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Tipologia: Exercícios
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Parcimônia Agora vamos construir uma hipótese de relacionamento entre as máscaras usando os mesmos dois métodos de reconstrução filogenética do exemplo. O primeiro passo é a construção de uma matriz de caracteres. Para isto faça um quadro com todas as seis máscaras, selecione as características a serem usadas e determine seus estados. Por exemplo, na matriz de camináculos, a linha 1 mostra um caráter (número de patas traseiras) com dois estados (uma pata ou duas patas) que variam de acordo com o camináculo estudado. Na segunda linha, vemos o caráter (presença de mãos) com dois estados (presença e ausência). Agora faça uma matriz semelhante para as seis máscaras. Lembre-se que você precisa de 10 caracteres, e pelo menos três destes informativos para o método de parcimônia. Para sabermos se o caráter é informativo ou não existem duas regras básicas: 1) Devem existir pelo menos dois estados e 2) Cada um dos dois estados devem estar presentes em pelo menos dois indivíduos. Para reconstrução da árvore filogenética, iremos selecionar apenas quatro máscaras (3, 4, 5 e 6), com o objetivo de facilitar o cálculo. Entretanto, lembre-se que os três caracteres informativos devem continuar a obedecer as duas regras mesmo com a matriz reduzida para apenas quatro máscaras. 1 2 3 4 5 A) No. Patas traseiras Uma Duas Duas Uma Duas B) Mãos Não Sim Sim Sim Não Em seguida, iremos para a análise filogenética propriamente dita. Vamos continuar no caso dos camináculos até a escolha da árvore filogenética. Também para facilitar, diminuindo o número de árvores, vamos eliminar o camináculo número dois e nossa matriz fica com dois caracteres para quatro camináculos. Repare que ainda assim, a matriz apresenta dois caracteres informativos para parcimônia, pois obedecem aos dois critérios listados na outra folha. 1 3 4 5 A) No. Patas traseiras Uma Duas Uma Duas B) Mãos Não Sim Sim Não Agora vamos passar para o mapeamento desses dois caracteres em cada uma das três árvores possíveis. Caráter A
Repare que, para esse caráter, a árvore que melhor explica (=árvore mais parcimoniosa) é a árvore 3 que requer apenas uma mudança (=passo), enquanto as outras duas árvores possíveis necessitam de duas mudanças, como você pode ver na. Repare que a árvore de máxima parcimônia é sempre aquela que une os dois camináculos que apresentam o mesmo estado para o caráter. Caráter B Nesse caráter B, a árvore mais parcimoniosa é a 1, pois uma única mudança explica perfeitamente a evolução desse caráter. Árvore de Parcimônia Como nesse caso temos apenas dois caracteres, iremos juntar as informações que os dois apresentam, somando todos os passos para cada uma delas. Na terceira linha, temos duas árvores ( e 3) com o menor número de passos (3). Portanto, nesse caso temos duas árvores de máxima parcimônia que são a árvore 1 e a árvore 3. Caráter A Caráter B Número total de passos da árvore
Voltando ao caso das máscaras, para a analise de parcimônia serão usadas apenas quatro máscaras, são elas: 3, 4, 5 e 6. Depois de construir a matriz de caracteres, como já foi descrito, utilize o quadro abaixo para indicar nas três árvores possíveis [Árvore 1 = máscara 3 junta com máscara 4; Árvore 2 = máscara 3 junta com máscara 5; ou Árvore 3 = máscara 3 junta com máscara 6] a presença dos caracteres que você criou nas máscaras determinadas, da mesma forma. Para cada caráter, some o número total de passos (=mudanças de um estado para outro) e, em seguida, some o total dos totais para cada uma das árvores. No final, você deve somar todos os estados de caráter de cada coluna que representa uma árvore. Finalmente, iremos escolher a(s) árvore(s) com menor número total de passos, como foi mostrado no caso dos camináculos.