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Bioquímica bioinformatica , Manuais, Projetos, Pesquisas de Bioquímica

Universidade Federal de Uberlândia (UFU)Bioquímica

Sobre a molecuoa actin, sobre aula prática de bioinformatica

Tipologia: Manuais, Projetos, Pesquisas

2019

Compartilhado em 28/04/2024

thalia-abadia
thalia-abadia 🇧🇷

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BIOINFORMÁTICA
THALIA AMANDA ABADIA
21911QMI220
1. Escolher uma proteína que seja expressa em Homo sapiens e tenha sua sequência
depositada no National Center for Biotechnology Information (NCBI) -
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ou no Uniprot - https://www.uniprot.org/
a) Nome da proteína escolhida: ACTINA BETA [Homo sapiens]
b) Código de acesso no NCBI e no Uniprot: KAI4012806.1
c) Sequência no formato FASTA: >KAI4012806.1 actina beta [Homo sapiens]
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d) Número de resíduos de aminoácidos: 334 aa
2. Estrutura secundária pelo Psipred - http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/
a) Arranjo predominante (alfa-hélice ou conformação-beta):
3. Estrutura terciária pelo AlphaFold - https://alphafold.ebi.ac.uk/ ou Protein Data
Bank (PDB) - http://www.rcsb.org/pdb/
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BIOINFORMÁTICA

THALIA AMANDA ABADIA

21911QMI

1. Escolher uma proteína que seja expressa em Homo sapiens e tenha sua sequência depositada no National Center for Biotechnology Information (NCBI) - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ou no Uniprot - https://www.uniprot.org/ a) Nome da proteína escolhida: ACTINA BETA [Homo sapiens] b) Código de acesso no NCBI e no Uniprot: KAI4012806. c) Sequência no formato FASTA: >KAI4012806.1 actina beta [Homo sapiens] MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSK RGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETF NTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILT ERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQ PSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKV GVFPA d) Número de resíduos de aminoácidos: 334 aa 2. Estrutura secundária pelo Psipred - http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/ a) Arranjo predominante (alfa-hélice ou conformação-beta): 3. Estrutura terciária pelo AlphaFold - https://alphafold.ebi.ac.uk/ ou Protein Data Bank (PDB) - http://www.rcsb.org/pdb/

a) Código de acesso: P b) Função biológica: A actina é uma proteína altamente conservada que se polimeriza para produzir filamentos que formam redes reticuladas no citoplasma das células ( PubMed:29581253 ). A actina existe nas formas monomérica (G-actina) e polimérica (F-actina), ambas as formas desempenhando funções essenciais, como motilidade e contração celular ( PubMed:29581253 ). Além de seu papel no citoesqueleto citoplasmático, a actina G e F também se localiza no núcleo e regula a transcrição gênica e a motilidade e o reparo do DNA danificado ( PubMed:29925947 ). Parte do filamento ACTR1A/ACTB em torno do qual o complexo de dinactina é construído. O complexo multiproteico de dinactina ativa o motor molecular dineína para transporte ultraprocessivo ao longo dos microtúbulos (por semelhança). c) Na estrutura 3D, copiar a imagem em qualquer um dos ângulos utilizando o Prt Sc:

4. Sítios e domínios ligantes pelo ScanPROSITE - https://prosite.expasy.org/scanprosite/ a) Indicar pelo menos um sítio ou domínio, com resíduo ou intervalo de aminoácidos: