15/10/2025
METODI PER RISOLVERE STRUTTURE PROTEICHE
Banche dati ad accesso aperto. Per le strutture proteica la banca dati è PDB. È
diventata la banca dati per eccellenza nell’ambito delle proteine.
Il sito è il seguente: https://www.rcsb.org
È una pagina abbastanza complicata ma con una visione semplice. Ogni mese
c’è la molecola del mese (ogni mese vengono caricate un numero alto di
molecole).
PDB contiene strutture determinate in modo computazionale e in laboratorio
mediante cristallografia.
È riportata anche l’ultima proteina che sta determinata:
Oggi andiamo sulla pagina di presentazione di una qualsiasi proteina
Ogni protein ha Codice identificativo di 4 caratteri
- Emoglobina 1HHB
- Oggi i codici sono strani e non fanno più riferimento alla struttura della
proteina, dato che c’è ne sono tante
Come esempio cerchiamo “hemoglobin”. Andiamo su 2PGH:
