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Metabolismo vegetal, Apuntes de Biotecnología

Asignatura: Metabolisme, Profesor: montserrat busqueta, Carrera: Biotecnologia, Universidad: UB

Tipo: Apuntes

2013/2014

Subido el 30/01/2014

alicia_herzog
alicia_herzog 🇪🇸

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estamos en las mitocondrias, n los cloroplastos.en tilacoides se obtiene ATP y NADPH asta el
c.se obtienen triosas fosfatos, a aprtir de las cuales obtenemos acetilcoa, que va a mitoc por
transporte de acetato o con la molecula..
se puede sintetizar por la via glucolitica pyr a partir de acetilcoa.dnd ay tmb una pyr
deshidrogenasa(esto en cloroplasto). ace acetilcoa con pyr de la glucolisis del cloroplasto¿xa
q?xa utilizarlo posteriormente a la sintesis de ac grasos y tmb ira a mitocndria con los
transportadores.podemos tener por tanto precursores x el acetil coa en la mitocondria o obtener
acidos grasos en el cloroplasto.la energia y poder reductor a partir de la fotosintesis, y
precursores a partir de la prituvato deshidrogenasa del cloroplasto o a partir del acetilcoa
procedente de la mitocondria.llas enzimas necesarias bien la acido graso sintasa que hace casi
todo el acido graso, y la acetilcoa carboxilasa que hace una sola reaccion,en sintesis de
a.grasos.la acetilcoa carboxilasa:el acetilcoa se transforma en una molecula de malonilcoa.el
malonil coa:la acetilcoacarboxilasa hace carboxilacion el acetilcoa para formar malonilcoa a aprtir
de ATP formando ADP y fosfato.la malonilcoa sirve a la acido graso sintasa para hacer palmitico.
las animales llegan a 16carbonos. el acido oleico tiene18 y doble enlace. hay la enzima
desaturasa que hace el doble enlace en el oleico.la tioesterasa rompe el enlace en la formacion
de acidos grasos.no se ve etiqueta coa sino ACP.en reacciones esta unido a coa, en cloroplastos
tiene etiqueta ACP.cuando sale del cloroplasto tienen etiqueta coa pero dentro no.ACP es una
etiqueta que forma parte de la acido graso sintasa, que durante la sintesis de acidos grasos sale
de la acido graso sintasa.es un sistema modular la acido graso sintasa:tiene varios lugares de
reaccion.
Viernes14sem
si una cel debe sintetizar un compuesto como un acdio graso, sus reqerimentos son iguales si es
planta o veg.normalmente son de 16 o 18 c.si los vamos a sintetizar seran precursores
acetilcoa.se usan los 2 c del acetato. se unen estas moleculas aciendo enlaces nuevos con
energia con ATP.muchas de la reaccion de sintesis dan como primera molecula una molecula
mas oxidadas y se reducen, cosa que pasa en anabolismo, para lo cual necesitamos poder
reductor NADPH.tmb se regula esta via de sintesis(como todas) de ac.grasos, que son 2 la
acetilcoa caerboxilasa y la acetilcoa sintasa.en veg se ace en cloroplastos o en general en
plastidios mientras que en animales es una via citosooolica.el acetil coa puede venir del
cloroplasto de fotosintesis de triosas con la pyr desidrog cloroplastodica o bien la que viene de
las mitocondrias.nunca encuentras los ac.grasos sultos.suempre unidos bien a un coa o bien x
enlace ester a glcierol.
ACP es uno de los componentes de la acido graso sintasa. esto es debido a la diff de citas de las
enzimas, respecto a la citosolica y cloroplastidica.de acetilcoa a malonil coa x la carboxilasa.
substratos:co2 en agua esta en bicarbonato.el co2 se une a una parte de la enzima carboxilasa,
