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Asignatura: biologia, Profesor: Marga Marga, Carrera: Farmacia, Universidad: UCM
Tipo: Apuntes
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Es la totalidad de las transformaciones químicas que se producen en una célula o un organismo y que le permiten llevar a cabo sus funciones vitales.
El metabolismo de una célula consiste en miles de procesos químicos dispuestos en forma de vías metabólicas que se entrecruzan entre ellas. Una vía metabólica comienza con una molécula inicial (etapa I), que reacciona y se modifica con pequeños cambios químicos como la transferencia o adicción de átomos o grupos funcionales. Estos pasos intermedios se denominan reacciones secuenciales (etapa II) que finalmente darán lugar a un producto final (etapa III). Existen vías casi universales como la glucólisis o la respiración celular, y otras específicas.
Todos los procesos que tienen lugar en la célula necesitan la presencia de biocatalizadores, que se trata de enzimas , químicamente proteicas, que afectan a la velocidad de la reacción.
Las vías metabólicas se clasifican en dos grandes grupos: ▪ Catabólicas : se libera energía en la descomposición de moléculas más complejas para dar lugar a otras más simples. El conjunto de vías catabólicas constituye el catabolismo. Ej: respiración celular, la glucosa y otras moléculas se degradan en presencia de O 2 hasta convertirse en moléculas sencillas inorgánicas, como CO 2 y H 2 O. La energía liberada puede manifestarse en forma de calor, utilizarse para realizar un movimiento o almacenarse en forma de energía química (ATP). ▪ Anabólicas : consumen energía para construir moléculas complejas a partir de simples. El conjunto de vías anabólicas constituye el anabolismo. Se trata de reacciones de biosíntesis: Ej: proteínas a partir de aa, glucosa a partir de CO 2 y H 2 O. Ambos tipos de metabolismo se encuentran relacionados entre sí, ya que el catabolismo libera energía que se utilizará en el anabolismo, así como la liberación de la materia prima que participa en estos procesos. ▪ Anfibólicas : aquellas que participan tanto en anabolismo como en catabolismo. Ej: ciclo de Krebs, vía catabólica de oxidación de muchas moléculas. Algunos compuestos intermediarios conforman el punto de partida de rutas anabólicas o de biosíntesis.
■ Reacciones exergónicas y endergónicas.
■ ATP como acoplador entre las reacciones endergónicas y exergónicas. En los seres vivos las reacciones endergónicas se producen gracias a la energía liberada en las exergónicas, con las que están acopladas. El acoplamiento energético es el uso de un proceso exergónico para que se dé uno endergónico. El ATP es el responsable de mediar el acoplamiento energético de las células y casi siempre actúa como fuente inmediata de energía que impulsa el trabajo celular. ● Hidrólisis del ATP. El adenosin-5’-trifosfato desempeña un papel fundamental en las reacciones energéticas desfavorables, es decir, endergónicas, puesto que actúa como depósito de energía que almacena en los llamados enlaces de alta energía de sus fosfatos. Su hidrólisis desprende una gran cantidad de energía (7,3kcal/mol condiciones estándar). Este enlace no constituye un enlace fuerte, sino que se rompe fácilmente por lo que más bien es la molécula entera la que posee una alta energía. ATP + H 2 O → ADP + Pi (grupo fosfato) + 7,3 kcal/mol ∆G= -7,3 kcal/mol ATP + H 2 O → AMP + PPi (grupo pirofosfato) + 7,3 kcal/mol ∆G= -7,3 kcal/mol PPi + H 2 O → 2Pi + 7,3 kcal/mol ∆G= -7,3 kcal/mol De este modo, la variación total de energía libre que resulta de la hidrólisis del ATP a AMP es aproximadamente el doble de la obtenida en la hidrólisis del ATP al ADP. ● Regeneración o síntesis del ATP. Es una fuente de energía renovable capaz de regenerarse a partir de ADP y fosfato inorgánico. La energía libre para fosforilar el ADP proviene de las reacciones de degradación catabólica de la célula. ADP + Pi (grupo fosfato) + 7,3 kcal/mol → ATP + H 2 O ∆G= +7,3 kcal/mol ● Ciclo del ATP.
