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Asignatura: Genética, Profesor: , Carrera: Biología, Universidad: UAM
Tipo: Ejercicios
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EPIGENÉTICA: El material genético no está aislado, se encuentra protegido por una estructura - cromatina. La configuración de la cromatina cambia a lo largo de la vida del individuo debido a modificaciones covalentes (metilaciones, acetilaciones, fosforilaciones, etc) y a la actuación de proteínas remodeladoras. Se han de tener en cuenta dos aspectos básicos:
La construcción del “vestido epigenético” y de los elementos necesarios para su modificación está controlada por los propios genes: Genes que codifican proteínas histónicas. Las histonas liberan unas prolongaciones (“colas de histonas nucleosómicas”) en cuyos aminoácidos se producen las modificaciones epigenéticas. Genes que codifican proteínas capaces de modificar covalentemente el ADN o los aminoácidos de las histonas (metilasas de citosinas del ADN , metilasas y acetilasas de histonas, etc), conocidas como “writers”. Genes que codifican proteínas capaces de revertir dichas modificaciones (demetilasas, diacetilasas), conocidas como “erasers”. Los cambios en la cromatina pueden ser reversibles hasta cierto punto. Genes que codifican proteínas remodeladoras, capaces de reconocer o interpretar dichas modificaciones para inducir cambios en la configuración de la cromatina, conocidas como “readers”.
Pero los materiales necesarios para estas modificaciones son aportados por la dieta o resultan de procesos metabólicos. Por tanto, todos los cambios en la cromatina que acaban por definir el epigenoma se producen por la acción de múltiples factores.
La epigenética constituye un conjunto de mecanismos, extremadamente versátiles, que afectan al epigenoma para el control de la expresión génica. El término " epigenoma ” se refiere al conjunto de cambios epigenéticos que “visten” el “genoma” celular. Se podría hablar de un “ código epigenético ” superpuesto al “codigo genético”. Se refiere a las múltiples y dinámicas modificaciones químicas de las citosinas y los aminoácidos de las colas de histonas que regulan la transcripción de manera sistemática y reversible. Son los factores activadores e inactivadores génicos. El carácter heredable de los cambios epigenéticos permitiría hablar de epi-mutaciones.
El término epigenética se utiliza con carácter restrictivo para referirse a los cambios en la expresión genética que, a pesar de su potencial reversibilidad, pueden permanecer durante rondas sucesivas de divisiones celulares. En sentido amplio , influye en todos los procesos genéticos básicos, no solo en la transcripción (iniciación y elongación), sino también en la replicación y los procesos de reparación del daño genético. Los fenómenos de naturaleza epigenética actúan a través de la metilación del DNA , y la metilación, fosforilación , y acetilación / deacetilación de las histonas , provocando cambios en la configuración de la cromatina que facilitan o impiden la expresión de los genes.
Metilación del DNA: En animales (particularmente mamíferos) se centra en sitios CpG. Explica la memoria celular. Se ha identificado otros sitios “metilables” en plantas, hongos y células troncales de mamíferos, aún con significado incierto. Se han identificado varias proteínas que reconocen específicamente sitios CpG metilados en mamíferos.
Acetilación/deacetilación de histonas: La acetilación/deacetilación de las colas de las histonas nucleosómicas tiene un papel fundamental en la regulación de la expresión génica. Estos mecanismos alteran el acceso de otras proteínas reguladoras al DNA. La acetilación de la lisina neutraliza sus cargas positivas y debilita la interacción electrostática entre las histonas y el DNA (cromatina abierta).
Los genomas de origen materno y paterno de mamíferos no son funcionalmente equivalentes debido a diferencias importantes en su estatus epigenético (“imprinting” o “marcado” gamético o pre-cigótico) , que se deben a la introducción de marcas epigenéticas complementarias durante la gametogénesis. Las pruebas experimentales de la no-equivalencia del genoma materno y el paterno vienen de la realización de experimentos: Diploidía uniparental inducidas mediante trasplante nuclear en ratón. Se forman zigotos que contienen el genoma exclusivamente materno o paterno. Se obtienen embriones de dos tipos: Ginogenotes y Androgenotes. En ambos casos, se producen deficiencias durante la gestación y muerte. Según el tipo de gameto, las causas del aborto son distintas. Existe por tanto un reparto de funciones claro ya desde el inicio del desarrollo Diploidía uniparental espontánea en la especie humana : Los ginogenotes dan lugar a quistes dermoides que derivan en teratomas ováricos. Los androgenotes se desarrollan como molas hidatiformes de vellosidades coriónicas y otras estructuras placentarias. Disomías uniparentales espontáneas en la especie humana. Suceden cuando lo que se repite no es el genoma de un parental completo, sino uno de los cromosomas. Por ejemplo en el cromosoma 15: Síndrome de Angelman (dos copias paternas del cromosoma 15). Síndrome de Prader-Willi (dos
copias maternas del cromosoma 15). Estos dos síndromes son distintos y a ambos les falta la expresión de algún gen esencial.
La explicación de la existencia de diferencias funcionales entre los genomas materno y paterno es porque se introducen cambios epigenéticos durante la formación de gametos. Existe un programa epigenético masculino y un programa epigenético femenino , en uno se inactivan genes que se expresan en el otro, de forma que sólo uniendo los dos genomas tenemos la posibilidad de expresar todos los genes. Radica en la expresión diferencial de los alelos paternos y maternos de algunos genes. Esto se llama imprinting parental , porque está ocurriendo en un parental y está siendo transmitido a sus descendientes.
Imprinting parental o pre-cigótico: Grupos de genes endógenos con expresión monoalélica uniparental, debido a la introducción de marcas epigenéticas durante la gametogénesis. Este “marcaje” sufre un proceso de reprogramación en la línea germinal de cada generación dependiente del sexo parental, pero se mantiene inalterado en la línea somática de los individuos. Se han caracterizado hasta 40 zonas de imprinting de los genomas materno y paterno, que afectan a unos 100 genes, que suelen aparecer en grupos ( clusters ).
Cambios epigenéticos transgeneracionales: Se heredan a través de los gametos durante más de dos generaciones sin sufrir reprogramaciones dependientes del sexo. Ejemplo: transposones y transgenes (empaquetados en heterocromatina, manteniendo su estatus a lo largo de generaciones sin variaciones dependientes de sexo). Para que dos genes se expresen de modo uniparental , se ha de llevar a cabo su silenciamiento en un locus y su activación en el otro. La expresión de estos genes se regula desde un centro de imprinting (IC) que contiene zonas susceptibles a ser metiladas en un cromosoma (lo cual impide la transcripción del gen en dicho cromosoma) y secuencias no metiladas en el otro, favoreciendo la transcripción. Mecanismo molecular: Todos los genes del cromosoma inactivado metilan sus secuencias GpC (que generalmente están protegidas en islas). Además, se cambian los patrones de acetilación/deacetilación de las histonas.
Los patrones epigenéticos son necesarios para el correcto desarrollo de un individuo; por tanto, alteraciones en los mismos causan patologías a todos los niveles. Un número creciente de enfermedades humanas han sido relacionadas con procesos de “metilación aberrante” como por ejemplo, el cáncer. Cáncer. El cambio en la expresión génica por una modificación epigenética puede tener un papel fundamental en la aparición de tumores, y puede explicar cómo los factores ambientales influyen en el cáncer. Hipometilación global progresiva, demetilación de intrones, secuencias codificantes, elementos repetidos y pérdida de imprinting. Hipermetilación progresiva de islas CpG en promotores de genes supresores específicos y genes metastáticos. Modificaciones progresivas de las histonas (deacetilación). Además de Cambios prenatales, Enfermedades mentales y Enfermedades crónicas.
Los factores ambientales y el metabolismo aportan los “ladrillos” con los que trabajan los reguladores epigenéticos para garantizar el desarrollo y el funcionamiento de los organismos. Cuando los factores ambientales no son los “apropiados”, pueden inducir cambios no deseables en la expresión genética (dieta, tabaco, drogas, estrés, edad, contaminantes etc.). Plasticidad epigenética: cuando convergen la dieta, el metabolismo y la epigenética. El ácido fólico en la dieta puede condicionar la actividad de las DNA-metil-transferasas. La actividad de otros modificadores epigenéticos depende de la concentración local de metabolitos endógenos específicos como fuentes de acetilación de histonas (CoA-SH), deacetilación de histonas (NAD+^ ) o metilación. La epigenética puede ser heredable; por lo que los efectos de la nutrición, ejercicio, estrés, etc. son grandes factores a tener en cuenta.