formandose un enlace entre el carboxilado y esta molecula, a traves de rotura de ATP a ADP y
Pi.despues se transfiere el carboxilado al acetilcoa.
primera etapa:transferencia del CO2 desde el bicarbonato a la enzima, que es un intermediario,
y despues desde este intermediario, se transferia al acetilcoa.por tanto primero hay una
carboxilacion y despues la transferencia.
la acetilcoa carboxilasa contiene diferentes dominios en su estructura con diferentes funciones,
entre las cuales hay::::
biotina:esta enlazada en un residuo de la enzima.cataliza la union del CO2(del bicarbonato del
medio pq nunca esta el co2suelto) sobre la biotina(reaccion biotina carboxilasa). Una vez
formado el intermediario de carboxibiotina, hay un cambio de la estructura y hay actividad
carboxiltransferasa,donde se transfiere el carboxil desde la carboxibiotina al acetilcoa, formando
el malonilcoa.
¿como se organiza esta enzima en animales y en vegetales?hay una parte comun o similar.si las
diff son las diferentes subunidades que contienen.ls citas son iguales porque los cloroplastos son
endosimbiontes.para la acido graso sintasa tambien son muy similares, hacen la misma cosa,
alargar la cadena con el malonilcoa.
toda la energia que se consume en la formacion de acidos grasos se utiliza en el momento de
hacer el enlace del esquema.en la reaccion de la acetilcoa carboxilasa, de carboxilacion de la
biotica(biotina carboxilasa).cada 2c que se utilizan para acer acido graso, debe hacerse el
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estamos en las mitocondrias, n los cloroplastos.en tilacoides se obtiene ATP y NADPH asta el c.se obtienen triosas fosfatos, a aprtir de las cuales obtenemos acetilcoa, que va a mitoc por transporte de acetato o con la molecula.. se puede sintetizar por la via glucolitica pyr a partir de acetilcoa.dnd ay tmb una pyr deshidrogenasa(esto en cloroplasto). ace acetilcoa con pyr de la glucolisis del cloroplasto¿xa q?xa utilizarlo posteriormente a la sintesis de ac grasos y tmb ira a mitocndria con los transportadores.podemos tener por tanto precursores x el acetil coa en la mitocondria o obtener acidos grasos en el cloroplasto.la energia y poder reductor a partir de la fotosintesis, y precursores a partir de la prituvato deshidrogenasa del cloroplasto o a partir del acetilcoa procedente de la mitocondria.llas enzimas necesarias bien la acido graso sintasa que hace casi todo el acido graso, y la acetilcoa carboxilasa que hace una sola reaccion,en sintesis de a.grasos.la acetilcoa carboxilasa:el acetilcoa se transforma en una molecula de malonilcoa.el malonil coa:la acetilcoacarboxilasa hace carboxilacion el acetilcoa para formar malonilcoa a aprtir de ATP formando ADP y fosfato.la malonilcoa sirve a la acido graso sintasa para hacer palmitico. las animales llegan a 16carbonos. el acido oleico tiene18 y doble enlace. hay la enzima desaturasa que hace el doble enlace en el oleico.la tioesterasa rompe el enlace en la formacion de acidos grasos.no se ve etiqueta coa sino ACP.en reacciones esta unido a coa, en cloroplastos tiene etiqueta ACP.cuando sale del cloroplasto tienen etiqueta coa pero dentro no.ACP es una etiqueta que forma parte de la acido graso sintasa, que durante la sintesis de acidos grasos sale de la acido graso sintasa.es un sistema modular la acido graso sintasa:tiene varios lugares de reaccion.

