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Asignatura: Bioquímica, Profesor: María Teresa Portolés, Carrera: Biología, Universidad: UCM
Tipo: Apuntes
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Aspectos a considerar
La existencia de compartimentos hace que las enzimas que sintetizan y degradan un compuesto estén en lugares distintos rutas metabólicas contrarias.
La concentración de cada enzima no es la misma; es la que necesita la célula para que la reacción catalice a la velocidad adecuada. Enzimas constitutivas (a la misma concentración siempre, las del ciclo de Krebbs), e inducibles (su síntesis se induce cuando la célula lo necesita).
La manera más rápida de controlar una enzima, es controlando su actividad, no su síntesis o degradación.
ALOSTERISMO
La representación de la velocidad inicial frente a la concentración de sustrato es una curva sigmoidea. Son mucho más sensibles, y son fundamentales en el metabolismo.
El comportamiento sigmoideo permite que pequeños cambios en la concentración de sustrato supongan grandes cambios en la velocidad. Por otra parte, en las enzimas alostéricas la presencia de pequeñas cantidades de un efector alostérico produce también grandes cambios en su actividad.
Los inhibidores alostéricos tienen un papel modulador, a los cuales también son sensibles este tipo de enzimas.
EQUILIBRIO POLIMERIZACIÓN/DESPOLIMERIZACIÓN
Están favorecidos o desfavorecidos según las condiciones que haya en el entorno. La acetil-CoA carboxilasa se activa por polimerización, y es fundamental en la síntesis de lípidos. Esta polimerización está favorecida por la presencia de citrato: a altas concentraciones del mismo, la célula la sintetiza.
MODIFICACIÓN COVALENTE REVERSIBLE.
Consiste en la introducción covalente de un grupo (generalmente fosfato) en uno o varios aminoácidos de la enzima. Esta modificación produce la activación o la inactivación de la enzima. El grupo fosfato se suele introducir en serina, treonina o tirosina. Su introducción hace que la enzima se inactive o se active.
La introducción de los grupos fosfato se produce a partir del ATP, y las enzimas que catalizan esta reacción se llaman proteína-quinasas. Que sea reversible significa que se puede eliminar el grupo fosfato por parte de una proteína fosfatasa.
La acetilación también es un ejemplo de modificación reversible covalente.
Activación de zimógenos (proteolisis irreversible).
Tiene lugar en enzimas muy agresivas, que pueden resultar perjudiciales para las células que las producen, interesa que se activen sólo al llegar al lugar dónde tienen que actuar. Por ejemplo las
enzimas digestivas son sintetizadas en el páncreas, pero no interesa que tengan actividad en las células pancreáticas, sino en el tracto gastro-intestinal.
Por tanto, son secretadas como precursores inactivos zimógeno. Se van a activar por proteólisis, es decir, por ruptura de determinados enlaces en su molécula.
Afecta a enzimas digestivas y a factores de coagulación.
La activación de los zimógenos la lleva a cabo la tripsina, incluso sobre su propio zimógeno. La enteropeptidasa es una proteasa que se forma en las células de la mucosa gastro-intestinal, y es la encargada de empezar la activación de zimógenos.
EJEMPLO DEL QUIMOTRIPSINÓGENO. Tiene una única cadena con 245 aa. Cuando llega al tracto gastrointestinal (dónde actúa), la tripsina rompe el aminoácido, dando lugar a la π-quimotripsina, que actúa sobre sí misma, dando lugar a dos dipéptidos. Resulta de ello, tres cadenas que permanecen asociadas, y se denomina α-quimotripsina.
La rotura de enlaces específicos conduce a cambios conformacionales que activan a las enzimas.
EXISTENCIA DE ISOENZIMAS. Diferentes formas de una misma actividad enzimática. Van a presentar diferente afinidad por los sustratos. Pueden estar reguladas de manera diferente. Van a estar codificadas por genes diferentes. Se van a expresar en diferente proporción en los distintos tejidos.
La existencia de isoenzimas permite el funcionamiento integrado del organismo, ya que permite la existencia de diferentes perfiles metabólicos en los distintos órganos y la colaboración entre órganos.
lactato deshidrogenasa Existen 5 isoenzimas de la LDH (tetrámero): H4, H3M, H2M2, HM3, M4.
La H4 (en el corazón), cataliza siempre el paso lactato piruvato. Evita la acumulación de lactato en el corazón.
La M4 tiene un comportamiento distinto en el músculo y en el hígado.
Es muy sensible a la relación NAD+^ /NADH. En el músculo los niveles de NADH van a ser más elevados, y la isoenzima utiliza este exceso para transformar el piruvato en lactato. En el hígado hay menos NADH que en el músculo, de ahí que se de la reacción inversa.
Es importante en el ciclo de Cori.