Acopla los procesos exergónicos con los endergónicos. Está formado por las reacciones de hidrólisis y regeneración del ATP, que actúan según las necesidades de la célula, y se desarrolla a un ritmo increíble. Una célula muscular recicla su ATP en menos de un minuto. La energía liberada en la hidrólisis del ATP tiene múltiples empleos: las reacciones endergónicas del anabolismo, la realización de un trabajo como la contracción muscular, la síntesis de compuestos, los movimientos celulares, la división celular… Además, parte de esta energía se desprende en forma de calor. La respiración celular es la vía catabólica principal que proporciona la energía para el proceso endergónico de síntesis del ATP. Así, las plantas utilizan energía lumínica para conseguirlo.
■ Reacciones redox. Las reacciones químicas son esencialmente transferencia de energía, donde los electrones pasan de un nivel de energía a otro. En las reacciones de oxidación-reducción pasan de un átomo o molécula a otro. Se denomina oxidación a la pérdida de electrones, por lo que la molécula o átomo se oxida. Es el agente reductor. Se denomina reducción a la ganancia de electrones, por lo que la molécula se reduce. Es el agente oxidante. La oxidación y la reducción siempre ocurren de forma simultánea, ya que los electrones de un átomo son cedidos a otro. A menudo, la oxidación se produce cuando al electrón le acompaña el protón, es decir, como átomo de hidrógeno. En ese caso, la oxidación es, además, una deshidrogenación e implica la eliminación de átomos de H. Por el contrario, la reducción supone una ganancia de átomos de hidrógeno.
■ Cofactores. Los cofactores son necesarios para ejercer la acción catalítica por parte de las enzimas. Algunos cofactores son simple iones inorgánicos metálicos (cationes). Cuando el cofactor es una molécula orgánica se denomina coenzima. La mayor parte de las vitaminas son parte de coenzimas importantes en el metabolismo celular. Algunas de estas funcionan como aceptores de electrones en reacciones redox. Además, los electrones suelen ir acompañados de protones y son transferidos a otra molécula. Es el caso del NAD+, el NADP+^ y FAD. Todos ellos son dinucleóticos. ● NAD+^ (nicotinamín-adenín-dinucleótido). Es una coenzima de enzimas deshidrogenasas con capacidad para aceptar los electrones y protones que le cede una sustancia que se oxida, y luego transferirlos a otro aceptor como ocurre en la cadena respiratoria. AH 2 + NAD+^ → A + NADH + H+^ enzima NAD+^ deshidrogenasa. ● NADP+^ (Nicotinamín-adenín-dinucleótido-fosfato). Coenzima en reacciones anabólicas como la fase lumínica de la fotosíntesis. Tiene la misma estructura química que la anterior, pero está fosforilado. Al captar protones y electrones, se transforma en la coenzima reducida NADPH + H+ ● FAD (Flavín-adenín-dinucleótido). Es una coenzima de enzimas deshidrogenasas y cumple una función semejante al NADP+. Integra la cadena de transferencia de electrones o cadena respiratoria. BH 2 + FAD → B + FADH 2 enzima FAD deshidrogenasa. ● Coenzima A. Sirve de transportador de grupos acetilo mediante un enlace tioéster (Con azufre), fácilmente transferible a otras moléculas. El resultado es la formación de acetil coenzima A, un intermediario muy importante del metabolismo. ● Coenzima Q o ubiquinona. Molécula liposoluble que se encuentra en la membrana interna mitocondrial y acepta electrones del complejo NAD+deshidrogenasa, para transformarse en la coenzima reducida CoQH 2 y acto seguido volver a oxidarse a través de la cesión de estos al complejo siguiente de la cadena respiratoria. ● Citocromos. Son proteínas que contienen Fe.