Viernes14sem

si una cel debe sintetizar un compuesto como un acdio graso, sus reqerimentos son iguales si es planta o veg.normalmente son de 16 o 18 c.si los vamos a sintetizar seran precursores acetilcoa.se usan los 2 c del acetato. se unen estas moleculas aciendo enlaces nuevos con energia con ATP.muchas de la reaccion de sintesis dan como primera molecula una molecula mas oxidadas y se reducen, cosa que pasa en anabolismo, para lo cual necesitamos poder reductor NADPH.tmb se regula esta via de sintesis(como todas) de ac.grasos, que son 2 la acetilcoa caerboxilasa y la acetilcoa sintasa.en veg se ace en cloroplastos o en general en plastidios mientras que en animales es una via citosooolica.el acetil coa puede venir del cloroplasto de fotosintesis de triosas con la pyr desidrog cloroplastodica o bien la que viene de las mitocondrias.nunca encuentras los ac.grasos sultos.suempre unidos bien a un coa o bien x enlace ester a glcierol. ACP es uno de los componentes de la acido graso sintasa. esto es debido a la diff de citas de las enzimas, respecto a la citosolica y cloroplastidica.de acetilcoa a malonil coa x la carboxilasa. substratos:co2 en agua esta en bicarbonato.el co2 se une a una parte de la enzima carboxilasa, formandose un enlace entre el carboxilado y esta molecula, a traves de rotura de ATP a ADP y Pi.despues se transfiere el carboxilado al acetilcoa. primera etapa:transferencia del CO2 desde el bicarbonato a la enzima, que es un intermediario, y despues desde este intermediario, se transferia al acetilcoa.por tanto primero hay una carboxilacion y despues la transferencia. la acetilcoa carboxilasa contiene diferentes dominios en su estructura con diferentes funciones, entre las cuales hay:::: biotina:esta enlazada en un residuo de la enzima.cataliza la union del CO2(del bicarbonato del medio pq nunca esta el co2suelto) sobre la biotina(reaccion biotina carboxilasa). Una vez formado el intermediario de carboxibiotina, hay un cambio de la estructura y hay actividad carboxiltransferasa,donde se transfiere el carboxil desde la carboxibiotina al acetilcoa, formando el malonilcoa. ¿como se organiza esta enzima en animales y en vegetales?hay una parte comun o similar.si las diff son las diferentes subunidades que contienen.ls citas son iguales porque los cloroplastos son endosimbiontes.para la acido graso sintasa tambien son muy similares, hacen la misma cosa, alargar la cadena con el malonilcoa. toda la energia que se consume en la formacion de acidos grasos se utiliza en el momento de hacer el enlace del esquema.en la reaccion de la acetilcoa carboxilasa, de carboxilacion de la biotica(biotina carboxilasa).cada 2c que se utilizan para acer acido graso, debe hacerse el

malonilcoa que es lo que gasta energia.la acido graso sintasa la vemos aora, que hace el resto de las reacciones.la acido graso sintasa de los animales es un dimero q cada subunidad ace las mismas actividades o funciones y reacciones.en animales todas las funciones la acen la misma proteina. en veg es como la carboxilasa, en la que cada una de sus subunidades que tiene la proteina es independiente en cuanto a la reaccion que hace con su correcpondiente actividad o funcion.una de ellas tieen una estructura modular en forma de diffs subunidades , y la otra tiene una unica cadena con diffs zonas que hacen las difs actividades.los acidos grasos nunca estan libres.normalmente son acilcoa. pero aqui vemos unido a ACP.¿que es el ACP?es un componente de la acido graso sintasa, que unido con un aa de esta proteina, una ser, es una cadena que es casi igual a un brazo de coa, y funcionalmente es igual.todos los intermediarios durante la sintesis de un ac.graso estara unido a ACP tmb con un grupo tiol, igual que como era el coa. reacciones de acidograsosintasa.esta la acido graso sintasa con ACP en medio, en su brazo.esquema global de la reacciones de acido graso sintasa, primero entra a partir de la molecula de acetilcoa se une con este tiol de la subunidad KAS(es una subunidad de la acidograso sintasa.(que aora veremos que es),y tenemos aora los 2c unidos sobre esta subunidad.aora lo que hacemos ...fijaros solo en el esquema de izda...desde el malonil coa se transfiere 3 carbonos de este malonil al acetil .En la segunta etapa, los 2carbonos iniciales se unen con 2 carbonos del malonil y sale CO2 del malonilcoa, utilizandose esta energia de esta enlace que estaba para carboxilar el malonil coa teniendo un intermediario aora de 4 C. la idea es que reduciremos este co a ch2 haciendo una beta reduccion(inversa de lo que se gace en la beta oxidacion). resumen:entrada de acetil en la subunidad KS.una segunda entrada de carbonos del malonil sobre la cadena del ACP.la union de las 2 moleculas, y la salida de co2.tenemos un intermediario de 4c que esta oxidado.aora hacemos unas etapas en las que utilizaremos NADPH como poder reductor, haremos reducciones mediante el NADPH.esto es igual que los animales.1rosintetizamos malonilcoa2transferir malonilcoa3reducir xa alargar la cadena de a graso. diff:la subunidad KAS, tambien llamada 3oxoacilACPsintasa.esta subunidad KAS de la enzima acidograso sintasa une dos carbonos del malonil con dos carbonos del acetil, pero tmb cuando tenemos el acido graso de 4 carbonos,añadimos una moleculas segunda de malonil uniendo dos carbonos del malonil con otra molecula de malonil, quedando asi un intermediario de 6c.quedando ya todo con ch2-ch2-- con esta KAS.estos son reducciones que se hacen con NADPH.son iguales que en animales en cuanto a hidratacion,reduccion,hidratacion,reduccion.. recuerda que en las reacciones hay malonil unido a ACP y el acetil esta unido a KAS.No hay un solo tipo de subunidad KS en la acidograso sintasa, hay 3subunidades diff. Pueden llegar a acidos de 16 o de 18C durante la sintesis de acidos grasos.Siempre unnidas a la ACP.Si pensamos en la animal, acaba siempre en palmitico de 16 siemrpe.pero las veg pueden llegar a 18.¿pq?la etapa que hace la KAS.Hace que dos c del malonilACP + la cadena del acido graso,de manera que queda coKASch2co-cadena y co2 cuya energia del co2 se gasta en la union de este enlace es "la etapa de condensacion".(ks=kas).Hay 3tipos de subunidad.Se diff en la longitud que tiene la cadena del acido graso.de manera que cuando la longitud de la cadena es de 2c hay una que funciona y cuando hay entre4 y 14 la otra y cuando la long es de 16 actua otra.son KAS I KAS II y KASIII.todas permiten el alargamiento de la cadena y formar el intermediario por condensacion.pero el producto que dan tienen diff long. el echo de que aya este KASII permite que se forme una de 18c.porque permite hacer una de 18 a partir de una de 16.hay 3 isoenzimas de la enzima de la condensante que hacen condensacion, con diff especificidad de substrato segun la long de la cadena.el intermediario de 18c puede darse con KASII y llegar a ser un acido estearico de 18.si las queremos hacer mas largas todavia aria falta de otras enzimas que se llaman elongasa. una de las mas frecuentes y mas importante es la formacion de un doble enlace por insaturacion entre el 9 y el 10 x la delta9desaturasa, la sacaroildelta9desaturada, que sintetiza acido oleico, el acido palmitico y el estearico pueden formar parte de los lipidos del propio cloroplasto o pueden ser liberados xa sintetizar el resto de lipidos de la cel.el oleico y estearico es muy abundante e importante en plantas.necesitamos por tanto energia poder reductor precursores y enzimas.la diff importantisima es a nivel del KAS.

martes15sem

tanto el licopeno, como el beta-caroteno, como la vioxalantina son isoprenoides. se ve la foto de la clorofila la parte derecha es isoprenoide, lo demas no.es para ver que no toda la molecula es isoprenoide, solo una parte.la plastoqinona es met primario isoprenoide. colesterol, es un isoprenoide.las plantas no hacen colecsterol, hacen esteroles, fitoesteroles concretamente.emos visto que hay diff moleculas de diff tamaños de carbonos y estructuras,y todas pertenecen al mismo grupo, del met primario no esencial.otro ejemplo es la Nglicosilacion, se ve una proteina que se esta sintetizando, se ve esquema de RE.ace una transfeencia sobre esta estructura rica en manosa sobre esta posicion.xa acer esta transferencia primero hay que sintetizar una molecula portadora, un isoprenoide que es el dolicol, que pertenece al met primario.las hormonas veg tmb son met primarios,casi todas isoprenoides.muchas son proteinas de membranas como las proteinas preniladas.

viernes15sem

los isoprenoides ay mas de 30000diffs.algunos de estos compuestos forman parte de los metabolitos primarios esenciales como ubiquinona, colesterol, o las hormonas vegetales. isoprenoides secundarios, ejemplos:elementos volatiles, como la menta, el limoleno. el ejemplo mas sencillo de todos es el isoprenoide, que deriva del isopreno, que es un gas, producto que generan las plantas.que permite adaptarse a cambios de temperatura.formado el isopreno por 5 c. sotod los organismos TODOS sintetizan isoprenoides.como molecula modelo es el colesterol. ¿como se hacen los isoprenoides?con precursores:moleculas de 5c, y a partir de ellas se pueden obtener multiplos de 5.de 10,de15,de20...el colecterol por ejemplo es de 30. hay que sintetizar los precursores y a partir de aqui el compuesto que se desea.por ejemplo el caucho empieza aqui pero despues una via concreta y propia. 1ra fase crear los precursores.2da fase:crear los intermediarios del tamaño deseado y para acabar, las reaccciones especificas para cada producto concreto que se sintetiza. todos tienen un numero de carbonos multiplo de 5, cita en comun de todas las estructuras de productos naturales.es la "regla biogenetica del isopreno"los pigmentos siempre tienen 40 carbonos(mas 8 extra), el colesterol....y todas ellas tienen el precursor comun que es una molecula de 5 c.Se creia el isopreno, pero no, es una forma fosforilada del isopreno, que es el isopentenil difosfato, y hay otra mas.Son la IPP y el DMAPP(dimetilalildifosfato). El IPP es similar al DMAPP, cambian en un doble enlace. se pueden clasificar pòr el numero de carbonos. 5 hemiterpenos,10 monoterpenos, 20 di 30 tri y 40 tetra y mayor politerpenos.hay esquema con numero de carbonos de algunos de los compuestos. Reacciones del tronco.¿como se sintetizan los precursores?por dos vias diff.los humanos lo hacen de una manera, las bacterias de otra y los veg de 2. via del mevalonato es la mas abitual que la tenemos los humanos, la via del MEP las bacterias. vegs ace parte de los precursores por la via del mevalonato y por la del MEP, pero los productos de reacc especificas las hacen bien en cloroplasto como x ej las clorofilas y otra parte de los productos finales los hara fuera del cloroplasto(diff localizacion).La via del mevalonato hace IPP, y a partir de sus precursores ariamos los isoprenoides fuera del cloroplasto, mientras que los pigmentos se arian igual pero en el cloroplasto.el colesterol igual pero se aria finalmente las especificas tmb fuera. Para hacer isoprenoides(que se consideran lipidos) por la via del mevalotano, para hacer IPP necesitamos lo mismo que para hacer un acido grasos, precursores energia y poder reductor.precursores:acetilcoa.se cogen 3 acetilcoa y tenemos un intermediario de 6, y perdemos un carbono.y se obtiene el hidroximetilglutarilcoa o AMGCoa(la de cetogenesis de cuerpos cetonicos).mevalonato tiene 6 c,que pierde un carbono...estan las reacciones en resumen.la HMGCoa sintasa es la mas importante en la que se consume poder reductor.y a partir del HMGCoa.(que hasta aqui era en citosol) en el RE se forma el mevalonato a partir de HMGCoa.de mevalonato puede acerse PPi o hacerse esteroles o phitoalexinas.

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