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Inbreeding: Conceito, Formas Extremas e Cálculo do Coeficiente de F, Notas de estudo de Genética
Este documento aborda o conceito de inbreeding, diferentes formas de gene flow e interbreeding, incluindo a autofertilização extremas. O texto também explica o cálculo do coeficiente de f de wright, utilizado para quantificar o grau de inbreeding em populações. Além disso, discute-se a importância de inbreeding em saúde e doenças, padrões de casamentos consanguíneos e sua distribuição global.
Tipologia: Notas de estudo
2013
1 / 24
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Inbreeding
Differences driven by patterns of
gene flow/ interbreeding…
- True when looking at different populations
- BUT doesn’t have to be “between populations”
- Related concept: inbreeding
- Breeding between closely related individuals
- Capacity for dispersal often limited
- Changes distribution of genotypes
An extreme form of inbreeding:
self-fertilization
Gen0 25% AA 50% Aa 25% aa
25% AA ¼ (50%) AA, ½ (50%) Aa, ¼ (50%)aa 25%aa
An extreme form of inbreeding:
self-fertilization
Gen0 25% AA 50% Aa 25% aa
25% AA ¼ (50%) AA, ½ (50%) Aa, ¼ (50%)aa 25%aa
Gen1 37.5% AA 25% Aa 37.5% aa
An extreme form of inbreeding:
self-fertilization
Gen0 25% AA 50% Aa 25% aa
25% AA ¼ (50%) AA, ½ (50%) Aa, ¼ (50%)aa 25%aa
Gen1 37.5% AA 25% Aa 37.5% aa Gen2 43.75% AA 12.5% Aa 43.75% aa
GenX 50% AA 0% Aa 50% aa
Every generation, heterozygote fraction goes down, and feeds alleles into homozygotes... creates “pure breeding” lines
Quantifying inbreeding...
- Inbreeding (even if not “selfing”) reduces % heterozygotes
- Feeds alleles into homozygotes
- Reduction in % heterozygotes from HW expected quantifies
inbreeding
F calculation example
- Studying a population with the following genotypes:
AA 553 Aa 294 aa 153
F calculation example
- Studying a population with the following genotypes:
AA 553 = 0.553 p(A) = 0. Aa 294 = 0.294 q(a) = 0. aa 153 = 0. N=
F calculation example
- Studying a population with the following genotypes:
AA 553 = 0.553 p(A) = 0. Aa 294 = 0.294 q(a) = 0. aa 153 = 0. N=1000 HW expectation AA: 0. F = (0.42-0.294)/0.42 Aa: 0. = 0.30 aa: 0.
F calculation practice
- Genotypes on Croatian islands:
AA 0. Aa 0. aa 0.
- Calculate F!
Croatia
F calculation practice
- Genotypes on Croatian islands:
AA 0.8136 p=0. Aa 0.1728 q=0. aa 0.
- F = (0.18-0.1728)/0.18 = 0.
Croatia
Inbreeding F vs FST
- Both based on same principle
- Seeing fewer heterozygotes than HW prediction
- Indicates “ non-random mating ”
- Symptom of “Wahlund effect”
- Apply inbreeding F
- Looking at individuals within one population
- Apply FST
- Quantifying difference between populations
Inbreeding around the world
Global distribution of marriages between couples related as second cousins or closer ( F ≥ 0_._ 0156).
… but isn’t inbreeding “ bad ” …?
- BY ITSELF, inbreeding only changes the distribution of alleles
among genotypes
- DOES NOT make any alleles “go away”
- Nonetheless, many know of