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Asignatura: Fisologia Vegetal, Profesor: ... sabe dios, Carrera: Biología, Universidad: USC
Tipo: Apuntes
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Los genes inducidos por auxinas pueden agruparse en dos grandes categorías: los genes de respuesta temprana y los genes de respuesta tardía. La inducción de los genes de respuesta temprana no necesita síntesis de proteínas y por lo tanto es insensible a los inhibidores de dicha síntesis. Los genes de respuesta temprana se dividen en tres grupos atendiendo a su función: expresión de genes de respuesta tardía (genes de respuesta secundaria), adaptación al estrés y señalización intracelular. Los dominios de respuesta a la auxina de los promotores de los genes de respuesta temprana están formados por una estructura compuesta en la que los elementos de respuesta a auxinas están combinados con un elemento de respuesta constitutiva. Los genes inducidos por auxinas pueden estar regulados negativamente por proteínas represoras que son degradadas a través de la activación de una ruta de ubiquitinación.
Una subunidad de la E3 ubiquitin-ligasa actúa como receptor de auxinas
Los receptores de auxina principales han sido identificadas como "F-box" proteínas solubles pertenecientes a la familia TIR1 / AFB de las proteínas. F-box son proteínas de alrededor de 50 aa de largo que funcionan como lugares de interacción proteína-proteína. F-box proteínas fueron descubiertas por primera vez como subunidades de un tipo específico de complejo de ubiquitina E3 ligasa, denominado SCF. Los complejos SCF catalizan la adicción covalente de moléculas de ubiquitina a proteínas específicas para la degradación proteolítica.
La función primaria de la proteína F-box en el complejo SCF es unir los sustratos para la proteólisis mediada por ubiquitina. Para llevar a cabo esta función, las F-box típicamente tienen motivos adicionales además de la F-box que promueven la interacción proteína-proteína. El motivo de la proteína F-box en sí sirve para enlazar la proteína F-box a las otras subunidades del complejo SCF.
TIR1 (una proteína de la F-box) parecía ser esencial en el alargamiento del hipocotilo. TIR1 es un componente de un complejo de ubiquitina ligasa E3 específica, designado como SCFTIR que se requiere para señalización mediada por auxinas en las células. La función de los complejos SCFTIR1 es etiquetar los reguladores de la transcripción de expresión constitutiva de genes inducidos por auxinas con cadenas de proteínas ubiquitina, centrándose así en ellos para degradación por el proteosoma. El regulador se denominan proteínas AUX / IAA.
La proteína TIR1 se une directamente a la auxina y la unión a TIR1-auxina promueve la asociación de la proteína con el complejo SCDTIR1 AUX / IAA. Hasta ahora, también se han mostrado tres proteínas F-box relacionadas con TIR1 y tienen actividad de receptor de auxina. Estas proteínas se llaman proteínas de señalización de auxina F-box (AFBs) y funcionan en complejos de ubiquitina E3 ligase.
La unión de SCF TIR1 a auxina estimula la destrucción AUX / IAA.
La corta vía de señalización responsable de la expresión génica inducida por la auxina comienza con la unión de la auxina a la subunidad TIR1 del complejo de ubiquitina ligasa SCFTIR1. La unión de la auxina a TIR1 induce una modificación de la conformación en SCFTIR1 y produce la dimerización del mismo con AUX/IAA y activa la actividad ligasa E3. Complejo SCFTIR se activa por la auxina. Como consecuencia, las proteínas AUX / IAA se ubiquitinan rápidamente y luego van a ser hidrolizadas a través de la proteosoma. En la ausencia de sus reguladores negativos, proteínas ARF estimulan o reprimen expresión gen, dependiendo del ARF.
Una de las funciones importantes de la ruta de transducción de señales iniciadas cuando las auxinas se unen a su receptor es la activación de un grupo determinado de factores de transcripción. Los factores de transcripción activados entran en el núcleo y promueven la expresión de genes específicos. Los genes cuya expresión se ve estimulada por la activación de
factores de transcripción preexistentes se denominan genes de respuesta primaria o genes de respuesta temprana. Esta definición implica que todas las proteínas necesarias en la expresión de los genes de respuesta temprana inducidos por auxina están presenten en la célula en el momento de su exposición a la hormona; así, la expresión de los genes de respuesta temprana no puede verse bloqueada por inhibidores de la síntesis de proteínas. Los genes de respuesta primaria tienen tres funciones pero la principal es la de activar genes de respuesta secundaria o genes de respuesta tardía.
Se han identificado cinco clases principales de genes con respuesta a auxinas:
Los genes de respuesta temprana del crecimiento y desarrollo: los miembros de la familia génica AUX/IAA codifican unos factores de transcripción de vida corta que funcionan como represores o activadores de los genes tardíos inducibles por auxinas. La expresión de la mayoría de los genes de la familia AUX/IAA se estimula por auxinas. Todos los genes codifican pequeños polipéptidos que tienen motivos de unión al ADN.
Los dominios de respuesta a auxinas son estructuras compuestas: un elemento de respuesta a auxinas (AuxRE) conservado en los genes de respuesta temprana a auxina, normalmente está combinado con otros elementos de respuesta y formar dominios de respuesta a auxinas (AuxRD).
Los genes de respuesta temprana a auxinas están regulados por factores de respuesta a auxinas: los genes de respuesta temprana a auxinas son insensibles a inhibidores de la síntesis de proteínas. Una familia de receptores de respuesta a auxinas (ARF) funciona como activadores transcripcionales por la unión al elemento de respuesta a auxinas TGTCTC que está presente en el promotor, Las mutaciones en los genes ARF dan lugar a graves defectos en el desarrollo. Para unirse a AuxRE establemente, los ARF deben formar dímeros. Se ha propuesto que los dímeros AFR promueven la transcripción al unirse a dos AuxRE ordenados en un palíndromo.
Estudios recientes indican que las proteínas codificadas por la familia génica AUX/IAA pueden inhibir la transcripción de los genes de respuesta temprana a auxinas por formación de heterodímeros inactivos con ARF. Estos heterodímeros inactivos pueden actuar inhibiendo la unión ARF-AUXRE y bloquear, por tanto, bien la activación o bien la represión del gen. Las proteínas AUX/IAA pueden, así, actuar como inhibidores de ARF.
Actualmente se cree que las auxinas inducen la transcripción de los genes de respuesta temprana promoviendo la degradación proteolítica de las proteínas inhibidoras AUX/IAA, de manera que se puedan forman dímeros ARF activos. En este proceso están implicados la ubiquitinación y la proteólisis por el complejo del proteosoma 26S. Obsérvese que en la ruta se introduce un bucle de retroalimentación negativa dado que una de las familias génicas cuyo recambio provocan las auxinas es AUX/IAA, que inhibe la respuesta.
La ABP1 funciona como receptores de auxinas: la proteína de unión de auxina ABP1 parece funcionar como un receptor de auxina en la ruta de transducción de señales. Este receptor está relacionad con la respuesta rápida a auxinas y está relacionada con la activación H+-ATPasa.