano regioni uguali A. piu' lunghe

B. piu' corte C. piu' complesse D. piu' stringenti

18. In un dotplot, cambi di diagonale rappresentano A. gaps uguali in entrambe le

sequenze B. errori del dotplot, di difficile interpretazione C. gaps in una delle due

sequenze D. introni inseriti di recente

19. Le matrici PAM e BLOSUM sono dette di 'sostituzione' perche' A. sono nate in

sostituzione degli algoritmi globali e locali B. consentono di attribuire un punteggio

alle sostituzioni amminoacidiche C. sostituiscono le matrici di identita' con PSSM D.

sostituiscono le triplette nucleotidiche con i corrispondenti amminoacidi

20. In un database relazionale i dati sono distribuiti A. in un'unica grande tabella

allineata B. in piu' tabelle C. in programmi multipli D. in un solo grande foglio di

Excel

21. La banca dati EMBL contiene soltanto: A. sequenze nucleotidiche e relative

annotazioni B. sequenze di mRNA e relative annotazioni C. sequenze di DNA

genomico e relative annotazioni D. sequenze codificanti e relative annotazioni

23. Nella stabilizzazione di un'alfa elica sono importanti A. gli amminoacidi neutri B.

i ponti disolfuro C. gli amminoacidi carichi positivamente D. i legami a idrogeno

24. In un dotplot, linee diagonali parallele rappresentano A. regioni codificanti B.

regioni duplicate C. regioni complementari D. regioni palindromiche

25. Un algoritmo di allineamento di tipo 'locale' A. utilizza solo matrici 'BLOSUM'

B. cerca di allineare le sequenze in tutta la loro lunghezza, ma senza inserire gap C.

cerca di allineare le sequenze in tutta la loro lunghezza inserendo, se necessario, gap

D. cerca di allineare le sequenze in modo da appaiare le regioni con il piu' alto livello

di similarita'

26. Ensembl e' un sistema che consente di A. interrogare la banca dati EMBL per

ricercare geni B. visualizzare genomi procariotici C. esplorare genomi eucariotici D.

sequenziare genomi eucariotici

27. Le banca dati secondarie A. sono prodotte mediante rimescolamento casuale B.

sono banche dati di importanza secondaria C. sono generate a partire da altre banche

dati D. sono banche dati di strutture secondarie di proteine