Todos los seres vivos requieren energía para realizar sus procesos vitales. La energía debe encontrarse en un estado aprovechable (química). Existen dos tipos de organismos:
El agua en estado líquido es un fluido cuyas moléculas se hallan en constante movimiento. El potencial hídrico Ψ , es la capacidad de las moléculas de agua para moverse en un sistema particular. Esta capacidad depende de la energía libre del agua. El Ψ es una medida de la energía libre del agua en dicho sistema, mide la presión (MPa=10bares). En el agua pura las moléculas se mueven libremente, por lo que hay mucha energía libre y es el estado de referencia del Ψ a una masa de H 2 O libre, sin interacciones con otro elemento y a una presión normal. Ψ = 0. El agua del suelo o de la planta se denomina agua ligada, y el potencial hídrigo depende de:
El Ψo representa el componente determinado por la presencia de solutos disueltos (efecto osmótico) en el agua pura el Ψo = 0. El Ψm representa el grado de retención del agua y viene dado por la presencia de matrices sólidas o coloidales. Tales matrices se constituyen del material coloidal del suelo y de las paredes celulares. En el citoplasma el agua es adsorbida en varias macromoléculas y coloides. Puede tener valores nulos o negativos. El Ψg representa la influencia del campo gravitatorio. El Ψp representa la presión ejercida por el protoplasto contra la pared celular. Puede asumir valores positivos (turgencia) o negativos (plasmólisis) así como nulos (plasmólisis ioncipiente). El agua se va a mover de forma espontanea de los lugares de mayor a menor potencial hídrico.
Hay dos tipos de movimiento del agua en la planta:
■ Absorción de agua y sales minerales por las raíces.
La raíz primaria tendrá un crecimiento indeterminado durante toda la vida de la planta, ya que nace directamente de la semilla. De ella surgen raíces secundarias que crecen entre 3 y 10 cm, denominadas raíces laterales, las cuales tienen una función muy importante en la absorción. La zona de máxima absorción es aquella en la que se encuentran los pelos absorbentes, zona de la raíz cercana a la región meristemática o apical (impermeable). Al agua y los iones entran en la planta debido a las diferencias de Ψ entre el suelo y esta. El agua entra por las raíces como respuesta a un gradiente de Ψ producido en el xilema, debido a la transpiración. Es agua se transportará de forma pasiva por las membranas.
De fuera a dentro, podemos encontrar diferentes tejidos en la planta. Primero estaría la epidermis y el parénquima cortical, con espacios intracelulares llenos de aire. Posteriormente encontramos la endodermis, células muy compactas donde se encuentra la banda de Caspary (modificación de la pared primaria de las células de dicha capa, que actúan como un depósito de suberina que impermeabiliza la célula, aunque tienen 4 caras libres). A continuación encontramos el periciclo, parecido al parénquima cortical. Despues ya tenemos los tejidos vasculares, floema en primer lugar, cambium y xilema en el centro.
Vías de transporte del agua y sales minerales desde el suelo hasta el xilema. ▪ Vía simplástica: el agua va de célula en célula a través de los plasmodesmos.
▪ Vía apoplástica: Se difunde libremente a través de los apoplastos, mojando las paredes y los espacios intracelulares sin llegar a entrar en las células vivas. Esta vía sólo es válida hasta la endodenrmis. Una vez en ella han de incorporarse a la vía simplástica, por lo que han de entrar en las células. El agua entra por las apoporinas (canales de naturaleza proteica: transporte pasivo). Los solutos entrans por los transportadores uniportes, sólo circulan en una dirección y los iones se dirigen hacia el xilema. El agua se puede mover libremente.
Una vez en el xilema el agua se mueve siguiendo diferencias de potencial hídrico hasta llegar a las hojas. La fuerza que produce la variación de Ψ entre la raíz y las hojas es la transpiración. Se pierde agua en forma de vapor por los estomas, en el mesófilo esponjoso se produce el vapor de agua que se pierde por los estomas. Como consecuencia de la pérdida de vapor de agua, el Ψ disminuye en la epidermis de la hoja. Se crea un gradiente de concentración donde el Ψ del mesófilo es mayor que el de los estomas, por lo que el agua del mesófilo se desplaza hacia el lugar de menor potencial hídrico, disminuyendo entonces éste en el mesófilo. Entonces al agua del xilema tenderá a ir hacia éste. Esto se puede explicar por la teoría de tensión-cohesión. En tubos estrechos y con paredes capaces de humedecerse, el agua se comporta como un conjunto de moléculas unidas entre sí y a las paredes. Al aplicar una tensión en uno de los extremos del cilindro, esta se transmite por toda la columna de agua moviéndose al extremo en el que se realiza la tensión. El agua se mueve en columna, Se produce por ello una disminución de Ψ en la parte inferior del xilema, próxima a la raíz. Entonces también hay una caída de Ψ en la raíz y entra el agua. La transpiración ejerce la fuerza de tensión.