¡Descarga Test BF Practiques y más Exámenes en PDF de Biotecnología solo en Docsity!
PAC_Bloc2_Resum_Preguntes
Qüestió 1:
Els experiments amb microarrays orientats a la detecció de gens diferencialment expressats
b. No necessiten disposar de rèpliques ja que es mesuren simultàniament un gran nombre de gens i això
c. Necessiten disposar de rèpliques tècniques -múltiples mesures sobre un mateix individu- per garantir la
Qüestió 2:
Què és la "Gene Ontology" (GO)?
b. És l'organisme que s'encarrega de regular els noms dels gens, així com de controlar que les descripcions dels mateixos siguin correctes
Qüestió 3: Les dades de microarrays s'han de normalitzar perquè
b. Els valors d'expressió gènica no són continus sinó binaris (up/down) i per tant no podríem aplicar tests estadístics
c. Si no es normalitzen no és possible aplicar proves estadístiques que es basen en la suposició de normalitat
Qüestió 4: Quina daquestes afirmacions és falsa?
b. PROSITE és una base de dades de patrons
c. Babelomics és una base de dades d'anàlisi de microarrays
Quina és la finalitat de lexploració de les dades dexpressió de microarrays, per exemple mitjançant la tècnica de la PCA, abans de fer l anàlisis estadístic? a. Veure si hi troben gens amb un comportament molt estrany associat a algun grup de lexperiment.
Qüestió 6: Per què fem servir el p-valor ajustat en lloc del p-valor com criteri de selecció de gens?
Qüestió 7: Si en Babelomics, al fer lanàlisi de comparació entre classes, seleccionem en el test lopció de fold-change. Què estem fent?
Qüestió 8: Què és Gene Expression Omnibus (GEO)?
Qüestió 9: Donat aquest alineament per parelles:
GTACGTACG GTTC---C
Calculeu la puntuació entre les 2 seqüències. El sistema de puntuació és Match 3, Mismatch -1 i inserció open gap (A) = -3 extensió gap (B) = -1. El càlcul de la puntuació per gaps és W = A + B*(N-1), on N és la mida del gap.
c. 3
d. 6
Quina de les següents afirmacions és falsa: a. La diferencia fonamental entre els algoritmes dalineament òptim per parelles és haver afegit el terme cero a un algorisme.
c. No sapliquen mètodes heurístics per fer lalineament local per parelles.
d. Lalgorisme Needleman-Wunsch permet obtenir lalineament local per parelles òptim.
Qüestió 16: Quina de les següents afirmacions és falsa:
Qüestió 17: Indica quina seqüència compleix el patró CK-{A}-V-x(1, 2)-{ED}
c. KKSVCCE
d. CCVVAE
Qüestió 18: Quan hom parla de falsos positius en el procés d'anotar llocs d'unió de factors de transcripció, això vol dir:
Qüestió 19:
Quin patró podem extraure com resultat de l'alineament múltiple de seqüències dhomòlegs remots presentat aqui sota
a. Hi ha dos patrons amb la mateixa importància: F-X(0,19)-[STGE]-[KSR]-[YF]-G i G-[FI]-G-F-[IV]-[ST]-F
b. El patró més clar és: G-[FI]-G-F-[IV]-[ST]-F
c. El patró més clar és: G-x(2)-[IV]-[RYA]-V
d. No podem trobar cap patró, està molt poc conservat.
Atès el següent patró, indica quina seqüència NO el cumpleix? [LIVMFY]-{G}-[LIVMFYAC]-[DNQ]-[RKHQS]-[PST]-F-[LIVMFY]-[LIVMFYC]-x(0,3)- [LIVMFAH] a. MSLNRSFYM c. MALDRTFYMFYCH
b. LIMQHSFFYCL d. LGMQHSFFYIML
Qüestió 21: Quina és de les definicions següents creus que sajusta millor al terme patró?
Qüestió 22: El resultat dun alineament en format clustalw es resumeix en una seqüència coneguda com a "consens" que pot contenir una sèrie de símbols:
Qüestió 23: Un logo de seqüència ens mostra:
Qüestió 24: La base de dades de TransFac conté informació sobre:
Qüestió 25: Per a un conjunt de seqüències d'ADN el programa MEME genera:
