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Orientación Universidad
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practica 9 arbol, Ejercicios de Biología

Asignatura: Arbol de la vida, Profesor: Fernando González, Carrera: Biologia, Universidad: UV

Tipo: Ejercicios

2014/2015

Subido el 22/05/2015

davidruiz1996
davidruiz1996 🇪🇸

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Práctica 9:
Matriz de distancias utilizando Jukes-Cantor y Reconstrucción
filogenética por UPGMA y NJ
Title: Matriz distancias
Description
No. of Taxa : 6
Data File : C:\Documents and Settings\fbiolo2\Escritorio\alineamento.meg
Data Title : datatata
Data Type : Nucleotide (Coding)
Analysis : Pairwise distance calculation
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DAVID RUIZ GARCÍA
1ºBIOLOGIA B-L1
pf3

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Práctica 9:

Matriz de distancias utilizando Jukes-Cantor y Reconstrucción

filogenética por UPGMA y NJ

Title: Matriz distancias Description No. of Taxa : 6 Data File : C:\Documents and Settings\fbiolo2\Escritorio\alineamento.meg Data Title : datatata Data Type : Nucleotide (Coding) Analysis : Pairwise distance calculation ->Compute : Distances only Include Sites : ============================== ->Gaps/Missing Data : Complete Deletion ->Codon Positions : 1st+2nd+3rd+Noncoding Substitution Model : ============================== ->Model : Nucleotide: Jukes-Cantor ->Substitutions to Include : All ->Pattern among Lineages : Same (Homogeneous) ->Rates among sites : Uniform rates No. of Sites : 999 d : Estimate

[1] #gi|195954325|gb|EU870495.1|Dipturus...

1ºBIOLOGIA B-L

[2] #gi|5835065:1-1191_Petromyzon_marinus_... [3] #gi|161333791:14383-15523_Salmo_trutta... [4] #gi|56692312:14432-15571_Anguilla_angu... [5] #gi|40641820:3-1143_Acipenser_sturio_m... [6] #gi|90103175|gb|DQ422097.1|_Mustelus_m...

Matriz:

[ 1 2 3 4 5 6 ]

[1]

[2] 0.

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[4] 0.329 0.427 0.

[5] 0.318 0.427 0.287 0.

[6] 0.306 0.468 0.311 0.343 0.

Arboles Filogenéticos:

UPGMA

NJ

INTERPRETACIÓN

1ºBIOLOGIA B-L