Docsity
Docsity

Prepara tus exámenes
Prepara tus exámenes

Prepara tus exámenes y mejora tus resultados gracias a la gran cantidad de recursos disponibles en Docsity


Consigue puntos base para descargar
Consigue puntos base para descargar

Gana puntos ayudando a otros estudiantes o consíguelos activando un Plan Premium


Orientación Universidad
Orientación Universidad


definicions TI, Apuntes de Microbiología

Asignatura: Tecniques Instrumentals, Profesor: Inmaculada Ponte, Carrera: Microbiologia, Universidad: UAB

Tipo: Apuntes

2012/2013

Subido el 18/11/2013

maariaa91
maariaa91 🇪🇸

4.4

(5)

2 documentos

1 / 2

Toggle sidebar

Esta página no es visible en la vista previa

¡No te pierdas las partes importantes!

bg1
TEMA 1: DEFINICIONS
Espectroscòpia: tècnica que permet estudiar la relació entre la radiació i la matèria i ens ajuda a
determinar la composició de la mostra
Radiació electromagnètica: mesura de les propietats moleculars basada en la interacció de les
molècules amb la llum.
Cromòfors: molècules amb capacitat per absorbir llum. Tenen color
Espectrofotòmetre: instrument que mesura la llum absorbida per una mostra.
Lent condensadora: lent que condensa el feix de llum que prové de la làmpara a fi
d’evitar dispersions
Lent colimadora: lent que homogenitza el deix de llum en una sola trajectòria paral·lela
Monocromador: llum blanca que dispersa totes les longituds d’ona que la componen
Espectrofotòmetre de doble feix: és semblant a l’espectrofotòmetre d’un feix però aquest té un
divisor que separa el feix convertint-lo en 2 feixos de llum idèntics. Cada un d’aquests feixos va a
parar en una cubeta diferent on una ens serveix de blanc i l’altre és on hi posem la mosta.
Absorbància: quantitat de llum que absorbeix una mostra.
Coeficient d’extinció molar: quantitat de llum absorbida per una solució 1M d’una determinada
molècula en una cubeta d’1cm i a una λ determinada
Radiació monocromàtica: llei definida per les radiacions d’una longitud d’ona determinada. Segons
la qualitat de l’instrument utilitzarem una finestra més o menys estreta.
TEMA 2: DEIFINICIONS
Excitació: absorció de radiació electromagnètica que passa d’estat fonamental a excitat.
Desexcitació: transmissió des de l’estat excitat al fonamental.
Fluorscència: propiedad que tienen algunas sustancias de absorber energía y luego emitir parte de
esa energía en forma de luz.
Fosforescència: fenómeno en el cual ciertas sustancias tienen la propiedad de absorber energía y
almacenarla, para emitirla posteriormente en forma de radiación.
Fluorímetre: dispositiu per a realitzar mesures espectroscòpiques d’emissió i excitació òptiques
Espectrofluorímetre: serveix per a mesurar compostos que emeten un determinat tipus de radiació
en ser excitats o irradiats per una llum amb una λ concreta.
Intensitats de fluorescència:
Intensitat de fluorescència real: numero de fotons emesos per unitats de temps
Intensitat de fluorescència observada: numero de fotons que arriben al fotomultiplicador
Filtre intern: disminució de la llum absorbida degut a la profunditat de la mostra.
Filtre extern: absorció de la pròpia llum emesa per fluorescència. Canvi de la direcció de
la llum
Quenching: pèrdua de l’emissió de fluorescència degut a la intersecció del fluòfor amb una altre
molècula
Desactivació dinàmica: el quencher està en la dissolució i la desactivació es produeix a
través de colisions entre el fluòfor i el quencher
Desactivació estàtica: el quencher està assocuat al fluòfor formant un compleix i el
complex passa a un estat fonamental sense emetre radiació
FRET: mecanisme de transferència d’energia entre cromòfors
TEMA 3: DEFINICIONS
Cromatografia: mètode mitjançant el qual podem separar molècules en funció de l’afinitat que
tinguins amb la fase mòbil o amb la fase estacionària
Cromatografia convencional:
Llit cromatogràfic: suport sòlid porós damunt del qual es diposita la fase estacionària
Flux: cabal al qual la fase mòbil travessa la fase estacionària
Elució: procés que va des del moment en que apliquem la mostra fins que recuperem
l’últim solut
Perfil d’elució: gràfic que permet veure quan i en quina quantitat surt cada solut.
Tipus elucions:
Isocràtica: mateix tampó durant tota la cromatografia
Escalonada: variem la concentració de tampó de forma brusca
Gradient continu: la [ ] de la fase mòbil augmenta uniformement amb el
temps
Cromatografia en gel filtració: distribució de les partícules segons la seva capacitat de penetrar o no
al gel en funció de la seva mida i pes
Coeficient de repartiment: Soluts>porus (no poden penetrar en fase estacionària
i s’elueixen primers) soluts = porus (penetraran amb diferent probabilitat al gel) soluts
< porus (penetraran tots en el gel i seran els últims a sortir)
Cromatografia de bescanvi iònic: es basa en la càrrega de les proteïnes que volem separar, i en
funció d’aquesta càrrega si és positiva o negativa.
Bescanvi catiònic: la fase estacionària aniponica està adherida a un suport cromatogràfic
sòlid i la fase sòlida és una dissolució de sal amb una determinada força iònica
Bescanvi aniònic: igual que el catiònic però amb les càreegues invertides. La resina és
positiva i les proteïnes que s’hi adhereixen negatives.
Cromatografia hidrofòbica: es basa en el caràcter polar/apolar de les molècules a separar. La fase
estacionària és un compost hidrofòbic i la fase mòbil és un dissolvent polar
Cromatografia d’afinitat biològica:es basa en una interacció específica entre molècules i només
s’utilitza en casos molt concrets
Cromatografia de repartiment:
Cr normal o de capa fina: fase estacionària és un dissolvent amb polaritat i la fase mòbil
és un dissolvent molt apolar. La fase mòbil avança per “escapar ” de l’aigua.
Cr en fase inversa: fase estacionària molt apolar i fase mòbil polar. Aquí l’aigua actua de
fase mòbil
RF: mobilitat relativa d’una molècula respecte el dissolvent. És un paràmetre
característic de cada solut en un dissolvent concret i independent del temps que hagi
durat una cromatografia o de la llargada del paper cromatogràfic
pf2

Vista previa parcial del texto

¡Descarga definicions TI y más Apuntes en PDF de Microbiología solo en Docsity!

TEMA 1: DEFINICIONS

Espectroscòpia: tècnica que permet estudiar la relació entre la radiació i la matèria i ens ajuda a determinar la composició de la mostra Radiació electromagnètica: mesura de les propietats moleculars basada en la interacció de les molècules amb la llum. Cromòfors: molècules amb capacitat per absorbir llum. Tenen color Espectrofotòmetre: instrument que mesura la llum absorbida per una mostra. Lent condensadora: lent que condensa el feix de llum que prové de la làmpara a fi d’evitar dispersions Lent colimadora: lent que homogenitza el deix de llum en una sola trajectòria paral·lela Monocromador: llum blanca que dispersa totes les longituds d’ona que la componen Espectrofotòmetre de doble feix: és semblant a l’espectrofotòmetre d’un feix però aquest té un divisor que separa el feix convertint-lo en 2 feixos de llum idèntics. Cada un d’aquests feixos va a parar en una cubeta diferent on una ens serveix de blanc i l’altre és on hi posem la mosta. Absorbància: quantitat de llum que absorbeix una mostra. Coeficient d’extinció molar: quantitat de llum absorbida per una solució 1M d’una determinada molècula en una cubeta d’1cm i a una λ determinada Radiació monocromàtica: llei definida per les radiacions d’una longitud d’ona determinada. Segons la qualitat de l’instrument utilitzarem una finestra més o menys estreta.

TEMA 2: DEIFINICIONS

Excitació: absorció de radiació electromagnètica que passa d’estat fonamental a excitat. Desexcitació: transmissió des de l’estat excitat al fonamental. Fluorscència: propiedad que tienen algunas sustancias de absorber energía y luego emitir parte de esa energía en forma de luz. Fosforescència: fenómeno en el cual ciertas sustancias tienen la propiedad de absorber energía y almacenarla, para emitirla posteriormente en forma de radiación. Fluorímetre: dispositiu per a realitzar mesures espectroscòpiques d’emissió i excitació òptiques Espectrofluorímetre: serveix per a mesurar compostos que emeten un determinat tipus de radiació en ser excitats o irradiats per una llum amb una λ concreta. Intensitats de fluorescència: Intensitat de fluorescència real: numero de fotons emesos per unitats de temps Intensitat de fluorescència observada: numero de fotons que arriben al fotomultiplicador Filtre intern: disminució de la llum absorbida degut a la profunditat de la mostra. Filtre extern: absorció de la pròpia llum emesa per fluorescència. Canvi de la direcció de la llum Quenching: pèrdua de l’emissió de fluorescència degut a la intersecció del fluòfor amb una altre molècula Desactivació dinàmica: el quencher està en la dissolució i la desactivació es produeix a través de colisions entre el fluòfor i el quencher Desactivació estàtica: el quencher està assocuat al fluòfor formant un compleix i el complex passa a un estat fonamental sense emetre radiació FRET: mecanisme de transferència d’energia entre cromòfors

TEMA 3: DEFINICIONS

Cromatografia: mètode mitjançant el qual podem separar molècules en funció de l’afinitat que tinguins amb la fase mòbil o amb la fase estacionària Cromatografia convencional: Llit cromatogràfic: suport sòlid porós damunt del qual es diposita la fase estacionària Flux: cabal al qual la fase mòbil travessa la fase estacionària Elució: procés que va des del moment en que apliquem la mostra fins que recuperem l’últim solut Perfil d’elució: gràfic que permet veure quan i en quina quantitat surt cada solut. Tipus elucions: Isocràtica: mateix tampó durant tota la cromatografia Escalonada: variem la concentració de tampó de forma brusca Gradient continu: la [ ] de la fase mòbil augmenta uniformement amb el temps Cromatografia en gel filtració: distribució de les partícules segons la seva capacitat de penetrar o no al gel en funció de la seva mida i pes Coeficient de repartiment: Soluts>porus (no poden penetrar en fase estacionària i s’elueixen primers) soluts = porus (penetraran amb diferent probabilitat al gel) soluts < porus (penetraran tots en el gel i seran els últims a sortir) Cromatografia de bescanvi iònic: es basa en la càrrega de les proteïnes que volem separar, i en funció d’aquesta càrrega si és positiva o negativa. Bescanvi catiònic: la fase estacionària aniponica està adherida a un suport cromatogràfic sòlid i la fase sòlida és una dissolució de sal amb una determinada força iònica Bescanvi aniònic: igual que el catiònic però amb les càreegues invertides. La resina és positiva i les proteïnes que s’hi adhereixen negatives. Cromatografia hidrofòbica: es basa en el caràcter polar/apolar de les molècules a separar. La fase estacionària és un compost hidrofòbic i la fase mòbil és un dissolvent polar Cromatografia d’afinitat biològica:es basa en una interacció específica entre molècules i només s’utilitza en casos molt concrets Cromatografia de repartiment: Cr normal o de capa fina: fase estacionària és un dissolvent amb polaritat i la fase mòbil és un dissolvent molt apolar. La fase mòbil avança per “escapar ” de l’aigua. Cr en fase inversa: fase estacionària molt apolar i fase mòbil polar. Aquí l’aigua actua de fase mòbil RF: mobilitat relativa d’una molècula respecte el dissolvent. És un paràmetre característic de cada solut en un dissolvent concret i independent del temps que hagi durat una cromatografia o de la llargada del paper cromatogràfic

HPLC (cromatografia líquida d’alta resolució): tècnica analítica que ofereix una resolució molt més elevada que les convencionals tot i operar amb gels similars.

TEMA 4: DEFINICIONS

Coeficient de sedimentació: velocitat per unitat de camp gravitatori Velocitat de sedimentació: proporcional a la massa de la partícula, depèn molt del medi Ultracentrífuga analítica: sistema òptic per seguir el desplaçament de molècules i cèl·lules de centrifugació. És la única que permet calcular la veloctat de sedimentació de forma experimental Tipus de rotors Rotor flotant: les camises passen d’estat vertical a hortzontal (pelet al fons) Rotor angular: velocitats diferents per a cada tub (pellet no ben definit) Rotor vertical: les mostres s’estratifiquen de forma perpendicular Centrifugació en gradients (dis)continus: en el tub trobem diferents densitats pero no es troben formant un gradient. Centrifugació en gradients (dis)continus: en el fons del tub hi ha uns olució amb més densitat i a dalt una amb menys densitat Centrifugació isopínica: no tenim cap estratificació. Les particules denses han de baixar. S’utilitza per separar proteïnes/DNA/RNA i si es combina amb CsCl i bromur d’etidi ens serveix per la separació de diferents formes de DNA plasmídic Ultracentrifugació analítica: serveix per anar veient l’absorbància durant el procés de centrifugació. Permet la determinació del desplaçament del solut en funció del temps.

TEMA 5: DEFINICONS

Rendiment: total fracció/total enzim inicial Factor de purificació: augmentar la concentració de la proteïna pura respecte a la proteïna que estem calculant Captura: purificació inicial de la molèculaobjectiu procedent de l’extracte cru o material clarificat Combinació de tècniques

CONDICIONS INICIALS TÈCNICA CONDICIONS FINALS Volum mostra limitat Gel filtració Mostra diluïda. Canvi de tampó Baixa força iònica Interacció iònica Alta força iònica i canvi de pH Alta força iònica Interacció hidrofòbica Baixa força iònica Condicions específiques d’unions

Cromatografia afinitat biològica Condicions específiques d’elució

Unió tècniques cromatogràfiques Intercanvi iònic interacció hi brofòbica GF C afinitat GF Interacció hidrofòbica intercanvi iònic PCR o GF

• C afinitat GF

GF intercanvi iònic interacció hidrofòbica GF c afinitat GF

TEMA 6: DEFINICIONS

Suports no restrictius: molt laxes i poc concentrats, amb forats molt grans que permeten una gran mobilitat de les molècules Suports restrictius: més concentrat, dificulta la mobilitat de les molècules. En aquest cas, la mobilitat no depèn únicament de la densitat de càrrega sinó de la mida i forma de les molècules Mobilitat electroforètica relativa: és la diferència de distància recorreguda en funció de la distància total de la molècula que estudiem per la molècula patró. electroendosmosi: capacitat del suport pe carregar-se. Pot alterar el moviment de les partícules Electroenfoc: separem les proteïnes segons sigui el seu pI gràcies a un gradient de pH. Quan el pI=pH s’atura.

TEMA 7: DEFINICIONS

Western blot: identificació d’una proteïna mitjançant un anticòs Southern blot: identificació de DNA per complementarietat de bases. Necessita una prèvia electroforesi desnaturalitzant Northern blot: identificació de RNA per complementarietat de bases. Necessita una prèvia electroforesi desnaturalitzant South-western: identificació de les interaccions DNA-proteïna Microarrays: hibridació sobre portaobjectes de DNA, RNA o proteïnes que permeten mesurar l’espressió gènica. Hot start: modificació de la PCR convencional que redueix l’amplicficació de productes no específics