Universidade Federal do Tocantins
Plano de Curso
COLEGIADO
Ciências Exatas e Biotecnológicas
CURSO
DISCIPLINA
Engenharia de Bioprocessos
Bioinformática – 2013/1ºsemestre
PROFESSOR RESPONSÁVEL
Luiz Carlos Bertucci Barbosa
CH TEÓRICA
CH PRÁTICA
CH TOTAL
30h
30h
60h
OBJETIVO GERAL
Fazer com que o aluno compreenda as principais abordagens e técnicas de análise in silico de ácidos nucleicos e proteínas.
OBJETIVOS ESPECÍFICOS
1) Compreender as principais abordagens de alinhamento de sequências e busca em bancos de dados biológicos;
2) Entender os diferentes tipos de sequenciamento de genomas, bem como as etapas de anotação gênica, montagem e análise
comparativa;
3) Entender as principais abordagens e metodologias de análise proteômica e modelagem molecular de proteínas;
4) Compreender os principais princípios da filogenia molecular.
EMENTA
Algoritmos e abordagens de alinhamento global e local. Busca e análise de informações em bancos de dados biológicos.
Abordagens de sequenciamento e análise de dados gerados por plataformas de alta processividade. Predição gênica
computacional. Montagem de genomas. Genômica Comparativa. Análise proteômica. Modelagem molecular de proteínas.
Evolução molecular e análise filogenética.
CONTEÚDO PROGRAMÁTICO
- Abordagens de alinhamento e bancos de dados: pretende discutir os conceitos de alinhamento local e global de sequências
biológicas e apresentar os principais bancos de dados biológicos para aquisição e análise de dados;
- Genômica: discutir as principais etapas da genômica, incluindo sequenciamento em plataformas de nova geração, predição
gênica, anotação e montagem de genomas e análise comparativa;
- Proteômica: discutir os principais modos de aquisição e análise de dados proteômicos, assim como a técnica de modelagem
molecular de proteínas;
- Filogenia molecular: discutir o processo de evolução molecular, bem como os principais métodos de análise filogenética
utilizando dados moleculares.
METODOLOGIA E PROCEDIMENTOS DE ENSINO
- Estratégia de ensino: aulas expositivas, realização de trabalhos, apresentação de seminários e resoluções de exercícios;
- Recursos utilizados: projetor multimídia, quadro branco, caneta e sala de informática.
ATIVIDADES INTERDISCIPLINARES
- Desenvolvimento de trabalhos que possam contribuir com o desenvolvimento de outras disciplinas que envolvam bioinformática,
algoritmos e abordagens computacionais;
- Participar em projetos de pesquisa que envolvam aplicações na área de bioinformática e técnicas computacionais.
PROCEDIMENTOS DE AVALIAÇÃO
- Avaliações individuais escritas: serão aplicadas duas avaliações sobre os conteúdos abordados durante o curso. As provas terão
pontuação máxima de 10 pontos cada uma.
- Trabalho: será cobrado um trabalho no meio do curso. O trabalho terá pontuação máxima de 10 pontos.
- Seminários: será cobrado um seminário por aluno ao final do curso. Os conteúdos dos seminários serão baseados em artigos
científicos publicados em revistas renomadas na área de bioinformática. O seminário terá pontuação máxima de 10 pontos.
- Cálculo para obtenção da nota final (N):
P1: nota da primeira prova;
P2: nota da segunda prova;
P = (P1+P2)/2
T: nota do trabalho;
S: nota do seminário;
W = (T+S)/2
N = ((P x 8.0) + (W x 2.0)) / 10.0
BIBLIOGRAFIA BÁSICA
1. LESK, A. M. Introduction to Bioinformatics, 2nd Edition, Oxford University Press, 2002, 376p.
2. AUGEN, J. Bioinformatics in the Post-Genomic Era, Addison-Wesley, 2004, 408p.
3. JONES, N. C.; PEVZNER, P. A. Introduction to Bioinformatics algorithms, The MIT Press, 2004, 456p.
BIBLIOGRAFIA COMPLEMENTAR
Periódicos relacionados:
- Bioinformatics;
- BMC Bioinformatics;
- Nucleic Acid Res;
- Plos One;
- Nature;
- Science.
