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epigenetica, Apuntes de Genética

Asignatura: Genetica, Profesor: , Carrera: Biología, Universidad: UMA

Tipo: Apuntes

2015/2016

Subido el 21/06/2016

lusiluqm
lusiluqm 🇪🇸

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EPIGENETICA
A partir de un único genoma se pueden obtener varios “genomas distintos” sin que
cambie la secuencia del DNA.
Por ejemplo, en un ratón heterocigótico en el gen Igf2 con un mutante recesivo, si el
mutante proviene de la madre su fenotipo es silvestre, sin embargo, si el mutante
proviene del padre el ratón tiene fenotipo enano. La información del genoma es la
misma pero el fenotipo es diferente.
Otro ejemplo es el pelaje parcheado de los gatos, que esta expresado por un gen con
dos alelos, donde el negro es dominante y el marrón recesivo, sin embargo, en
hembras el pelaje de un heterocigoto sale parcheado.
En gemelos, que son genéticamente idénticos pero conforme van creciendo no tienen
el mismo fenotipo, por lo que no hay una relación directa entre el genotipo y el
fenotipo, esto está condicionado por el ambiente.
Para que todos los elementos en cis permitan que se unan los elementos en trans se
unan tienen que quitar los nucleosomas, y el nucleosoma está compuesto por:
2 H3
2 H4
2 H2A
pf3
pf4
pf5

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EPIGENETICA

A partir de un único genoma se pueden obtener varios “genomas distintos” sin que cambie la secuencia del DNA.

Por ejemplo, en un ratón heterocigótico en el gen Igf2 con un mutante recesivo, si el mutante proviene de la madre su fenotipo es silvestre, sin embargo, si el mutante proviene del padre el ratón tiene fenotipo enano. La información del genoma es la misma pero el fenotipo es diferente.

Otro ejemplo es el pelaje parcheado de los gatos, que esta expresado por un gen con dos alelos, donde el negro es dominante y el marrón recesivo, sin embargo, en hembras el pelaje de un heterocigoto sale parcheado.

En gemelos, que son genéticamente idénticos pero conforme van creciendo no tienen el mismo fenotipo, por lo que no hay una relación directa entre el genotipo y el fenotipo, esto está condicionado por el ambiente.

Para que todos los elementos en cis permitan que se unan los elementos en trans se unan tienen que quitar los nucleosomas, y el nucleosoma está compuesto por:

  • 2 H
  • 2 H
  • 2 H2A

• 2 HRB

  • 150pb de DNA
  • Unidos entre ellos por un linker

Si un DNA está muy empaquetado no se puede expresar.

  • Heterocromatina : DNA silenciado, regiones del genoma que no se transcriben.
  • Eucromatina : regiones activas del genoma que se transcriben

1) LAS HISTONAS SE PUEDEN MODIFICAR QUIMICAMENTE

Las estructuras de los aminoácidos que salen del nucleosomas de forma lineal no tienen estructura secundaria. Las histonas tienen muchos aminoácidos básicos (lisina y arginina) que le proporcionan una carga positiva. Algunas de las lisinas pueden acetilarse, siendo más negativas y con menos afinidad por el DNA. Las histonas también pueden metilarse, fosforilarse… todas estas modificaciones son de tipo postraduccional, cada modificación tiene una consecuencia en el nucelosoma:

  • Para activar el gen: se acetila H3 y H4 en el N – terminal y un grupo metilo en la Lys de H5.
  • Para silenciar un gen: perdida de la acetilación y la Lys 9 de H3 se metila. Esto hace que se compacte más el DNA.

Los activadores están asociados a acetiladores de H y los represores están asociados a desacetiladores de H.

la metilación, esto sirve para la reparación de errores que cadena es la nueva que es la cual tendrá posiblemente el error.

También existen DNMT de novo que establecen los patrones de metilación en los embriones-

En mamíferos hay islas CpG (citosina, fosfato, guanina) que son secuencias de unos 200 nucleótidos en C – G sea mayor del 50%. Están asociados a promotores (60% de promotores en mamíferos tienen islas CpG) no suelen estar hemimetilados, por lo que potencialmente se pueden expresar. Si se metilaran los genes se silenciarían.

En una célula normal las islas CpG no están metiladas, en células cancerosas las islas CpG se metilan y con supresores tumorales, aunque haya supresores tumorales están silenciados por lo que la célula se divide constantemente.

También, el DNA repetido esta metilado, se hipometila (trasposones) y se sitúan en distintos sitios del genoma, esto también produce células tumorales.

En plantas, la metilación se produce en islas CpG o en CAG o en CXX. Aquí la metilación es guiada por los pequeños RNA de 24 nucleótidos que se unen al DNA en el homologo y este se metila.

Una región rica en trasposones pueden ser repeticiones directas o inversas, si se empiezan a transcribir da un DNA de doble cadena, esta es la señal para la formación de pequeñas moléculas de RNA que se unen y se metilan, así no se transcriben.

3) EXISTEN PEQUEÑOS RNA NO CODIFICANTES QUE ACTUAN

SOBRE LA CROMATINA

4) COMPLEJOS PROTEICOS QUE REMODELAN LA

CORMATINA

CRCs (lectores de la cromatina) que ven las marcas de H y DNA. Si ven una región con marcas permisivas para la transcripción usando ATP desplazan los nucelosomas para que la RNA polimerasa transcriba.

**RESUMEN

Podemos definir epigenoma como las modificaciones en la cromatina que empaquetan al genoma y controlan su expresión. Así podemos explicar los fenotipos distintos.

El caso del ratón del padre, el ratón siempre va a ser como el padre sin importar el alelo de la madre. Este gen tiene imprintig materno, el alelo de la madre no se expresa sea silvestre o sea mutante porque en el promotor tiene una isla CpG y la copia de la madre esta metilada por lo que esta silenciada. El gen H19 también tiene imprinting, se hereda silenciada. Para estos genes es como si el organismo fuese haploide.